More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0550 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0550  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
391 aa  783    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000102779  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0337  glycosyl transferase family 2  48.62 
 
 
349 aa  350  3e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0335  glycosyl transferase family 2  52 
 
 
346 aa  346  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0167  glycosyl transferase family 2  40.72 
 
 
365 aa  227  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00277804  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2585  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2639  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
375 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0386  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 
393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.737923  normal  0.151625 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1158  glycosyl transferase family protein  31.01 
 
 
403 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2356  glycosyl transferase family protein  33.43 
 
 
380 aa  150  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0774  glycosyl transferase family protein  27.09 
 
 
385 aa  140  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00080815  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0372  glycosyl transferase family 2  29.26 
 
 
381 aa  139  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0194499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0242  glycosyl transferase  33.59 
 
 
378 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
357 aa  136  6.0000000000000005e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0385  family 2 glycosyl transferase  33.76 
 
 
362 aa  133  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.361045  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  28.98 
 
 
402 aa  132  9e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2222  glycosyl transferase family 2  28.65 
 
 
384 aa  132  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0674  glycosyl transferase family 2  33.61 
 
 
382 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1491  glycosyl transferase family 2  30.7 
 
 
355 aa  129  8.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000591503 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0212  glycosyl transferase  25.91 
 
 
382 aa  123  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000843162  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3925  glycosyl transferase family 2  33.2 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.207175  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3434  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 
386 aa  120  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3743  glycosyl transferase family 2  35.34 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178999  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1994  glycosyl transferase family 2  30.08 
 
 
383 aa  119  7.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.713499 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3630  glycosyl transferase family 2  35.41 
 
 
386 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0987324  normal  0.0592371 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3292  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
379 aa  116  6e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5029  glycosyl transferase family protein  33.88 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0141962  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0991  glycosyl transferase family protein  29.59 
 
 
407 aa  108  2e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2168  glycosyl transferase family 2  28.77 
 
 
391 aa  106  7e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1835  glycosyl transferase family protein  26.65 
 
 
395 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3247  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 
375 aa  103  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14939  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3224  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
367 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.210562  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3474  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
375 aa  102  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.288784  normal  0.0309659 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17181  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
407 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.793323 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1512  glycosyl transferase family protein  31.23 
 
 
397 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.342198  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 
395 aa  100  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04191  hypothetical protein  29.36 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5123  glycosyl transferase family protein  27.93 
 
 
441 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354278  normal  0.0746579 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1512  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 
396 aa  96.7  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00217287  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0427  family 2 glycosyl transferase  33.18 
 
 
388 aa  96.3  8e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1665  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
401 aa  95.1  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2824  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 
375 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20620  Glycosyl transferase, family 2  29.13 
 
 
368 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.268109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0065  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  26.21 
 
 
398 aa  93.2  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0952  glycosyl transferase family 2  29.7 
 
 
377 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3101  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
396 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1868  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
369 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2307  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
360 aa  91.3  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3158  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 
364 aa  89.4  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3832  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.956349  normal  0.0237391 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2431  glycosyl transferase family 2  26.18 
 
 
397 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0120  glycosyl transferase family protein  27.72 
 
 
375 aa  86.7  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2509  glycosyl transferase family 2  28 
 
 
408 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.790074 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.56 
 
 
347 aa  84.7  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2236  glycosyl transferase family 2  25.74 
 
 
343 aa  84.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.92469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2547  glycosyl transferase family 2  23.42 
 
 
378 aa  84.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1372  glycosyl transferase family protein  30.92 
 
 
397 aa  84  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.704698  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0266  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.52 
 
 
408 aa  84  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0443  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.52 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000679717 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4598  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  30.52 
 
 
400 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.617719  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1462  putative glycosyltransferase  25.51 
 
 
401 aa  80.1  0.00000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000046931  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3050  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  27.41 
 
 
397 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.824313 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2496  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
378 aa  79  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000682881  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4672  glycosyl transferase family protein  29.69 
 
 
399 aa  77.8  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4949  glycosyl transferase family 2  27.19 
 
 
385 aa  77.4  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000550956  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4129  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  23.94 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  23.6 
 
 
535 aa  73.2  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1829  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  24.69 
 
 
398 aa  73.2  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2174  polysaccharide-forming b-glycosyltransferase-like protein  31.6 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.486335 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0749  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
410 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.702214  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2026  glycosyl transferase family 2  28.79 
 
 
384 aa  71.2  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5703  glycosyl transferase family protein  26.09 
 
 
454 aa  70.9  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0459973  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  28.12 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0402  glycosyl transferase family 2  29.69 
 
 
359 aa  68.9  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.20489 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4242  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.77 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4304  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.77 
 
 
397 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.131281 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1385  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1340  glycosyl transferase family protein  27.21 
 
 
318 aa  68.2  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275627  normal  0.171595 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1271  glycosyltransferase  30.95 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0885  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000118125 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0506  glycosyl transferase  25.61 
 
 
332 aa  66.6  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.641026  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0648  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
340 aa  67  0.0000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  30.37 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7038  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.31 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000681734 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4875  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 
395 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.596859  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2450  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.89 
 
 
376 aa  66.6  0.0000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2496  glycosyltransferase  30.3 
 
 
313 aa  66.2  0.0000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00712188  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5422  hopene-associated glycosyltransferase HpnB  25.09 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4171  family 2 glycosyl transferase  24.9 
 
 
380 aa  66.2  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147106  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2926  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.78 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.896752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4896  glycosyl transferase family protein  26.14 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  35.57 
 
 
255 aa  65.5  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5309  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.286135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5551  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 
395 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0203  glycosyl transferase family protein  26.52 
 
 
314 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3051  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.21 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.074487  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1283  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.21 
 
 
396 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
324 aa  64.3  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0796  glycosyl transferase family 2  28.39 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.048346  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1623  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.54 
 
 
345 aa  64.7  0.000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>