More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5274 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_5274  endopeptidase Clp  100 
 
 
213 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1205  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  92.02 
 
 
213 aa  407  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158581  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1529  Endopeptidase Clp  82.26 
 
 
213 aa  321  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0209327  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2774  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  82.97 
 
 
238 aa  320  9.000000000000001e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  73.13 
 
 
221 aa  313  9e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.753461  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2477  endopeptidase Clp  77.13 
 
 
217 aa  311  2.9999999999999996e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.353713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7291  Endopeptidase Clp  70.48 
 
 
214 aa  309  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.800235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4919  endopeptidase Clp  75.13 
 
 
236 aa  305  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.438524  hitchhiker  0.00520198 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3878  endopeptidase Clp  75.53 
 
 
213 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.182477  hitchhiker  0.00149389 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3499  endopeptidase Clp  75 
 
 
213 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0591598  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3401  Endopeptidase Clp  75.14 
 
 
192 aa  299  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0633658  normal  0.308742 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09090  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  72.87 
 
 
225 aa  295  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.577187  normal  0.0503281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1370  Endopeptidase Clp  72.28 
 
 
207 aa  294  5e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3477  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  71.89 
 
 
195 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3517  Endopeptidase Clp  64.45 
 
 
213 aa  279  3e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1577  Endopeptidase Clp  67.5 
 
 
211 aa  276  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2194  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  73.41 
 
 
203 aa  270  2e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1393  Endopeptidase Clp  62.94 
 
 
206 aa  269  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.849713  normal  0.771731 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0642  endopeptidase Clp  65.43 
 
 
194 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.550245  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2598  Endopeptidase Clp  63.32 
 
 
213 aa  269  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1461  Endopeptidase Clp  66.84 
 
 
197 aa  268  4e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.509443  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0955  Endopeptidase Clp  63.02 
 
 
207 aa  267  7e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3399  Endopeptidase Clp  70.11 
 
 
210 aa  267  8e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24380  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  67.98 
 
 
207 aa  265  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0695  endopeptidase Clp  64.84 
 
 
194 aa  264  7e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2049  Endopeptidase Clp  66.67 
 
 
207 aa  264  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1119  Endopeptidase Clp  62.83 
 
 
214 aa  263  1e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4258  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  68.72 
 
 
240 aa  261  8e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.621412  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  59.11 
 
 
208 aa  259  3e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1749  Endopeptidase Clp  68.6 
 
 
211 aa  258  3e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2405  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14 / ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  65.76 
 
 
203 aa  258  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0397607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2159  Endopeptidase Clp  67.23 
 
 
206 aa  257  7e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000566735 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4896  Endopeptidase Clp  66.48 
 
 
219 aa  256  2e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826169  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09880  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.69 
 
 
205 aa  254  5e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.860863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12180  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  67.03 
 
 
197 aa  253  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1098  Endopeptidase Clp  63.49 
 
 
205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09550  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  62.03 
 
 
210 aa  252  3e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2737  ClpP1 peptidase. Serine peptidase. MEROPS family S14  67.03 
 
 
200 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12486  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  64.02 
 
 
200 aa  248  5e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5206  Endopeptidase Clp  61.5 
 
 
211 aa  248  7e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3578  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  65.22 
 
 
195 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3583  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  65.22 
 
 
195 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.117643  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3651  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  65.22 
 
 
195 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.422655  normal  0.394425 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4040  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  65.92 
 
 
194 aa  244  8e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0563268  normal  0.405565 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0015  endopeptidase Clp  68.45 
 
 
205 aa  243  9.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.632715  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2588  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  65.92 
 
 
218 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1851  Endopeptidase Clp  64.47 
 
 
229 aa  241  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0126573  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0879  Clp protease  60.67 
 
 
203 aa  240  1e-62  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0686  ATP-dependent Clp proteases Protease subunit  63.74 
 
 
207 aa  237  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0218  Endopeptidase Clp  61.67 
 
 
204 aa  235  4e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3172  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.16 
 
 
229 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2924  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.16 
 
 
229 aa  231  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0585  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  61.62 
 
 
231 aa  231  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.629733  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2037  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.61 
 
 
228 aa  230  1e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0385  peptidase S14, ClpP  57.22 
 
 
225 aa  230  1e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.546462  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25250  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.67 
 
 
212 aa  230  1e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0560465  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0547  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  57.75 
 
 
204 aa  229  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1519  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.99 
 
 
198 aa  229  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4364  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.46 
 
 
236 aa  228  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.375461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2693  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  60.23 
 
 
205 aa  228  5e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000240407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2562  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.23 
 
 
195 aa  227  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0322  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.38 
 
 
201 aa  227  1e-58  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3604  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  58.55 
 
 
232 aa  226  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.513277 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1479  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  59.06 
 
 
198 aa  227  1e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000813663  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0405  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.15 
 
 
225 aa  227  1e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2030  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  55.61 
 
 
227 aa  227  1e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0162468  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0389  peptidase S14, ClpP  54.55 
 
 
225 aa  226  3e-58  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0601848  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1230  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.96 
 
 
194 aa  225  3e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000738057  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2525  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit ClpP  60.66 
 
 
244 aa  225  4e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2382  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  56.15 
 
 
225 aa  225  4e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.656103  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1011  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.5 
 
 
219 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258522  normal  0.818355 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1465  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.29 
 
 
207 aa  224  9e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.909373  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3234  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52 
 
 
207 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0374566  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1432  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  60.23 
 
 
193 aa  223  1e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.53269  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3054  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52 
 
 
207 aa  223  1e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311725  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3092  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52 
 
 
207 aa  223  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000388332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4515  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  58.66 
 
 
202 aa  223  2e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010245  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0235  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.14 
 
 
203 aa  223  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0233  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.14 
 
 
203 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.196502  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1656  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55 
 
 
200 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0517527  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1088  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.68 
 
 
194 aa  222  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.850787  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1837  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  55.08 
 
 
226 aa  223  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3068  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  53.33 
 
 
207 aa  222  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.201714  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2537  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  55.44 
 
 
199 aa  222  4e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.151699  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2120  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  54.31 
 
 
207 aa  222  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0489  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  56.11 
 
 
200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.148245  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0904  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.03 
 
 
207 aa  221  4.9999999999999996e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000979846  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1177  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  58.96 
 
 
200 aa  221  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2295  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.5 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.692844  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1906  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  52.5 
 
 
217 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36552  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2365  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
217 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.490109  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3348  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
217 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0216407  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1232  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
217 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.34038  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2323  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
217 aa  221  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0415791  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1957  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
217 aa  221  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3424  ATP-dependent Clp protease, proteolytic subunit ClpP  52.53 
 
 
203 aa  221  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1512  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  57.8 
 
 
200 aa  221  7e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000166308  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2740  endopeptidase Clp  54.75 
 
 
206 aa  221  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600762  decreased coverage  0.00246808 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1465  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
207 aa  221  8e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0878215  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2481  ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit  53.81 
 
 
207 aa  221  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>