More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2402 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
634 aa  1300  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08811  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  69.87 
 
 
623 aa  758  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.77 
 
 
584 aa  803  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.16 
 
 
625 aa  588  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.77 
 
 
581 aa  576  1e-163  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_002950  PG0086  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.43 
 
 
604 aa  550  1e-155  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.389821 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.11 
 
 
541 aa  404  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.28 
 
 
546 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.07 
 
 
541 aa  398  1e-109  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  4.40496e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.46 
 
 
546 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.97 
 
 
529 aa  380  1e-104  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.43 
 
 
571 aa  378  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.66 
 
 
538 aa  379  1e-103  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.16 
 
 
559 aa  373  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  35.53 
 
 
579 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  36.1 
 
 
656 aa  373  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4470  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.07 
 
 
564 aa  369  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.230893 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.8 
 
 
550 aa  367  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.55 
 
 
539 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  9.55018e-07  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.5 
 
 
530 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.02 
 
 
530 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.41 
 
 
528 aa  363  6e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  1.09109e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.41 
 
 
528 aa  363  6e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  6.67125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.38 
 
 
530 aa  357  4e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  36.31 
 
 
574 aa  357  4e-97  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001525  cold-shock DEAD-box protein A  37.45 
 
 
644 aa  357  5e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  7.9582e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.88 
 
 
532 aa  355  9e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.16 
 
 
584 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.89 
 
 
527 aa  355  2e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.71221e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  45.6 
 
 
614 aa  354  2e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.36 
 
 
557 aa  354  3e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.36 
 
 
557 aa  354  3e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  37.36 
 
 
557 aa  354  3e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.83 
 
 
530 aa  353  4e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  3.41148e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.55 
 
 
583 aa  353  8e-96  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.98 
 
 
550 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.33 
 
 
533 aa  352  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.6 
 
 
498 aa  351  2e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0681922  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2109  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.81 
 
 
570 aa  351  3e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.17 
 
 
532 aa  350  5e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  36.26 
 
 
572 aa  349  9e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  34.13 
 
 
589 aa  348  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.98 
 
 
602 aa  349  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.39 
 
 
466 aa  347  4e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.39 
 
 
531 aa  346  8e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.95 
 
 
565 aa  345  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.3 
 
 
595 aa  345  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.79 
 
 
467 aa  344  2e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.49 
 
 
514 aa  345  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.17 
 
 
589 aa  344  3e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.07 
 
 
538 aa  344  3e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3342  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.66 
 
 
607 aa  344  3e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  5.02308e-05  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.34 
 
 
511 aa  343  4e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  43.31 
 
 
529 aa  343  4e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.07 
 
 
525 aa  343  6e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.07 
 
 
525 aa  343  6e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  43.07 
 
 
528 aa  342  1e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.16 
 
 
543 aa  342  1e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.07 
 
 
528 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  43.31 
 
 
533 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  43.07 
 
 
528 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  43.07 
 
 
528 aa  342  1e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  43.31 
 
 
528 aa  342  1e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.58 
 
 
527 aa  342  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  34.55 
 
 
641 aa  342  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.9 
 
 
606 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1477  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.26 
 
 
559 aa  340  6e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09353  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  44.84 
 
 
372 aa  339  1e-91  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170333  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  39.6 
 
 
579 aa  338  2e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3847  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.44 
 
 
559 aa  337  3e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.460611  normal  0.310213 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1868  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35.44 
 
 
559 aa  337  3e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0935982  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11279  cold-shock deaD-box protein A deaD (ATP-dependent RNA helicase)  43.36 
 
 
563 aa  337  3e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.89 
 
 
664 aa  337  4e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.89 
 
 
664 aa  337  4e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.43 
 
 
653 aa  337  4e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.74 
 
 
610 aa  337  5e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4337  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.5 
 
 
485 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.590668 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4277  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.5 
 
 
485 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.86 
 
 
595 aa  337  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.7314e-06  decreased coverage  1.37402e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.6 
 
 
599 aa  336  6e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.68 
 
 
581 aa  336  6e-91  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.16 
 
 
646 aa  336  7e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.61 
 
 
632 aa  336  7e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.57 
 
 
643 aa  336  8e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3987  DEAD/DEAH box helicase-like  34.48 
 
 
557 aa  336  9e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.02 
 
 
560 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31662  normal  0.276111 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1307  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.23 
 
 
657 aa  335  2e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.398232  normal  0.396333 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.49 
 
 
611 aa  335  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.65 
 
 
664 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.24 
 
 
634 aa  334  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  42.07 
 
 
591 aa  334  3e-90  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  41.54 
 
 
640 aa  334  4e-90  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.63 
 
 
747 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  44 
 
 
530 aa  333  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.32 
 
 
590 aa  333  6e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.44 
 
 
655 aa  333  8e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.75 
 
 
599 aa  333  8e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.49 
 
 
623 aa  332  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0430  ATP-dependent RNA helicase DeaD  41.97 
 
 
663 aa  332  1e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0524797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.38 
 
 
694 aa  332  1e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>