More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1838 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011773  BCAH820_3977  arginine decarboxylase  76.28 
 
 		 490 aa  793    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2664  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  77.1 
 
 		 490 aa  795    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000612019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4009  lysine decarboxylase  76.07 
 
 		 493 aa  791    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00245624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3874  lysine decarboxylase  76.07 
 
 		 493 aa  792    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0422494  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3707  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  76.07 
 
 		 493 aa  793    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00346407  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3722  lysine decarboxylase; arginine decarboxylase  75.87 
 
 		 493 aa  790    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.159771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4065  arginine decarboxylase  76.07 
 
 		 490 aa  788    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0303984  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1175  arginine decarboxylase  75.87 
 
 		 536 aa  785    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4172  lysine decarboxylase  76.07 
 
 		 493 aa  792    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000808464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3788  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  75.87 
 
 		 509 aa  783    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0991436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0963  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  88.78 
 
 		 490 aa  899    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000204147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1838  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  100 
 
 		 490 aa  1000    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4081  arginine decarboxylase  76.28 
 
 		 490 aa  793    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000678146  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1039  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  67.42 
 
 		 484 aa  688    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1437  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  51.13 
 
 		 495 aa  533  1e-150  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2050  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  48.02 
 
 		 493 aa  481  1e-134  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0371444  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2265  arginine decarboxylase  47.22 
 
 		 499 aa  475  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.211386 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1357  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  43.65 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1918  arginine decarboxylase  46.17 
 
 		 486 aa  447  1.0000000000000001e-124  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000463631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0425  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  43.69 
 
 		 488 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2795  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  44.1 
 
 		 485 aa  427  1e-118  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1815  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  41.18 
 
 		 491 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.747832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3055  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  45.33 
 
 		 485 aa  420  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0528  Orn/Lys/Arg decarboxylase  45.34 
 
 		 484 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0514  Orn/Lys/Arg decarboxylase  44.93 
 
 		 484 aa  418  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3976  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  40.45 
 
 		 487 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000244746  unclonable  0.000000000155031 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0099  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  40.35 
 
 		 509 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131597 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0181  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  43.92 
 
 		 483 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000293135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0058  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  40.99 
 
 		 482 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0052  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  38.41 
 
 		 473 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.853869  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2157  arginine decarboxylase  40.08 
 
 		 488 aa  373  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.366245 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3801  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  40.41 
 
 		 488 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2389  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.32 
 
 		 491 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0160  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.81 
 
 		 486 aa  369  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.356314 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2338  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.52 
 
 		 491 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3429  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  39.34 
 
 		 490 aa  362  6e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1276  arginine decarboxylase  35.06 
 
 		 542 aa  336  7e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.099521 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5242  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.11 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0155  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.55 
 
 		 485 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2805  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  37.09 
 
 		 494 aa  317  3e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2108  arginine decarboxylase  37.05 
 
 		 485 aa  314  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.970229  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2121  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  35.52 
 
 		 474 aa  306  7e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.06026  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0707  arginine decarboxylase  33.74 
 
 		 489 aa  300  3e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0031  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  38.13 
 
 		 483 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.901763 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0039  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.55 
 
 		 500 aa  299  6e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0035  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  37.07 
 
 		 495 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.730375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0220  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.54 
 
 		 484 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.746138 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0230  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.33 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0240  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  35.33 
 
 		 484 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.688738 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4595  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.36 
 
 		 501 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.922416  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2916  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  32.44 
 
 		 484 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25385  normal  0.0806797 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1040  arginine decarboxylase  33.26 
 
 		 524 aa  265  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.63 
 
 		 473 aa  256  7e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0041  arginine decarboxylase  36.6 
 
 		 469 aa  256  8e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000185697 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3362  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  33.4 
 
 		 473 aa  256  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0025  lysine decarboxylase  32.63 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0025  lysine decarboxylase  32.63 
 
 		 473 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0023  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.53 
 
 		 477 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0025  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  33.05 
 
 		 478 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0028  lysine decarboxylase  32.64 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0026  lysine decarboxylase  32.64 
 
 		 473 aa  253  7e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0034  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.266079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0038  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  32.43 
 
 		 473 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.06 
 
 		 473 aa  248  1e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0024  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.49 
 
 		 472 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2291  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  34.29 
 
 		 498 aa  243  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.0438493 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0027  lysine decarboxylase  32.01 
 
 		 473 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5282  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  31.37 
 
 		 473 aa  243  6e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1037  hypothetical protein  32.92 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2763  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.54 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.900019  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2448  Orn/Lys/Arg decarboxylase  28.96 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3916  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  30.55 
 
 		 479 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0117  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.95 
 
 		 487 aa  210  4e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0060  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  32.03 
 
 		 472 aa  186  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.845817  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11741  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.38 
 
 		 465 aa  179  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0120  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  29.44 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09861  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  30.89 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11911  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.96 
 
 		 465 aa  173  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.83143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0119  Orn/Lys/Arg decarboxylase  26.64 
 
 		 445 aa  173  6.999999999999999e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1095  arginine decarboxylase  27.87 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_11021  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.42 
 
 		 465 aa  166  5.9999999999999996e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.260253 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11901  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  28.64 
 
 		 465 aa  165  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1380  arginine decarboxylase  30.18 
 
 		 471 aa  165  2.0000000000000002e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.104521  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0515  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  27.29 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0947631  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0502  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  27.29 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1006  Arginine decarboxylase  28.57 
 
 		 445 aa  158  2e-37  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1621  arginine decarboxylase  25.54 
 
 		 468 aa  156  6e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.460464 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14971  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.92 
 
 		 464 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41020  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  27.83 
 
 		 751 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3478  putative Orn/Arg/Lys decarboxylase  27.83 
 
 		 751 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1369  Orn/Lys/Arg decarboxylase, major region  28.61 
 
 		 440 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.572499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0665  Orn/Lys/Arg decarboxylase family protein  27.92 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.845174  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1269  lysine decarboxylase  27.24 
 
 		 767 aa  150  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29580  Ornithine/lysine/arginine decarboxylase  28.57 
 
 		 746 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1725  lysine decarboxylase  28.83 
 
 		 749 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.879882  normal  0.772169 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3465  lysine decarboxylase  27.98 
 
 		 749 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.583785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0511  Orn/Lys/Arg decarboxylase major region  26.86 
 
 		 464 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2068  lysine decarboxylase  27.11 
 
 		 747 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.014755  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3712  lysine decarboxylase  27.45 
 
 		 757 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.709841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2967  ornithine decarboxylase  25.04 
 
 		 757 aa  138  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.482503  normal  0.818361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>