More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3484 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3484  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 438 aa  852    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2835  major facilitator transporter  62.78 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0409  major facilitator transporter  46.81 
 
 		 398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2149  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 443 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00239226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3664  major facilitator transporter  43.16 
 
 		 437 aa  332  9e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596983 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4127  major facilitator superfamily transporter  43.31 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3724  major facilitator superfamily transporter  43.66 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.517279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3651  major facilitator transporter  43.66 
 
 		 426 aa  322  7e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1676  major facilitator superfamily MFS_1  44.72 
 
 		 423 aa  318  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1609  major facilitator superfamily MFS_1  44.04 
 
 		 448 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1615  major facilitator transporter  44.31 
 
 		 442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000129753  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2530  major facilitator transporter  44.52 
 
 		 447 aa  306  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.906082  normal  0.441039 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1523  major facilitator superfamily MFS_1  43.2 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0583508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4727  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 		 441 aa  286  4e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25470  nitrate/nitrite transporter  41.32 
 
 		 442 aa  286  5e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.143823  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14630  sugar phosphate permease  47.92 
 
 		 446 aa  283  3.0000000000000004e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.145959  normal  0.715479 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2212  major facilitator superfamily MFS_1  43.54 
 
 		 486 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.189935  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5829  major facilitator superfamily MFS_1  43.21 
 
 		 439 aa  268  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.50819  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1835  major facilitator superfamily MFS_1  40.66 
 
 		 423 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.105556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0303  major facilitator superfamily MFS_1  38.42 
 
 		 447 aa  249  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.0623146 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21890  nitrate/nitrite transporter  43.06 
 
 		 460 aa  245  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392682  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0829  major facilitator superfamily MFS_1  37.56 
 
 		 430 aa  230  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.145147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2905  putative transmembrane transport protein  33.42 
 
 		 430 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5436  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 411 aa  179  5.999999999999999e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1290  major facilitator superfamily MFS_1  31.73 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2665  major facilitator superfamily MFS_1  29.47 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.6609  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2603  major facilitator superfamily MFS_1  29.87 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0706  hypothetical protein  26.6 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1355  hypothetical protein  24.88 
 
 		 430 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1359  hypothetical protein  24.88 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0688  hypothetical protein  26.28 
 
 		 430 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  26.85 
 
 		 421 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5821  major facilitator superfamily permease  31.65 
 
 		 432 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836569  normal  0.302155 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1524  major facilitator transporter  29.51 
 
 		 434 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.472365  normal  0.129065 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0529  transporter, MFS superfamily  29.11 
 
 		 428 aa  105  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.027512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0383  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 439 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000153779  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1663  major facilitator family transporter  28.84 
 
 		 428 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.106817  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1288  hypothetical protein  29.89 
 
 		 432 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1289  hypothetical protein  29.89 
 
 		 432 aa  103  7e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3345  major facilitator transporter  27.48 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.231985 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2159  transporter, MFS superfamily  23.78 
 
 		 452 aa  102  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0019  major facilitator family transporter  23.53 
 
 		 452 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2516  major facilitator superfamily MFS_1  24.21 
 
 		 446 aa  100  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000164401  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 434 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  24.86 
 
 		 445 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1599  major facilitator transporter  26.23 
 
 		 428 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0862698 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1860  hypothetical protein  25.26 
 
 		 426 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 434 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.63 
 
 		 423 aa  96.3  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1855  hypothetical protein  24.49 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0271  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1311  major facilitator family transporter  26.68 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00377695  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  26.36 
 
 		 423 aa  92.8  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0661  hypothetical protein  24.61 
 
 		 431 aa  91.3  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0707  hypothetical protein  28.29 
 
 		 425 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0689  hypothetical protein  35.33 
 
 		 425 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  28.94 
 
 		 414 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0604  hypothetical protein  31.72 
 
 		 422 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0585  hypothetical protein  31.72 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0257  major facilitator transporter  25.69 
 
 		 417 aa  87.4  5e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 432 aa  87.4  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0101  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 434 aa  85.9  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.467477  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0680  major facilitator family transporter  25.24 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0645  hypothetical protein  23.7 
 
 		 431 aa  85.1  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1989  major facilitator transporter  27.89 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1497  transporter, MFS superfamily  24.82 
 
 		 443 aa  85.1  0.000000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0203  major facilitator transporter  31.87 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1898  major facilitator transporter  26.05 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0191579  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0056  major facilitator superfamily MFS_1  27.82 
 
 		 411 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3355  hypothetical protein  31.42 
 
 		 420 aa  82.8  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40936  normal  0.967492 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1022  intraphagosomal amino acid transporter (Pht) family protein  23.45 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1564  transporter, MFS superfamily  25.95 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0018  major facilitator family transporter  24.09 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2160  transporter, MFS superfamily  24.09 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2425  major facilitator transporter  29.02 
 
 		 427 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.410851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1152  transporter, MFS superfamily  23.18 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.309541  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  25.72 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2317  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 		 392 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.85922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0097  major facilitator superfamily MFS_1  24.31 
 
 		 415 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0178467  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2103  hypothetical protein  25.39 
 
 		 420 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.36255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  28.89 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2438  hypothetical protein  23.74 
 
 		 410 aa  77.4  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1892  major facilitator superfamily MFS_1  31.07 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0079  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 425 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28688e-24 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  25.77 
 
 		 384 aa  76.6  0.0000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1416  hypothetical protein  22.97 
 
 		 429 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  22.45 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  34.93 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2584  hypothetical protein  22.96 
 
 		 410 aa  75.5  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  22.45 
 
 		 427 aa  74.7  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  32.61 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  29.31 
 
 		 439 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 440 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0113  major facilitator superfamily transporter  24.69 
 
 		 407 aa  72.8  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2630  major facilitator transporter  28.48 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 439 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1041  major facilitator family transporter  29.34 
 
 		 432 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.466743  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0972  transporter, MFS superfamily  29.34 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0128103  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>