52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2499 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2499  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  182  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000616524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2136  hypothetical protein  79.78 
 
 		 89 aa  157  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.470707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3957  hypothetical protein  61.8 
 
 		 89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000131135  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1341  hypothetical protein  59.55 
 
 		 89 aa  121  4e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0193  hypothetical protein  56.18 
 
 		 89 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.632607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1330  hypothetical protein  53.93 
 
 		 89 aa  113  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.520904  normal  0.12078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2567  hypothetical protein  56.18 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0264  hypothetical protein  59.09 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6036  hypothetical protein  51.19 
 
 		 84 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2659  hypothetical protein  56.63 
 
 		 85 aa  98.6  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0463973  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1017  hypothetical protein  49.44 
 
 		 88 aa  93.2  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2375  hypothetical protein  50.56 
 
 		 88 aa  92.4  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0270  hypothetical protein  48.31 
 
 		 88 aa  92  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0567  hypothetical protein  47.19 
 
 		 101 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.360241  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1409  hypothetical protein  44.94 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.209175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0662  hypothetical protein  38.64 
 
 		 89 aa  76.6  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1649  hypothetical protein  44.32 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1386  hypothetical protein  64.71 
 
 		 64 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0747  hypothetical protein  40.24 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.144242  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2719  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.207392  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4195  hypothetical protein  43.18 
 
 		 86 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0924  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0558  hypothetical protein  41.46 
 
 		 85 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00365448  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1478  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1901  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2467  hypothetical protein  40.91 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2522  hypothetical protein  44.94 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2428  hypothetical protein  39.33 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1284  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1402  hypothetical protein  45.59 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1212  hypothetical protein  40.91 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0239  hypothetical protein  32.95 
 
 		 86 aa  62  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1141  hypothetical protein  43.84 
 
 		 82 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.930521  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1992  hypothetical protein  37.5 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0295579  normal  0.0414259 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0902  hypothetical protein  38.2 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.959695  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00620  predicted transcriptional regulator  40.79 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0905  hypothetical protein  36.99 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.844945  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1067  hypothetical protein  39.73 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1072  hypothetical protein  37.14 
 
 		 401 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175611  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0362  hypothetical protein  35 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000001627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0618  hypothetical protein  37.8 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1180  hypothetical protein  34.15 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.211605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1098  hypothetical protein  38.36 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1385  hypothetical protein  53.85 
 
 		 53 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0548  hypothetical protein  34.88 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.000621957  normal  0.212839 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02920  hypothetical protein  34.92 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00324963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0185  hypothetical protein  34.88 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1245  hypothetical protein  41.38 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.197075  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1695  hypothetical protein  31.51 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234536  normal  0.355641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1092  hypothetical protein  35.71 
 
 		 74 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.482851  normal  0.103646 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0673  hypothetical protein  37.25 
 
 		 54 aa  40.4  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1151  hypothetical protein  30.14 
 
 		 77 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>