More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4066 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  100 
 
 
248 aa  489  1e-137  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  69.12 
 
 
232 aa  306  2e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  68.83 
 
 
231 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  68.83 
 
 
231 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  68.83 
 
 
231 aa  298  4e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  63.72 
 
 
236 aa  290  1e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  58.4 
 
 
240 aa  273  2e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  55.17 
 
 
239 aa  225  5e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  46.15 
 
 
268 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  48.13 
 
 
277 aa  182  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.42 
 
 
286 aa  182  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  43.62 
 
 
363 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  47.62 
 
 
237 aa  179  3e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  47.14 
 
 
237 aa  178  8e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  41.78 
 
 
227 aa  174  2e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  41.13 
 
 
249 aa  172  3e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  37.08 
 
 
235 aa  162  5e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  43.9 
 
 
218 aa  154  1e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  42.04 
 
 
256 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  44.02 
 
 
221 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  40.08 
 
 
259 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.16146e-09 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  43.28 
 
 
220 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  44.02 
 
 
221 aa  147  1e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  41.29 
 
 
220 aa  147  2e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  40.89 
 
 
219 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  40.89 
 
 
219 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  41.87 
 
 
219 aa  146  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  40.89 
 
 
219 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  40.89 
 
 
219 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  40.89 
 
 
219 aa  146  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.49 
 
 
216 aa  145  5e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  39.8 
 
 
221 aa  145  8e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  40.8 
 
 
221 aa  144  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  41.03 
 
 
213 aa  143  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  43.52 
 
 
216 aa  141  7e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  43.56 
 
 
220 aa  141  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  43.56 
 
 
220 aa  141  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  43.56 
 
 
220 aa  141  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  37.68 
 
 
247 aa  140  2e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.15 
 
 
209 aa  140  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  44.26 
 
 
222 aa  139  5e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  40.51 
 
 
219 aa  138  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  40.51 
 
 
219 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  40.51 
 
 
219 aa  138  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  40.51 
 
 
219 aa  138  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  40.51 
 
 
219 aa  138  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  40.51 
 
 
219 aa  138  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  44.44 
 
 
234 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  40.8 
 
 
221 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  38.97 
 
 
219 aa  135  5e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  36.63 
 
 
212 aa  135  6e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  38.97 
 
 
219 aa  135  6e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  38.97 
 
 
219 aa  135  7e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.44 
 
 
458 aa  135  8e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  35.81 
 
 
211 aa  134  1e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  36.28 
 
 
220 aa  134  1e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  37.75 
 
 
217 aa  134  1e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  39.69 
 
 
218 aa  133  2e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  41 
 
 
216 aa  134  2e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0208  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.17 
 
 
226 aa  133  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  40.5 
 
 
218 aa  132  4e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  38.81 
 
 
232 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  42.19 
 
 
230 aa  131  8e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  41.77 
 
 
230 aa  130  2e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.16 
 
 
213 aa  129  4e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  36.79 
 
 
228 aa  129  4e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0179  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.71 
 
 
229 aa  129  4e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.843652  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  36.84 
 
 
237 aa  127  1e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  41.38 
 
 
245 aa  128  1e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  33.17 
 
 
215 aa  127  1e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  36.71 
 
 
253 aa  127  2e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8388  SNARE associated Golgi protein  34.96 
 
 
244 aa  127  2e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  37.7 
 
 
224 aa  126  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  32.67 
 
 
215 aa  126  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  40.8 
 
 
216 aa  126  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  40.21 
 
 
222 aa  125  4e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  35.9 
 
 
213 aa  125  5e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  34.02 
 
 
246 aa  125  8e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.61 
 
 
201 aa  125  8e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 
215 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  39.18 
 
 
214 aa  124  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  33 
 
 
218 aa  123  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  40.2 
 
 
213 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  40.62 
 
 
244 aa  122  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  37.95 
 
 
215 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  1.42104e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  38.71 
 
 
213 aa  122  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1552  DedA family membrane protein  40.19 
 
 
216 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.487737  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  37.95 
 
 
215 aa  122  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  39.04 
 
 
227 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0392  DedA family protein  37.38 
 
 
241 aa  122  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  36.96 
 
 
229 aa  122  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1543  DedA family protein  40.83 
 
 
202 aa  121  9e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.201859  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 
215 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  38.61 
 
 
216 aa  121  1e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  39.59 
 
 
223 aa  121  1e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0602  SNARE associated Golgi protein  37.04 
 
 
279 aa  121  1e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.688276 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0632  DedA family protein  40.24 
 
 
202 aa  120  2e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  35.23 
 
 
219 aa  119  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  35.38 
 
 
218 aa  119  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  34.87 
 
 
218 aa  119  4e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>