More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3416 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  100 
 
 		 285 aa  584  1e-166  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3304  F0F1 ATP synthase subunit gamma  92.28 
 
 		 285 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.33 
 
 		 286 aa  427  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  71.33 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.98 
 
 		 286 aa  425  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  70.63 
 
 		 286 aa  422  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1710  F0F1 ATP synthase subunit gamma  54.86 
 
 		 288 aa  332  6e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2178  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.47 
 
 		 288 aa  321  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.397184  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2140  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.47 
 
 		 288 aa  321  7e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.077812  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0520  F0F1 ATP synthase subunit gamma  53.45 
 
 		 292 aa  314  9.999999999999999e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000407991  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0862  F0F1 ATP synthase subunit gamma  51.89 
 
 		 293 aa  301  9e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.337065  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1934  F0F1 ATP synthase subunit gamma  52.26 
 
 		 289 aa  296  2e-79  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2758  ATP synthase F1, gamma subunit  51.23 
 
 		 287 aa  291  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  47.02 
 
 		 281 aa  265  5e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  45.61 
 
 		 282 aa  255  6e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.94 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1870  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.05 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3151  F0F1 ATP synthase subunit gamma  44.25 
 
 		 283 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0664  F0F1-type ATP synthase, gamma subunit  41.64 
 
 		 303 aa  236  3e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000644453  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  42.96 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17810  ATP synthase F1, gamma subunit  44.67 
 
 		 287 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4166  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.46 
 
 		 283 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.501479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.28 
 
 		 287 aa  224  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.93 
 
 		 288 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1266  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.86 
 
 		 290 aa  223  2e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2383  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.69 
 
 		 298 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.62 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.62 
 
 		 288 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0082  ATP synthase F1, gamma subunit  41.52 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.863328  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.58 
 
 		 288 aa  222  6e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.16 
 
 		 290 aa  221  9e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4608  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.72 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52170  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.07 
 
 		 287 aa  219  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3512  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.14 
 
 		 287 aa  218  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2025  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.7 
 
 		 293 aa  217  1e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.27436  normal  0.101716 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0986  F0F1 ATP synthase subunit gamma  42.01 
 
 		 290 aa  218  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.502088  normal  0.629784 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2543  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.34 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3737  ATP synthase F1, gamma subunit  40.94 
 
 		 291 aa  216  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5432  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 		 286 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1023  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.78 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5414  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.16 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249789 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.16 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.668406  normal  0.234689 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6357  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.56 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.42 
 
 		 287 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2328  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 		 293 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0763231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73250  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.56 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5122  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.81 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5201  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.240684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.3 
 
 		 295 aa  214  9e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3876  ATP synthase F1, gamma subunit  39.51 
 
 		 287 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0061  F0F1 ATP synthase subunit gamma  41.26 
 
 		 287 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0425  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.24 
 
 		 287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5600  ATP synthase F1, gamma subunit  38.46 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1239  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.19 
 
 		 318 aa  213  2.9999999999999995e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5731  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.16 
 
 		 286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0657627  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3306  H(+)-transporting two-sector ATPase  38.81 
 
 		 286 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.555978  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0899  ATP synthase F1 subunit gamma  41.67 
 
 		 300 aa  212  4.9999999999999996e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.676415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4366  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4311  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000963618 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4367  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.821169  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4508  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  212  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0591217 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4899  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.579626  normal  0.185974 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3753  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  211  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.375425  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.54 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0064  ATP synthase F1, gamma subunit  40.22 
 
 		 291 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0192  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.36 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.865487  normal  0.0103417 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0486  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.89 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3846  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.924432  hitchhiker  0.000171777 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  209  3e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1920  ATP synthase F1, gamma subunit  39.29 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0128994  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3708  F0F1 ATP synthase subunit gamma  43.64 
 
 		 298 aa  209  4e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4131  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  209  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0781928 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2138  ATP synthase F1, gamma subunit  39.13 
 
 		 295 aa  209  4e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4296  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.91 
 
 		 286 aa  209  6e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.577815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2845  ATP synthase F1, gamma subunit  39.22 
 
 		 308 aa  209  6e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.771118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  39.18 
 
 		 293 aa  208  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4013  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.6 
 
 		 309 aa  207  1e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2331  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.04 
 
 		 291 aa  207  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3926  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0151419 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4018  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.86 
 
 		 286 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3957  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  207  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.278471  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4193  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.98 
 
 		 287 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0939304  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1762  ATP synthase F1, gamma subunit  41.69 
 
 		 303 aa  207  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2704  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.06 
 
 		 291 aa  206  2e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3075  Sodium-transporting two-sector ATPase  37.93 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0309  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.57 
 
 		 293 aa  207  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0418781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  40.21 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4487  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.51 
 
 		 286 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.575584  hitchhiker  0.00000846989 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0316  ATP synthase F1, gamma subunit  38.82 
 
 		 309 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.45 
 
 		 289 aa  205  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4256  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.98 
 
 		 287 aa  205  9e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4546  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.98 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.433279  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4748  F0F1 ATP synthase subunit gamma  39.16 
 
 		 286 aa  204  1e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>