More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2882 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2882  Histidine kinase  100 
 
 
413 aa  810  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00350907  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4605  histidine kinase  42.34 
 
 
403 aa  252  8e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.506334 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  43.45 
 
 
364 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2483  histidine kinase  42.34 
 
 
401 aa  183  4e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0411509  normal  0.969327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  35.8 
 
 
433 aa  174  3e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4148  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
434 aa  164  2e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3812  histidine kinase  36.58 
 
 
402 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00313261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00300  signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
414 aa  144  4e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2580  histidine kinase  39.48 
 
 
422 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.880661  normal  0.0603036 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  38.43 
 
 
407 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  39.61 
 
 
397 aa  137  3e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18540  signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
458 aa  133  6e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1070  histidine kinase  37.74 
 
 
430 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04040  signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
401 aa  126  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.631107  normal  0.0622315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0826  Histidine kinase  38.81 
 
 
412 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
411 aa  121  2e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.342445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.05 
 
 
508 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0276  Histidine kinase  30.96 
 
 
387 aa  120  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1050  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
490 aa  118  2e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0890149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0347  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
442 aa  117  4e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0286068  normal  0.880673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3542  histidine kinase  31.14 
 
 
431 aa  116  7e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.787824 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4921  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
412 aa  115  1e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0892179  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29930  signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
451 aa  112  8e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.293273  normal  0.79172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0486  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
406 aa  112  1e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.569431  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7345  histidine kinase  35.19 
 
 
448 aa  111  2e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0358279 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  33.18 
 
 
2361 aa  112  2e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 
546 aa  111  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  34.02 
 
 
662 aa  110  4e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
662 aa  110  4e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  31.91 
 
 
413 aa  109  9e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4745  Histidine kinase  34.02 
 
 
362 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.65465  normal  0.54089 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.44 
 
 
658 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1423  sensor histidine kinase VraS  27.59 
 
 
348 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0073  Histidine kinase  34.73 
 
 
409 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5536  sensor histidine kinase  33.17 
 
 
523 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
468 aa  107  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0643  histidine kinase  30.61 
 
 
400 aa  106  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  37.44 
 
 
413 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0789  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 
469 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5507  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
523 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4477  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 
471 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6470  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 
471 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629472  normal  0.491206 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
469 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  30.88 
 
 
339 aa  104  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3420  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
440 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0662145 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2497  histidine kinase  33.18 
 
 
1031 aa  103  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0918719  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1462  sensor kinase protein  35.09 
 
 
466 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5541  sensor histidine kinase, putative  32.21 
 
 
523 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3247  putative sensor histidine kinase  35.09 
 
 
466 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5592  sensor histidine kinase  32.69 
 
 
523 aa  103  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0746  histidine kinase  32.84 
 
 
387 aa  103  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  37.07 
 
 
373 aa  103  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0174  histidine kinase  35.86 
 
 
432 aa  102  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  32.02 
 
 
391 aa  102  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5416  sensor histidine kinase  32.21 
 
 
516 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
725 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
523 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3132  putative sensor histidine kinase  34.65 
 
 
466 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1099  sensor histidine kinase  35.09 
 
 
466 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0798  histidine kinase  33.01 
 
 
347 aa  102  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2363  sensor histidine kinase  35.09 
 
 
466 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5092  two-component sensor protein  32.21 
 
 
523 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1378  sensor histidine kinase  35.09 
 
 
466 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.922617  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
421 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
526 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2070  sensor histidine kinase  34.93 
 
 
466 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1783  histidine kinase  31.31 
 
 
501 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.11372e-07 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.64 
 
 
352 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3418  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
481 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.986219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 
665 aa  100  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6981  histidine kinase  32.43 
 
 
389 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.69549  normal  0.8933 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
463 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4564  histidine kinase  36.92 
 
 
460 aa  99.8  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.562879  normal  0.0736505 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.75 
 
 
445 aa  99.8  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.697723  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1913  histidine kinase  34.48 
 
 
353 aa  99.8  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000343654  normal  0.0175391 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3993  histidine kinase  32.23 
 
 
456 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3373  histidine kinase  33.48 
 
 
1048 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228028  normal  0.520662 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  33.61 
 
 
640 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2334  sensor histidine kinase  35.5 
 
 
470 aa  99.4  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1027  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.86 
 
 
456 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.573227  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5109  sensor histidine kinase  31.73 
 
 
523 aa  99  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2080  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
370 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5671  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0241273 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5188  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 
480 aa  99.4  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0027  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
461 aa  97.8  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.755533 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1939  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
347 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1973  histidine kinase  28.91 
 
 
347 aa  98.2  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  28.51 
 
 
351 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  6.96667e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4945  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
459 aa  96.7  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0549839 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5787  histidine kinase  35.11 
 
 
415 aa  96.3  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.634184 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  28.05 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.75238e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5497  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
459 aa  96.3  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00170786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1601  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
581 aa  96.3  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1033  Histidine kinase  30.96 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  28.18 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
478 aa  95.5  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5264  two-component sensor protein, C-terminus  32.14 
 
 
193 aa  95.5  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  28.18 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>