More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2433 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009487  SaurJH9_1634  RNA modification protein  73.8 
 
 		 448 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.654078  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1144  hypothetical protein  72.99 
 
 		 448 aa  693    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1668  RNA modification protein  73.8 
 
 		 448 aa  695    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4391  hypothetical protein  80.67 
 
 		 450 aa  771    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115711  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4209  hypothetical protein  80.45 
 
 		 450 aa  769    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4047  hypothetical protein  80.67 
 
 		 450 aa  771    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4057  hypothetical protein  80.67 
 
 		 450 aa  771    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4161  RNA modification protein  79.78 
 
 		 450 aa  764    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.556145  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4332  RNA modification enzyme, MiaB family  80.67 
 
 		 450 aa  770    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.16472e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4535  hypothetical protein  80.45 
 
 		 450 aa  769    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1017  RNA modification enzyme, MiaB family  90.47 
 
 		 449 aa  853    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2433  RNA modification enzyme, MiaB family  100 
 
 		 451 aa  932    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000747616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3036  RNA modification protein  81.35 
 
 		 450 aa  775    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0366508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0807  RNA modification enzyme, MiaB family  80.22 
 
 		 450 aa  768    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0137858  decreased coverage  2.64257e-22 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4443  RNA modification enzyme, MiaB family  80.67 
 
 		 450 aa  771    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000190996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4429  hypothetical protein  80.22 
 
 		 450 aa  768    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1992  MiaB-like tRNA modifying enzyme  56.02 
 
 		 471 aa  508  9.999999999999999e-143  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.130467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3217  RNA modification enzyme, MiaB family  53.01 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000221997  hitchhiker  0.000000785503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2492  RNA modification protein  49.41 
 
 		 436 aa  436  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131013  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1333  MiaB-like tRNA modifying enzyme  50.71 
 
 		 449 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  47.27 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0150  RNA modification protein  48.17 
 
 		 434 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.839753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4295  RNA modification enzyme, MiaB family  51.14 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00281289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0588  MiaB-like tRNA modifying enzyme  51.54 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0962192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2241  RNA modification enzyme, MiaB family  45.39 
 
 		 454 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00150078  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2282  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.16 
 
 		 434 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.39 
 
 		 434 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  45.66 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2053  MiaB-like tRNA modifying enzyme  46.74 
 
 		 450 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0223  hypothetical protein  42.15 
 
 		 441 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.180201 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1164  RNA modification enzyme, MiaB family  43.53 
 
 		 431 aa  355  6.999999999999999e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1770  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.56 
 
 		 435 aa  353  5e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000207484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2299  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.56 
 
 		 466 aa  348  1e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.198843  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1187  RNA modification enzyme, MiaB family  42.15 
 
 		 446 aa  346  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0386779 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.56 
 
 		 456 aa  345  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000454579  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2937  MiaB-like tRNA modifying enzyme  44.03 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.673839  normal  0.173134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1997  MiaB-like tRNA modifying enzyme  45.35 
 
 		 441 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1643  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.92 
 
 		 429 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.119605  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0611  RNA modification enzyme, MiaB family  44.47 
 
 		 437 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.920211  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5039  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.63 
 
 		 444 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1737  2-methylthioadenine synthetase  42.02 
 
 		 438 aa  333  3e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2570  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.94 
 
 		 429 aa  333  5e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.005255 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0174  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.09 
 
 		 430 aa  330  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1857  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.54 
 
 		 432 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000114049  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0874  MiaB-like tRNA modifying enzyme  42.96 
 
 		 431 aa  326  4.0000000000000003e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249518 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09066  putative Fe-S oxidoreductase  41.38 
 
 		 458 aa  325  1e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.276137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1490  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.37 
 
 		 444 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2568  MiaB-like tRNA modifying enzyme  43.59 
 
 		 434 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6578  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40 
 
 		 425 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.745679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1050  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.05 
 
 		 438 aa  322  6e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2224  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.86 
 
 		 442 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.490633  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0444  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.63 
 
 		 442 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0474351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1350  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.67 
 
 		 449 aa  313  4.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.306215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1331  MiaB-like tRNA modifying enzyme  41.3 
 
 		 417 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000562047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2316  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.55 
 
 		 427 aa  290  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000240078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.73 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  40.36 
 
 		 458 aa  287  2.9999999999999996e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0422  RNA modification protein  38.53 
 
 		 446 aa  286  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0536856  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1728  MiaB-like tRNA modifying enzyme  40.15 
 
 		 438 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.479022  decreased coverage  0.00502843 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0166  RNA modification protein  36.92 
 
 		 440 aa  283  5.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.684419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2221  MiaB-like tRNA modifying enzyme  39.11 
 
 		 444 aa  281  2e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000670309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  35.91 
 
 		 450 aa  280  3e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1211  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.44 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.496163 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2207  RNA modification enzyme, MiaB family  35.76 
 
 		 440 aa  280  4e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.77 
 
 		 420 aa  278  1e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1889  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.22 
 
 		 456 aa  276  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000213731  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.74 
 
 		 434 aa  276  7e-73  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1996  MiaB-like tRNA modifying enzyme  38.42 
 
 		 451 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.320678  normal  0.0920131 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  36.04 
 
 		 487 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.97 
 
 		 434 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1156  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.03 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.516492  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0969  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.69 
 
 		 421 aa  274  3e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1349  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.03 
 
 		 447 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3871  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.2 
 
 		 509 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0674  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.87 
 
 		 429 aa  272  7e-72  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1428  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.97 
 
 		 509 aa  271  1e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3806  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.97 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0549  RNA modification protein  35.8 
 
 		 443 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3819  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.97 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1488  RNA modification protein  36.84 
 
 		 497 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0783  RNA modification protein  34.24 
 
 		 480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3784  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.97 
 
 		 509 aa  270  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0126107 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3513  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.97 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.325275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3531  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.97 
 
 		 509 aa  270  5e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  35.67 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1018  RNA modification enzyme, MiaB family  35.07 
 
 		 449 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.657516  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1790  RNA modification enzyme, MiaB family  35.7 
 
 		 452 aa  266  4e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0115132  normal  0.0236064 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3621  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.52 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3908  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  35.52 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2092  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.18 
 
 		 531 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1197  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  36.18 
 
 		 523 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000761282  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3543  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  34.99 
 
 		 509 aa  265  1e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0128705  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  33.64 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0789  tRNA 2-methylthioadenosine synthase  37.32 
 
 		 411 aa  265  2e-69  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.594901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0570  RNA modification enzyme, MiaB family  36.03 
 
 		 447 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0962  MiaB family tRNA modification protein  34.73 
 
 		 413 aa  264  3e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_835  tRNA modification enzyme, MiaB family  33.88 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.258618  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  36.6 
 
 		 421 aa  263  3e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0853  MiaB-like tRNA modifying enzyme  34.27 
 
 		 416 aa  264  3e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0319  MiaB-like tRNA modifying enzyme  37.39 
 
 		 419 aa  263  4e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>