More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2600 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  77.47 
 
 
398 aa  638    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  77.22 
 
 
397 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  100 
 
 
397 aa  820    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  80.3 
 
 
398 aa  666    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  75.95 
 
 
397 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  75.19 
 
 
397 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  72.91 
 
 
396 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  65.82 
 
 
396 aa  554  1e-157  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000042706  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  62.63 
 
 
395 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  63.29 
 
 
397 aa  524  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  54.55 
 
 
397 aa  463  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  52.67 
 
 
396 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  53.08 
 
 
393 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  54.1 
 
 
393 aa  435  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  52.93 
 
 
395 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  48.86 
 
 
397 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  48.06 
 
 
394 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  47.55 
 
 
393 aa  381  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  46.03 
 
 
396 aa  371  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277317  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  47.8 
 
 
461 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  44.92 
 
 
395 aa  362  8e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  44.76 
 
 
398 aa  358  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000726355  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  43.6 
 
 
398 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  48.72 
 
 
398 aa  335  7e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  48.47 
 
 
398 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  48.95 
 
 
400 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  43.08 
 
 
395 aa  315  6e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  39.84 
 
 
394 aa  303  4.0000000000000003e-81  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  38.93 
 
 
393 aa  293  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  37.2 
 
 
396 aa  280  4e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  39.47 
 
 
393 aa  279  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  40.31 
 
 
393 aa  278  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  37.29 
 
 
405 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  35.38 
 
 
404 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  34.35 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  32.15 
 
 
403 aa  194  3e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  33.96 
 
 
389 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  33.7 
 
 
389 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  34.42 
 
 
393 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  32.13 
 
 
389 aa  188  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  33.16 
 
 
389 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  31.63 
 
 
375 aa  184  3e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2112  aspartate aminotransferase  33.51 
 
 
396 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000221711  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  31.33 
 
 
375 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  33.25 
 
 
375 aa  181  2e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  31.63 
 
 
375 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1188  aminotransferase  32.99 
 
 
404 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0134588  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  32.12 
 
 
389 aa  176  5e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2545  aspartate aminotransferase  32.88 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.112284  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  30.67 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1134  aspartate aminotransferase  32.07 
 
 
387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338962  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  30.12 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  30.12 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0257  aminotransferase class I and II  33 
 
 
402 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  31 
 
 
395 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000959703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0755  aspartate aminotransferase  31.43 
 
 
395 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  31 
 
 
395 aa  172  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0853  aspartate aminotransferase  31.17 
 
 
389 aa  172  1e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1220  putative aspartate transaminase  33.33 
 
 
412 aa  172  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000208657 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  34.76 
 
 
396 aa  172  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2798  aminotransferase class I and II  34.88 
 
 
396 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1250  aspartate aminotransferase  31.44 
 
 
389 aa  171  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000188564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1470  aspartate aminotransferase  31.81 
 
 
395 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  31.96 
 
 
390 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  30.92 
 
 
385 aa  171  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  33.07 
 
 
401 aa  170  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  32.53 
 
 
397 aa  170  4e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  32.35 
 
 
392 aa  170  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1268  aspartate aminotransferase  31.54 
 
 
395 aa  170  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.65327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0783  aspartate aminotransferase  30.89 
 
 
389 aa  169  7e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000329149  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2202  aspartate aminotransferase  31.69 
 
 
393 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0003  aminotransferase, class I and II  32.55 
 
 
386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.987312  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  32.51 
 
 
388 aa  166  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5177  class I/II aminotransferase  30.16 
 
 
388 aa  165  1.0000000000000001e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.530188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4358  aminotransferase class I and II  32.05 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1627  aminotransferase, class I and II  32.69 
 
 
393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.703964 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2501  aminotransferase, class I and II  31.18 
 
 
397 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000255264  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  30.31 
 
 
375 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  31.88 
 
 
389 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3512  hypothetical protein  32.3 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1138  aminotransferase, class I and II  29.32 
 
 
395 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.025669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1066  aminotransferase, class I and II  30.49 
 
 
401 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  33.8 
 
 
404 aa  162  7e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  30.35 
 
 
390 aa  162  7e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4527  aminotransferase class I and II  30.49 
 
 
415 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  32.61 
 
 
367 aa  161  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0003  aminotransferase, class I and II  31.85 
 
 
385 aa  161  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  30.2 
 
 
397 aa  160  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000744146  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.39 
 
 
377 aa  160  3e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 
377 aa  160  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  30.39 
 
 
407 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4633  hypothetical protein  31.43 
 
 
396 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5033  hypothetical protein  30.75 
 
 
396 aa  160  4e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.145667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5040  hypothetical protein  30.91 
 
 
396 aa  160  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0566  aspartate aminotransferase  30.56 
 
 
402 aa  159  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>