30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0034 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0034  rubrerythrin  100 
 
 		 159 aa  321  3e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.475045  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0591  rubrerythrin  48.75 
 
 		 157 aa  147  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0936  rubrerythrin  53.52 
 
 		 142 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.645218  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0914  rubrerythrin  52.82 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1189  rubrerythrin  39.86 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00116274  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1266  rubrerythrin  39.19 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0248783  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03930  Rubrerythrin  35.76 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0777  Rubrerythrin  31.97 
 
 		 159 aa  72  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.287407  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3220  rubrerythrin  33.55 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.580262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0191  Rubrerythrin  28.21 
 
 		 159 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2310  Rubrerythrin  28.21 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0829  rubrerythrin  34.87 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000321469  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2151  rubrerythrin  32.67 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000169243  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0852  rubrerythrin  34.21 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0126765  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3533  rubrerythrin  28.76 
 
 		 161 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0328  hypothetical protein  23.87 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.605498 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1557  Rubrerythrin  26.8 
 
 		 161 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0855  Rubrerythrin  28.86 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.445183  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0765  rubrerythrin  31.5 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.000572509  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2140  Rubrerythrin  28.17 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00886688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1560  Rubrerythrin  27.97 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.558156 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0832  hypothetical protein  22.58 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.215881  normal  0.722102 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1188  Rubrerythrin  26.06 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20623  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0941  rubrerythrin  24.83 
 
 		 153 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00913013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0235  rubrerythrin  25.66 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000107952  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1214  hypothetical protein  21.71 
 
 		 155 aa  41.6  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.857384  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1416  Rubrerythrin  26.57 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.10412e-25 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  24.48 
 
 		 1011 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  24.48 
 
 		 1011 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  24.48 
 
 		 1008 aa  40.4  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>