More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1602 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1903  AMP-dependent synthetase and ligase  68.17 
 
 		 599 aa  775    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1602  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 578 aa  1175    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.484756 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0009  amino acid adenylation  46.88 
 
 		 2791 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0712365 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  45.8 
 
 		 1656 aa  505  9.999999999999999e-143  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5757  amino acid adenylation domain protein  46.71 
 
 		 2997 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1746  AMP-dependent synthetase and ligase  45.75 
 
 		 592 aa  492  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.689088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2736  AMP-dependent synthetase and ligase  43.23 
 
 		 611 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1972  AMP-dependent synthetase and ligase  42.13 
 
 		 614 aa  482  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.848837 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3741  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 725 aa  479  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.101405 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  45.05 
 
 		 2762 aa  478  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3687  AMP-dependent synthetase and ligase  42.71 
 
 		 725 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6170  thioester reductase domain protein  44.89 
 
 		 1067 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701835  normal  0.0189941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2876  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 586 aa  459  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.359525 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  43.55 
 
 		 1474 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1856  AMP-dependent synthetase and ligase  43.89 
 
 		 579 aa  454  1.0000000000000001e-126  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3181  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 		 596 aa  452  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.111663 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  45.67 
 
 		 6403 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  46.18 
 
 		 4342 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  44.31 
 
 		 4342 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  44.6 
 
 		 2103 aa  429  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5330  AMP-dependent synthetase and ligase  43.33 
 
 		 608 aa  431  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.611061 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  43.87 
 
 		 4332 aa  426  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2108  amino acid adenylation domain-containing protein  44.06 
 
 		 2820 aa  426  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  43.29 
 
 		 4317 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3680  amino acid adenylation domain protein  43.53 
 
 		 2721 aa  422  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  42.93 
 
 		 4317 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1649  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 602 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.443768 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  42.93 
 
 		 4317 aa  420  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4074  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 597 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  40.28 
 
 		 597 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2154  hypothetical protein  40.93 
 
 		 581 aa  415  1e-114  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  43.29 
 
 		 4317 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2453  putative acyl-CoA synthase  38.54 
 
 		 588 aa  414  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0769746  normal  0.973713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  45.37 
 
 		 4318 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2181  hypothetical protein  40.64 
 
 		 581 aa  411  1e-113  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2943  Acyl-CoA synthetases  43.03 
 
 		 617 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2109  AMP-dependent synthetase and ligase  39.93 
 
 		 991 aa  412  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.911479  normal  0.633615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  42.86 
 
 		 4336 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1161  saframycin Mx1 synthetase B  42.86 
 
 		 617 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2789  AMP-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 617 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  43.16 
 
 		 4336 aa  405  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3458  amino acid adenylation domain protein  44.01 
 
 		 2250 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000913323 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1800  AMP-binding domain-containing protein  43.88 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1016  AMP-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 599 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.322447  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0293  AMP-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 599 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117519  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0277  AMP-binding domain-containing protein  43.59 
 
 		 599 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.48343  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0276  AMP-binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 620 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6306  AMP-dependent synthetase and ligase  40.66 
 
 		 595 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.580679 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1302  AMP-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 610 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.679407  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1714  AMP-binding domain-containing protein  43.59 
 
 		 610 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399616  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  45.08 
 
 		 3208 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1218  AMP-binding domain-containing protein  43.72 
 
 		 606 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1930  AMP-binding domain-containing protein  40.63 
 
 		 1323 aa  386  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.301565  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0658  acyl-CoA dehydrogenase  40.98 
 
 		 1283 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.523537  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  42.78 
 
 		 6889 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  43.57 
 
 		 1801 aa  384  1e-105  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0750  acyl-CoA dehydrogenase  40.98 
 
 		 1291 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5528  AMP-dependent synthetase and ligase  41.18 
 
 		 1272 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0999  AMP-dependent synthetase and ligase  42.4 
 
 		 706 aa  384  1e-105  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.771586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2039  polyketide synthase  41.13 
 
 		 1276 aa  382  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  39.21 
 
 		 3231 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2099  AMP-binding domain-containing protein  40.95 
 
 		 622 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.335161  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3363  AMP-dependent synthetase and ligase  41.68 
 
 		 701 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.826515 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0523  AMP-binding enzyme  41.39 
 
 		 621 aa  376  1e-103  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.746199  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4518  non-ribosomal peptide synthetase, initiating component  37.54 
 
 		 1753 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1459  AMP-binding domain-containing protein  40.87 
 
 		 621 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1849  AMP-binding domain-containing protein  41.22 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0427  AMP-binding enzyme  41.22 
 
 		 621 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0838  AMP-binding domain-containing protein  40.87 
 
 		 621 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8830  peptide synthetase  42.3 
 
 		 574 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426227  decreased coverage  0.000549729 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2154  AMP-binding domain-containing protein  40.87 
 
 		 621 aa  372  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2367  dihydroaeruginoic acid synthetase  42.22 
 
 		 1699 aa  372  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.71689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6561  AMP-binding domain-containing protein  41.08 
 
 		 609 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0102107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  40.14 
 
 		 1779 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_003296  RS01920  putative transmembrane protein  38.78 
 
 		 559 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.467911  normal  0.0185745 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0181  peptide synthetase NRPS5-4-3  41.36 
 
 		 1005 aa  365  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.757784  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1670  AMP-binding domain-containing protein  42.66 
 
 		 605 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5768  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 1292 aa  368  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1588  AMP-binding domain-containing protein  42.83 
 
 		 605 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  41.21 
 
 		 1776 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7308  polyketide synthetase  42.16 
 
 		 755 aa  363  6e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.39684  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2989  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 593 aa  362  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204097  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0272  acyl-CoA synthetase  38.5 
 
 		 573 aa  360  3e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.984727  normal  0.936672 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3127  acyl-CoA synthetase  37.63 
 
 		 576 aa  360  5e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.274694  normal  0.640606 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11209  acyl-CoA synthetase  38.14 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  39.03 
 
 		 1789 aa  357  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1168  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.57 
 
 		 629 aa  355  1e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  39.79 
 
 		 3235 aa  355  1e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11554  acyl-CoA synthetase  37.41 
 
 		 583 aa  353  4e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12944  acyl-CoA synthetase  37.95 
 
 		 626 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0433  AMP-binding enzyme family protein  37.14 
 
 		 559 aa  353  5e-96  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12964  acyl-CoA synthetase  37.01 
 
 		 619 aa  353  5e-96  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1754  acyl-CoA synthetase  37.14 
 
 		 564 aa  353  5.9999999999999994e-96  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0237  acyl-CoA synthetase  37.57 
 
 		 590 aa  352  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.114716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5641  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.46 
 
 		 629 aa  351  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0247  acyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 590 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0257  acyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 590 aa  350  3e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3104  acyl-CoA synthetase  36.67 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3396  acyl-CoA synthetase  37.44 
 
 		 592 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.733588  normal  0.231896 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3164  acyl-CoA synthetase  36.67 
 
 		 601 aa  348  2e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254716  normal  0.383191 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>