282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1189 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1189  amino acid/peptide transporter  100 
 
 		 501 aa  977    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.500547 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4508  amino acid/peptide transporter  48.35 
 
 		 507 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0182547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2992  amino acid/peptide transporter  45.8 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0360187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1102  amino acid/peptide transporter  46 
 
 		 546 aa  422  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3089  amino acid/peptide transporter  45.8 
 
 		 516 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000368989  normal  0.0911268 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1277  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  46.49 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2910  amino acid/peptide transporter  45.8 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.380758  normal  0.476442 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1117  amino acid/peptide transporter  45.4 
 
 		 523 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1207  amino acid/peptide transporter  45.4 
 
 		 517 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0390922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3023  amino acid/peptide transporter  48.67 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1174  amino acid/peptide transporter  45.33 
 
 		 521 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211879  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1255  amino acid/peptide transporter  48.67 
 
 		 551 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2221  amino acid/peptide transporter  49.28 
 
 		 551 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2907  amino acid/peptide transporter  48.67 
 
 		 500 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.464233  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3183  amino acid/peptide transporter  45.51 
 
 		 517 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0376329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1177  proton-dependent oligopeptide transporter (POT) family protein  45.6 
 
 		 506 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.980946  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0348  amino acid/peptide transporter  48.47 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.781642  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0382  amino acid/peptide transporter  48.47 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1531  amino acid/peptide transporter  48.47 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1721  amino acid/peptide transporter  48.47 
 
 		 500 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97984  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3261  amino acid/peptide transporter  47.03 
 
 		 506 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0234728 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0113  amino acid/peptide transporter  47.17 
 
 		 506 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0759  major facilitator superfamily peptide/H(+)symporter  46.81 
 
 		 513 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4728  amino acid/peptide transporter  47.86 
 
 		 506 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5316  amino acid/peptide transporter  47.23 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.179594  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5544  amino acid/peptide transporter  47.23 
 
 		 506 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4868  amino acid/peptide transporter  47.66 
 
 		 507 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5415  amino acid/peptide transporter  47.66 
 
 		 506 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4440  amino acid/peptide transporter  46.02 
 
 		 513 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0623  amino acid/peptide transporter  35.52 
 
 		 495 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000100169  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1525  di-/tripeptide transporter  36.05 
 
 		 528 aa  298  2e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0251804  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0652  tripeptide permease TppB  35.85 
 
 		 504 aa  294  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.068993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3785  inner membrane transporter YhiP  35.28 
 
 		 490 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0323752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3785  inner membrane transporter YhiP  35.23 
 
 		 489 aa  291  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3826  inner membrane transporter YhiP  35.03 
 
 		 489 aa  290  6e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03345  predicted transporter  35.03 
 
 		 489 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.199197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03298  hypothetical protein  35.03 
 
 		 489 aa  289  7e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.240113  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3978  inner membrane transporter YhiP  35.03 
 
 		 489 aa  289  7e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0219  amino acid/peptide transporter  35.03 
 
 		 489 aa  289  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0220  inner membrane transporter YhiP  35.03 
 
 		 489 aa  289  1e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3696  inner membrane transporter YhiP  35.03 
 
 		 489 aa  289  1e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4843  inner membrane transporter YhiP  34.64 
 
 		 489 aa  286  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2318  putative tripeptide transporter permease  36 
 
 		 506 aa  286  5e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2851  hypothetical protein  35.97 
 
 		 500 aa  286  8e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3795  inner membrane transporter YhiP  35.28 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3862  inner membrane transporter YhiP  35.28 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.31175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3905  inner membrane transporter YhiP  35.28 
 
 		 490 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1722  putative tripeptide transporter permease  34.91 
 
 		 501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00217506  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1562  putative tripeptide transporter permease  34.91 
 
 		 501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0485322  normal  0.102163 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1549  putative tripeptide transporter permease  34.91 
 
 		 501 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.507438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3966  inner membrane transporter YhiP  35.08 
 
