275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0053 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2978  protein of unknown function DUF323  74.64 
 
 
553 aa  875  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0275  hypothetical protein  55.2 
 
 
704 aa  773  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.171892  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0381  hypothetical protein  55.49 
 
 
705 aa  774  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0053  protein of unknown function DUF323  100 
 
 
701 aa  1437  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.56443e-10 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0017  hypothetical protein  76.11 
 
 
702 aa  1138  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0240  hypothetical protein  56.9 
 
 
702 aa  795  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1543  hypothetical protein  56.21 
 
 
709 aa  830  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0477  hypothetical protein  48.91 
 
 
701 aa  719  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0275  hypothetical protein  55.2 
 
 
704 aa  773  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0267  hypothetical protein  55.2 
 
 
704 aa  773  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2257  hypothetical protein  58.12 
 
 
726 aa  839  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3663  hypothetical protein  47.14 
 
 
722 aa  637  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.793757  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0271  protein of unknown function DUF323  55.2 
 
 
704 aa  773  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3577  protein of unknown function DUF323  59.39 
 
 
727 aa  850  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296354  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0416  protein of unknown function DUF323  56.9 
 
 
702 aa  795  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.592351  hitchhiker  0.000236625 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0055  protein of unknown function DUF323  94.01 
 
 
701 aa  1367  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0386  hypothetical protein  58.58 
 
 
716 aa  844  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.172977  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1078  protein of unknown function DUF323  58.65 
 
 
700 aa  827  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4465  hypothetical protein  54.47 
 
 
699 aa  783  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0265  hypothetical protein  54.68 
 
 
699 aa  782  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.28556e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3422  hypothetical protein  54.78 
 
 
709 aa  772  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.813696  normal  0.647593 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3757  hypothetical protein  54.68 
 
 
699 aa  784  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.62382  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0264  hypothetical protein  54.99 
 
 
699 aa  783  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0605  hypothetical protein  43.9 
 
 
747 aa  637  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1749  protein of unknown function DUF323  54.22 
 
 
696 aa  790  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2592  hypothetical protein  45.66 
 
 
703 aa  647  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.249838 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44876  predicted protein  36.9 
 
 
933 aa  463  1e-129  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0090  hypothetical protein  41.97 
 
 
449 aa  362  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.841072 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2910  methyltransferase type 11  69.11 
 
 
252 aa  353  5e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3409  hypothetical protein  38.66 
 
 
455 aa  330  8e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0361  methyltransferase type 12  53.94 
 
 
252 aa  253  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4271  protein of unknown function DUF323  33.33 
 
 
439 aa  194  4e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.728513  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4432  hypothetical protein  31.31 
 
 
430 aa  193  9e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0605  hypothetical protein  33.26 
 
 
447 aa  191  3e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.396702 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01670  conserved hypothetical protein  27.34 
 
 
1020 aa  133  1e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.840484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0331  hypothetical protein  30.73 
 
 
433 aa  123  1e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.188129  normal  0.943613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0638  protein of unknown function DUF323  27.5 
 
 
446 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.749121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2548  methyltransferase  26.57 
 
 
766 aa  110  9e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22460  conserved hypothetical protein TIGR03440  32.58 
 
 
468 aa  104  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.599861 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1251  protein of unknown function DUF323  26.96 
 
 
385 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.499599  normal  0.335829 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4693  protein of unknown function DUF323  30.56 
 
 
446 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.522761 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0997  hypothetical protein  27.74 
 
 
430 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0142804  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3640  protein of unknown function DUF323  30.97 
 
 
442 aa  101  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.530686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2380  protein of unknown function DUF323  27.27 
 
 
417 aa  100  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2434  hypothetical protein  24.94 
 
 
425 aa  100  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2650  hypothetical protein  30.29 
 
 
439 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112589  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3833  hypothetical protein  27.03 
 
 
395 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.219039  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1589  hypothetical protein  25.4 
 
 
429 aa  99.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0217234  normal  0.353044 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1747  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
280 aa  98.2  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.044533  normal  0.0419558 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4512  hypothetical protein  31.25 
 
 
487 aa  96.7  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.720233  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1789  hypothetical protein  28.57 
 
