33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2680 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2680  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  296  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2637  membrane protein-like  76.32 
 
 		 159 aa  210  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000516806  normal  0.56497 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0019  membrane protein-like protein  62.24 
 
 		 170 aa  157  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0178254  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0117  hypothetical protein  55.07 
 
 		 157 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4330  hypothetical protein  53.15 
 
 		 153 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.131814  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0149  hypothetical protein  47.18 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2700  hypothetical protein  43.14 
 
 		 162 aa  140  9e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0072  membrane protein-like protein  48.63 
 
 		 211 aa  138  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1221  membrane protein  40.97 
 
 		 170 aa  133  8e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.780478  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4863  hypothetical protein  46.31 
 
 		 154 aa  132  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000509957  normal  0.306112 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2475  hypothetical protein  46.38 
 
 		 143 aa  121  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1839  hypothetical protein  43.94 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3792  hypothetical protein  47.41 
 
 		 156 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3034  hypothetical protein  38.69 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0381  hypothetical protein  45.52 
 
 		 164 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.364437  normal  0.790381 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3486  membrane protein  35.53 
 
 		 176 aa  87.8  5e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4734  hypothetical protein  40.13 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1179  hypothetical protein  37.32 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.630438  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0488  hypothetical protein  33.11 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.477591  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0553  hypothetical protein  33.11 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0787  hypothetical protein  31.37 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.426334  normal  0.0385246 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1587  hypothetical protein  26.39 
 
 		 155 aa  76.3  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0544  hypothetical protein  34.84 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02548  hypothetical protein  32.88 
 
 		 156 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.360557  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0533  hypothetical protein  31.62 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0288544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2709  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  38.54 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122601  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1854  membrane protein-like protein  45 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.368147  hitchhiker  0.000187157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3735  hypothetical protein  38.1 
 
 		 272 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.939012 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10091  hypothetical protein  36.59 
 
 		 256 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.403914  normal  0.141403 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3414  membrane protein-like protein  39.71 
 
 		 263 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00178043  hitchhiker  0.000103691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3696  Protein of unknown function DUF2068, transmembrane  24.36 
 
 		 253 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0100204  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1347  hypothetical protein  47.5 
 
 		 268 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.5454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2492  hypothetical protein  39.73 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>