90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3063 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3063  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  520  1e-146  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000585579  normal  0.0470868 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1777  methyltransferase type 11  41.96 
 
 		 235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0314137  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7608  hypothetical protein  36.9 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.000430811  normal  0.301111 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2380  methyltransferase type 11  42.52 
 
 		 255 aa  148  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.311987 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0094  methyltransferase type 11  37.65 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.116481 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0509  methyltransferase type 11  38.53 
 
 		 257 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.16372  normal  0.0246077 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0070  methyltransferase type 11  39.56 
 
 		 254 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0467  hypothetical protein  38.22 
 
 		 246 aa  141  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0613  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.168434  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0374  hypothetical protein  37.33 
 
 		 246 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1658  methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.356939 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0994  methyltransferase type 11  35.54 
 
 		 259 aa  136  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.415921  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3269  hypothetical protein  37.08 
 
 		 264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4035  hypothetical protein  33.47 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1986  hypothetical protein  34.34 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0447  Methyltransferase type 11  36.65 
 
 		 246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0379  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 277 aa  128  9.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2551  methyltransferase type 11  34.41 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3874  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.269939  normal  0.0852061 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2018  methyltransferase type 11  38.43 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2509  methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.120147  normal  0.163861 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2732  Methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413837  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3581  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2437  Methyltransferase type 11  34.6 
 
 		 250 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1579  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 252 aa  125  5e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168817 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2064  methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0394236  normal  0.0109079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1911  hypothetical protein  34.45 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0916  methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0058  putative SAM-dependent methyltransferase protein  30.86 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1899  methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.749926 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  33.88 
 
 		 258 aa  117  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0431  methyltransferase type 11  32 
 
 		 257 aa  112  8.000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.336271 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0970  hypothetical protein  31.97 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2295  hypothetical protein  31.97 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360023  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2938  conserved hypohtetical protein  33.33 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0406539  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2205  hypothetical protein  31.39 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2090  hypothetical protein  33.48 
 
 		 248 aa  104  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1043  hypothetical protein  31.05 
 
 		 253 aa  102  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3814  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 260 aa  96.3  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1286  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00312409  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0805  methyltransferase type 11  28.65 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.835113  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1257  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00176824  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0423  putative methyltransferase  27.94 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.209763  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.78 
 
 		 265 aa  51.6  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1764  methyltransferase  27.94 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0557  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0764  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1601  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2789  hypothetical protein  28.3 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00141234  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1274  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0595  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1467  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1497  hypothetical protein  27.78 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03212  hypothetical protein  25.22 
 
 		 251 aa  49.7  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1252  hypothetical protein  27.91 
 
 		 289 aa  50.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2872  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 		 287 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00483361  normal  0.354275 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1175  methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 270 aa  49.3  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000783857  normal  0.143083 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2034  methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 270 aa  48.9  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0620207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0842  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1163  methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 270 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0143221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002771  SAM-dependent methyltransferase  24.88 
 
 		 248 aa  48.5  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.531144  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  23.91 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4428  hypothetical protein  25.93 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000816138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0869  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.292642  normal  0.353512 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3134  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1827  hypothetical protein  24.67 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2040  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2207  methyltransferase type 11  27.44 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000439917  normal  0.236721 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1023  methyltransferase type 11  26.43 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.386932  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1830  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3118  methyltransferase type 12  21.99 
 
 		 246 aa  43.9  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.0061861  hitchhiker  0.0013011 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0592  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.86 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1732  Methyltransferase type 11  26.46 
 
 		 262 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0169099  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1594  generic methyl-transferase  25.68 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.86 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  32.95 
 
 		 266 aa  43.1  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3781  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 194 aa  43.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 331 aa  42.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.71 
 
 		 253 aa  43.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.09 
 
 		 256 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1514  hypothetical protein  26.98 
 
 		 257 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  47.92 
 
 		 256 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  30.61 
 
 		 207 aa  42.7  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  47.92 
 
 		 256 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.86 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  26.28 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.86 
 
 		 256 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 255 aa  42  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>