 
434 aa  97.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.078937 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1440  hypothetical protein  26.25 
 
 
429 aa  97.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7301  hypothetical protein  29.91 
 
 
506 aa  95.9  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5249  hypothetical protein  30.03 
 
 
436 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4970  hypothetical protein  30.03 
 
 
436 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4881  hypothetical protein  30.03 
 
 
436 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.546495  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3454  hypothetical protein  27.01 
 
 
444 aa  95.5  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1511  hypothetical protein  28.96 
 
 
432 aa  95.9  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.92317  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13734  hypothetical protein  28.53 
 
 
425 aa  95.1  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.72863 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0564  hypothetical protein  34.58 
 
 
424 aa  94  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3177  protein of unknown function DUF323  24.42 
 
 
416 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2940  Non-specific serine/threonine protein kinase  24.42 
 
 
416 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.279621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1420  protein of unknown function DUF323  25.72 
 
 
434 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.350616 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4280  hypothetical protein  24.83 
 
 
412 aa  92.4  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0687  hypothetical protein  24.83 
 
 
437 aa  92  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1281  hypothetical protein  25.7 
 
 
428 aa  92  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5169  hypothetical protein  27.29 
 
 
437 aa  90.9  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1081  protein of unknown function DUF323  27.19 
 
 
447 aa  90.9  8e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3038  protein of unknown function DUF323  24.94 
 
 
429 aa  90.5  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1022  hypothetical protein  26.45 
 
 
386 aa  90.5  9e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177871 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1461  protein of unknown function DUF323  27.33 
 
 
434 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.851366  normal  0.0136368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2029  hypothetical protein  25.06 
 
 
437 aa  90.1  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4037  hypothetical protein  30.34 
 
 
427 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2257  hypothetical protein  27.95 
 
 
444 aa  88.6  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.689177  normal  0.0943468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1661  hypothetical protein  28.74 
 
 
412 aa  88.6  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3535  hypothetical protein  24.26 
 
 
438 aa  88.2  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4834  hypothetical protein  29 
 
 
430 aa  88.2  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6118  protein of unknown function DUF323  26.8 
 
 
455 aa  87.8  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4964  protein of unknown function DUF323  25.81 
 
 
383 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.24016  normal  0.238732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1838  hypothetical protein  26.33 
 
 
426 aa  87  9e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.118633  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1316  hypothetical protein  26.33 
 
 
429 aa  86.7  1e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.722294 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0657  hypothetical protein  24.3 
 
 
436 aa  86.7  1e-15  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.568956 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2123  protein of unknown function DUF323  28.41 
 
 
442 aa  86.3  2e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  35.06 
 
 
313 aa  85.9  2e-15  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0204  protein of unknown function DUF323  31.58 
 
 
442 aa  85.5  3e-15  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4563  hypothetical protein  26.23 
 
 
432 aa  85.5  3e-15  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.51165  normal  0.286886 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5439  protein of unknown function DUF323  34.72 
 
 
414 aa  85.1  4e-15  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0939  protein of unknown function DUF323  27.45 
 
 
384 aa  84.3  7e-15  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.625024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2445  hypothetical protein  24.73 
 
 
427 aa  84  8e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3999  protein of unknown function DUF323  28.75 
 
 
423 aa  84  9e-15  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0859186 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2475  protein of unknown function DUF323  27.38 
 
 
385 aa  83.6  1e-14  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
313 aa  83.2  1e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8029  protein of unknown function DUF323  31.15 
 
 
446 aa  83.6  1e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217933  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0785  hypothetical protein  26.58 
 
 
428 aa  83.6  1e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.449509  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10996  DUF323 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G15650)  26.28 
 
 
512 aa  83.2  2e-14  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.742402  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2114  hypothetical protein  27.53 
 
 
444 aa  81.6  4e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0420844 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5485  hypothetical protein  25.87 
 
 
448 aa  81.6  5e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152012  normal  0.0898392 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_94690  predicted protein  27.14 
 
 
819 aa  81.3  6e-14  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.154344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6244  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 
326 aa  80.9  8e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.099736  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  26.06 
 
 
517 aa  80.5  1e-13  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>