 		 490 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.826151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1622  putative tripeptide transporter permease  34.91 
 
 		 501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.185719  normal  0.452221 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1890  putative tripeptide transporter permease  34.91 
 
 		 501 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0509  putative tripeptide transporter permease  36.34 
 
 		 514 aa  284  3.0000000000000004e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2720  hypothetical protein  35.07 
 
 		 500 aa  283  6.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2017  putative tripeptide transporter permease  35.79 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.617443  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1814  putative tripeptide transporter permease  35.83 
 
 		 502 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00000684589  decreased coverage  0.000347242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1844  putative tripeptide transporter permease  34.51 
 
 		 500 aa  279  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345542  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1824  putative tripeptide transporter permease  34.51 
 
 		 500 aa  279  8e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1710  putative tripeptide transporter permease  33.96 
 
 		 500 aa  279  9e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0064967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01604  putative tripeptide transporter permease  34.51 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00542523  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2006  amino acid/peptide transporter  34.51 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0749107  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1995  putative tripeptide transporter permease  34.51 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46141  normal  0.0309863 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01594  hypothetical protein  34.51 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00471162  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2346  putative tripeptide transporter permease  34.51 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0609489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1565  putative tripeptide transporter permease  34.51 
 
 		 500 aa  278  1e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2548  putative tripeptide transporter permease  34.79 
 
 		 488 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1886  putative tripeptide transporter permease  34.55 
 
 		 511 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.348979  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1778  putative tripeptide transporter permease  34.55 
 
 		 501 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2233  putative tripeptide transporter permease  34.59 
 
 		 506 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000348133 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0945  amino acid/peptide transporter  28.54 
 
 		 534 aa  189  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.985856  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0770  inner membrane transporter YbgH  30.02 
 
 		 493 aa  183  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0818  inner membrane transporter YbgH  29.82 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0867  inner membrane transporter YbgH  29.82 
 
 		 493 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0832  inner membrane transporter YbgH  29.82 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  hitchhiker  0.00189799 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0757  inner membrane transporter YbgH  29.82 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5954  hypothetical protein  29.8 
 
 		 509 aa  181  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0911535  normal  0.0715474 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1585  amino acid/peptide transporter  27.11 
 
 		 539 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0799  amino acid/peptide transporter  28.68 
 
 		 493 aa  176  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.256216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2795  amino acid/peptide transporter  26.92 
 
 		 539 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.274379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1551  amino acid/peptide transporter  26.92 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1555  amino acid/peptide transporter  26.92 
 
 		 539 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3303  amino acid/peptide transporter  25.98 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00669  predicted transporter  28.49 
 
 		 493 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00658  hypothetical protein  28.49 
 
 		 493 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0724  amino acid/peptide transporter  28.49 
 
 		 493 aa  172  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.470702  normal  0.430255 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0955  amino acid/peptide transporter  29.08 
 
 		 510 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334898  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0734  amino acid/peptide transporter  28.29 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4484  amino acid/peptide transporter  26.69 
 
 		 516 aa  172  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0470977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2946  amino acid/peptide transporter  28.35 
 
 		 493 aa  172  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.701623  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2927  amino acid/peptide transporter  28.29 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0757  amino acid/peptide transporter  28.29 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0626  amino acid/peptide transporter  28.09 
 
 		 493 aa  169  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3766  amino acid/peptide transporter  30.85 
 
 		 482 aa  169  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000840749  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1074  di-tripeptide ABC transporter membrane protein  28.41 
 
 		 510 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1505  amino acid/peptide transporter  28.24 
 
 		 444 aa  166  9e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000267924 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2849  amino acid/peptide transporter  29.79 
 
 		 498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0954  amino acid/peptide transporter  27.59 
 
 		 527 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.935259  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04001  predicted transporter  28.93 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4371  amino acid/peptide transporter  28.93 
 
 		 485 aa  164  4.0000000000000004e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.113976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>