31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4114 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  100 
 
 		 832 aa  1719    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  56.51 
 
 		 627 aa  741    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  55.22 
 
 		 838 aa  944    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  28.48 
 
 		 722 aa  212  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  27.52 
 
 		 801 aa  202  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  25.96 
 
 		 839 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  25.08 
 
 		 965 aa  179  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  25.72 
 
 		 951 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  24.33 
 
 		 1011 aa  154  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  25.18 
 
 		 580 aa  141  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  25.31 
 
 		 648 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  24.95 
 
 		 791 aa  134  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  23.96 
 
 		 788 aa  121  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  23.12 
 
 		 2286 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  24.07 
 
 		 789 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  23.21 
 
 		 677 aa  106  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  22.79 
 
 		 563 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  23.64 
 
 		 1121 aa  97.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  25 
 
 		 1049 aa  92  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  25.07 
 
 		 709 aa  75.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4020  protein of unknown function DUF718  31.13 
 
 		 112 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  22.29 
 
 		 708 aa  62.4  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2936  hypothetical protein  25.52 
 
 		 1022 aa  59.3  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.897534 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1991  protein of unknown function DUF718  27.36 
 
 		 110 aa  58.9  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.893292 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  37.97 
 
 		 689 aa  55.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  19.09 
 
 		 752 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  20.65 
 
 		 644 aa  52  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2046  hypothetical protein  26.61 
 
 		 110 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5741  protein of unknown function DUF718  25.47 
 
 		 109 aa  51.6  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0374824 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0112  hypothetical protein  28.93 
 
 		 1024 aa  50.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0643  hypothetical protein  23.16 
 
 		 119 aa  46.2  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.198224  normal  0.98044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>