78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5281 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5281  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 135 aa  264  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.113693  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3984  TOBE  73.33 
 
 		 135 aa  189  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0770501  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2560  DNA binding domain protein, excisionase family  63.97 
 
 		 133 aa  147  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151645  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9032  molybdenum-pterin binding protein  62.22 
 
 		 136 aa  147  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.424938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4972  DNA binding domain protein, excisionase family  63.36 
 
 		 131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2041  DNA binding domain-containing protein  60.61 
 
 		 132 aa  144  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4178  DNA binding domain, excisionase family  59.85 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.180045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2907  TOBE domain protein  57.58 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251245  hitchhiker  0.0000128303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1230  TOBE domain protein  58.65 
 
 		 133 aa  139  9e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.901933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1752  DNA binding domain protein, excisionase family  59.12 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.718089  decreased coverage  0.00260274 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1951  DNA binding domain protein, excisionase family  60.15 
 
 		 132 aa  137  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400449  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1070  DNA binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2823  DNA binding domain protein, excisionase family  58.21 
 
 		 132 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000141549  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3749  TOBE domain-containing protein  57.89 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3484  DNA binding domain protein, excisionase family  56.39 
 
 		 136 aa  131  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2691  excisionase family DNA binding domain-containing protein  60.63 
 
 		 127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1854  TOBE domain protein  49.61 
 
 		 133 aa  122  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316057  hitchhiker  0.00765451 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0046  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0036  DNA binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.135924 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0055  DNA binding domain-containing protein  52.99 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0159209  normal  0.0252728 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18110  DNA-binding protein, excisionase family  54.55 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059521  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2539  DNA binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2544  DNA binding domain-containing protein  57.69 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34150  molybdenum-pterin binding domain protein  58.33 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.264153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4510  DNA binding domain protein, excisionase family  54.62 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2731  DNA binding domain-containing protein  55.38 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3858  DNA binding domain-containing protein  54.89 
 
 		 132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179703  normal  0.0579791 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2807  TOBE domain protein  55.08 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8653  DNA binding domain protein, excisionase family  50.38 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3465  DNA binding domain protein, excisionase family  44 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215195  normal  0.136383 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3207  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  51.61 
 
 		 72 aa  67  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1560  TOBE domain protein  52.08 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1548  molybdenum-pterin binding protein  29.69 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207471  normal  0.138773 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1190  molybdenum-pterin-binding protein  41.79 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50690  Mo processing, homeostasis  37.88 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2813  TOBE domain protein  44.44 
 
 		 362 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  38.1 
 
 		 281 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5298  TOBE domain-containing protein  40.28 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1580  TOBE domain protein  38.1 
 
 		 378 aa  45.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22590  Molybdenum-pterin binding domain protein  37.88 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01900  molybdenum-pterin binding domain protein  35.82 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.171809 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1501  TOBE domain-containing protein  34.38 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0567  ModE family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 268 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2476  TOBE domain protein  41.27 
 
 		 452 aa  43.9  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1478  molybdenum-pterin binding protein  37.33 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.703627 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02000  molybdenum-pterin binding domain protein  37.35 
 
 		 139 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000138356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3365  TOBE domain-containing protein  41.27 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 279 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  29.03 
 
 		 195 aa  41.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2790  TOBE domain-containing protein  40.91 
 
 		 438 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1996  TOBE domain protein  31.25 
 
 		 143 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3517  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 380 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4635  TOBE domain-containing protein  37.31 
 
 		 71 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.560309  hitchhiker  0.0000128283 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3968  transcriptional regulator, ModE family  34.78 
 
 		 234 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3275  molybdenum-pterin binding protein  35.48 
 
 		 140 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.288607  normal  0.615239 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0810  transcriptional regulator, ModE family  32.93 
 
 		 267 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0330834  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1452  TOBE domain-containing protein  36.51 
 
 		 142 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2725  TOBE domain protein  35.82 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1572  molybdate ABC transporter, ATPase subunit  35.44 
 
 		 363 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00359628 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0294  transcriptional regulator ModE  37.31 
 
 		 262 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0630  ModE family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 290 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2569  transcriptional regulator ModE  37.31 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0871  transcriptional regulator ModE  37.31 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1474  transcriptional regulator ModE  37.31 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.277699  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1671  transcriptional regulator ModE  37.31 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.914572  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2433  molybdenum transporter/regulator protein ModE  37.31 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0326  transcriptional regulator ModE  37.31 
 
 		 282 aa  41.2  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1275  TOBE domain protein  33.87 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.115327 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3040  TOBE domain-containing protein  34.33 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.0659327 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  35.82 
 
 		 282 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 270 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1539  molybdenum-pterin binding protein  38.71 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  31.65 
 
 		 353 aa  40.4  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1281  TOBE domain protein  32.84 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.238328  normal  0.240101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1218  TOBE domain protein  32.84 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648939  normal  0.187717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2971  TOBE domain protein  34.33 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123269  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1342  putative molybdopterin-binding protein  32.84 
 
 		 71 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128998  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>