More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0059 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  66.53 
 
 
742 aa  990  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  1.00763e-07 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  51.21 
 
 
737 aa  699  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.78375e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  58.87 
 
 
736 aa  868  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0059  UvrD/REP helicase  100 
 
 
731 aa  1505  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5097e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  96.58 
 
 
732 aa  1427  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  67.92 
 
 
744 aa  1013  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  57.46 
 
 
762 aa  855  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  66.8 
 
 
739 aa  996  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.62 
 
 
732 aa  634  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.09 
 
 
741 aa  619  1e-176  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  49.92 
 
 
715 aa  615  1e-175  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.12312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.14 
 
 
737 aa  607  1e-172  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.7 
 
 
785 aa  605  1e-172  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.13 
 
 
729 aa  602  1e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  45.5 
 
 
707 aa  599  1e-170  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.13 
 
 
759 aa  600  1e-170  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.73 
 
 
725 aa  601  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.56 
 
 
729 aa  599  1e-170  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.66 
 
 
747 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
747 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  43.06 
 
 
762 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  2.43154e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.54 
 
 
755 aa  597  1e-169  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.55 
 
 
753 aa  597  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.68 
 
 
753 aa  595  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.66 
 
 
751 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.97 
 
 
741 aa  592  1e-168  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
751 aa  594  1e-168  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.9 
 
 
747 aa  592  1e-168  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
751 aa  593  1e-168  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  42.53 
 
 
751 aa  594  1e-168  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  42.28 
 
 
753 aa  592  1e-168  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.49 
 
 
711 aa  587  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.78 
 
 
768 aa  587  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.57 
 
 
730 aa  588  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.57 
 
 
730 aa  588  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  44.79 
 
 
738 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  44.46 
 
 
738 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.84 
 
 
851 aa  582  1e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.11 
 
 
738 aa  585  1e-165  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.08 
 
 
763 aa  579  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.86 
 
 
786 aa  578  1e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.83 
 
 
758 aa  578  1e-163  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.71 
 
 
730 aa  575  1e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.67 
 
 
757 aa  575  1e-163  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.54 
 
 
718 aa  575  1e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  45.33 
 
 
746 aa  573  1e-162  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.29 
 
 
754 aa  569  1e-161  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  50.57 
 
 
694 aa  572  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.3 
 
 
831 aa  572  1e-161  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.18 
 
 
748 aa  567  1e-160  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.53 
 
 
765 aa  566  1e-160  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.9 
 
 
751 aa  562  1e-159  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  41.53 
 
 
757 aa  565  1e-159  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  46.05 
 
 
770 aa  564  1e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.54 
 
 
830 aa  560  1e-158  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.11 
 
 
837 aa  559  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.32 
 
 
751 aa  561  1e-158  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.54 
 
 
795 aa  561  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.59 
 
 
766 aa  561  1e-158  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.5 
 
 
773 aa  560  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  42.55 
 
 
771 aa  561  1e-158  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.12 
 
 
838 aa  558  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.2 
 
 
756 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.77 
 
 
785 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.58 
 
 
806 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.65 
 
 
772 aa  556  1e-157  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  45.34 
 
 
706 aa  557  1e-157  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.75 
 
 
858 aa  556  1e-157  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.77 
 
 
785 aa  558  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  46.08 
 
 
794 aa  558  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.75 
 
 
858 aa  555  1e-157  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  45.94 
 
 
807 aa  557  1e-157  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.03 
 
 
802 aa  555  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.66 
 
 
784 aa  553  1e-156  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  42.3 
 
 
768 aa  553  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0142  UvrD/REP helicase  42.44 
 
 
751 aa  554  1e-156  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.750575  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.35 
 
 
849 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.01 
 
 
775 aa  549  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  41.2 
 
 
723 aa  550  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.92 
 
 
781 aa  550  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  43.25 
 
 
728 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  40.99 
 
 
813 aa  545  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  8.46771e-05 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.03 
 
 
780 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.89 
 
 
829 aa  547  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  43.07 
 
 
726 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  43.11 
 
 
728 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  42.22 
 
 
705 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  42.35 
 
 
892 aa  544  1e-153  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1293  ATP-dependent DNA helicase Rep  40.94 
 
 
765 aa  541  1e-152  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  41.3 
 
 
714 aa  540  1e-152  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  9.16129e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  43.89 
 
 
742 aa  539  1e-152  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.75 
 
 
833 aa  540  1e-152  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  40.92 
 
 
781 aa  541  1e-152  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  43.58 
 
 
797 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  41.14 
 
 
724 aa  536  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  42.9 
 
 
726 aa  537  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.28 
 
 
762 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  47.95 
 
 
797 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.88 
 
 
932 aa  533  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.43 
 
 
828 aa  535  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>