More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1359 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_1359  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 123 aa  251  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.131607  normal  0.428483 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1332  GntR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0185  GntR family transcriptional regulator  51.26 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2609  transcriptional regulator, GntR family  46.28 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2889  transcriptional regulator, GntR family  54.55 
 
 		 123 aa  122  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4757  transcriptional regulator, GntR family  49.54 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1337  transcriptional regulator, GntR family  50.44 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04510  regulatory protein GntR HTH  41.88 
 
 		 127 aa  112  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39240  transcriptional regulator, GntR family  46.49 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2324  putative transcriptional regulator  45.37 
 
 		 126 aa  107  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.665788  hitchhiker  0.000002965 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0676  transcriptional regulator, GntR family  52.73 
 
 		 119 aa  107  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0188  transcriptional regulator, GntR family  46.55 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2945  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315023  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2657  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000366094  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2634  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00782758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2712  GntR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.902974  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2908  putative transcriptional regulator  45.37 
 
 		 126 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000437446 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1559  transcriptional regulator, GntR family  42.48 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06980  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02920  predicted transcriptional regulator  42.2 
 
 		 119 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4731  transcriptional regulator, GntR family  42.2 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0274  transcriptional regulator, GntR family  38.02 
 
 		 141 aa  97.1  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1206  GntR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 119 aa  94.7  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0894307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2569  transcriptional regulator, GntR family  44.23 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  0.172814 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0413  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 120 aa  90.5  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.126119  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0486  transcriptional regulator, GntR family  43.27 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.78271 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2708  transcriptional regulator  48.75 
 
 		 90 aa  85.9  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.159908  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1007  GntR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 123 aa  83.6  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1106  transcriptional regulator, GntR family  37.4 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.866665  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0996  transcriptional regulator, GntR family  35.04 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.467589 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3111  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04760  predicted transcriptional regulator  33.98 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.467802 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000965  transcriptional regulator GntR family  37.37 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2647  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0423424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3323  transcriptional regulator, GntR family  35.51 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4146  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3833  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4186  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4209  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000240895  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1052  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00681455 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4098  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 139 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.57441e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1472  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3936  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.105249 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1209  transcriptional regulator, GntR family  38.66 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0188078 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07005  hypothetical protein  36.36 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3817  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1077  regulatory protein GntR HTH  33.62 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1407  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.378384  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1271  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1243  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.151316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1245  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1373  GntR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1445  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000575051 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1514  transcriptional regulator, GntR family  31.9 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3987  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.142638  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4298  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4553  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0107  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3907  GntR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2775  regulatory protein GntR HTH  32.5 
 
 		 139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.233655  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1278  GntR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0107112  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24450  transcriptional regulator, GntR family  35.29 
 
 		 117 aa  72.4  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.498075 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1388  transcriptional regulator, GntR family  38.14 
 
 		 117 aa  71.2  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.14957 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1173  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.497772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0823  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.609388  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1122  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03590  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.325087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0076  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3223  regulatory protein GntR HTH  37.04 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0952  GntR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.091739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5187  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 248 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 243 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3525  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0631  transcriptional regulator, GntR family  33.88 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1272  GntR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6591  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.30942  normal  0.691161 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0075  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0073  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0077  GntR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7289  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4863  GntR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 125 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2248  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 128 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2239  GntR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 243 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0051  transcriptional regulator protein-like protein  43.48 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2337  transcriptional regulator, GntR family  28.83 
 
 		 119 aa  62.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1919  transcriptional regulator, GntR family  30.17 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0164  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0366  transcriptional regulator, GntR family  33.06 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0389778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2604  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2455  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2620  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0363096  normal  0.140863 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0983  transcriptional regulator, GntR family  31.03 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.589571  hitchhiker  0.00477023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0072  GntR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3347  transcriptional regulator  38.36 
 
 		 500 aa  60.8  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5849  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 241 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.499759  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0160  GntR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000659048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>