More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2603 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  76.02 
 
 		 508 aa  701    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  100 
 
 		 520 aa  1011    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  64.68 
 
 		 501 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  62.38 
 
 		 509 aa  582  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  63.97 
 
 		 511 aa  578  1e-164  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  61.6 
 
 		 509 aa  565  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  62.26 
 
 		 509 aa  557  1e-157  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  57.04 
 
 		 529 aa  539  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  57.63 
 
 		 575 aa  527  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  57.42 
 
 		 521 aa  518  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  55.68 
 
 		 495 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  56.13 
 
 		 498 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  54.39 
 
 		 512 aa  489  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  54.21 
 
 		 491 aa  484  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  57.43 
 
 		 499 aa  478  1e-133  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  53.71 
 
 		 494 aa  474  1e-132  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  54.53 
 
 		 486 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  53.42 
 
 		 490 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  53.88 
 
 		 527 aa  459  9.999999999999999e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  56.64 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  56.64 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  56.64 
 
 		 495 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  50.48 
 
 		 517 aa  449  1e-125  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  52.68 
 
 		 476 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  51.84 
 
 		 507 aa  439  9.999999999999999e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  51.73 
 
 		 501 aa  414  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  43.43 
 
 		 506 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 506 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  43.24 
 
 		 513 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  43.05 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  46.53 
 
 		 495 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  41.79 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  42.7 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  43.93 
 
 		 489 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  36.65 
 
 		 494 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  41.78 
 
 		 503 aa  365  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  43.43 
 
 		 502 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0196  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 491 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  42.21 
 
 		 485 aa  364  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1284  cobyric acid synthase  37.64 
 
 		 514 aa  364  3e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  37.96 
 
 		 513 aa  363  4e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  41.85 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.73 
 
 		 501 aa  360  3e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.02 
 
 		 787 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  46.3 
 
 		 485 aa  360  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  47.05 
 
 		 496 aa  359  8e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  42.55 
 
 		 503 aa  358  9e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  38.11 
 
 		 507 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  41.68 
 
 		 517 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  43.33 
 
 		 776 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  46.26 
 
 		 481 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  42.37 
 
 		 772 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  42.64 
 
 		 534 aa  354  2e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  44.44 
 
 		 518 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.44 
 
 		 777 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  43.88 
 
 		 797 aa  352  7e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  39.16 
 
 		 515 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  41.09 
 
 		 864 aa  352  8.999999999999999e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  43.36 
 
 		 485 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  43.97 
 
 		 484 aa  351  1e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3957  cobyric acid synthase  39.01 
 
 		 488 aa  352  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.117227  normal  0.976243 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3857  cobyric acid synthase CobQ  40.35 
 
 		 491 aa  352  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  39.32 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  42.01 
 
 		 484 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  45.07 
 
 		 510 aa  351  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  46.11 
 
 		 490 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  46.99 
 
 		 495 aa  350  4e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0211  cobyric acid synthase  43.55 
 
 		 491 aa  350  4e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.264631 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  43.58 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0632  cobyric acid synthase  44.95 
 
 		 490 aa  349  8e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.761759  normal  0.250853 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0577  cobyric acid synthase  43.44 
 
 		 490 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1739  cobyric acid synthase CobQ  39.31 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0175478 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  38.94 
 
 		 503 aa  347  2e-94  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  45.72 
 
 		 490 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  43.47 
 
 		 484 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  44.03 
 
 		 487 aa  347  4e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  40.99 
 
 		 560 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  41.12 
 
 		 514 aa  346  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  40.97 
 
 		 485 aa  346  7e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  44.89 
 
 		 498 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  41.17 
 
 		 526 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  42.18 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  40.73 
 
 		 556 aa  345  1e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3554  cobyric acid synthase CobQ  40.9 
 
 		 863 aa  344  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235354  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  44.09 
 
 		 484 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  38.75 
 
 		 503 aa  343  5e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2747  cobyric acid synthase CobQ  42.55 
 
 		 502 aa  343  5e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.230019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  41.36 
 
 		 565 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0385  cobyric acid synthase  40.76 
 
 		 490 aa  343  5e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  41.08 
 
 		 534 aa  342  7e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  40.31 
 
 		 500 aa  342  9e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  42.94 
 
 		 486 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3679  cobyric acid synthase CobQ  40.7 
 
 		 863 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1051  cobyric acid synthase  41.12 
 
 		 489 aa  340  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  43.36 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  45.7 
 
 		 481 aa  339  9e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  45.87 
 
 		 545 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  43.16 
 
 		 486 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  43.6 
 
 		 483 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>