More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0076 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5005  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  3.71844e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4060  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.41116e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3970  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  8.28024e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0076  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  8.49285e-06  hitchhiker  1.61628e-06 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4136  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  100 
 
 
269 aa  554  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  8.71365e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03444  hypothetical protein  99.63 
 
 
269 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00504233  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03492  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  99.63 
 
 
269 aa  553  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00433558  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3844  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  99.63 
 
 
269 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.02005e-16  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0070  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  99.63 
 
 
269 aa  553  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00858253  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4052  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  94.8 
 
 
269 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.631798  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4006  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  94.42 
 
 
269 aa  528  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.151676  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3925  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  94.42 
 
 
269 aa  527  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0210265  hitchhiker  0.00152732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3943  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  94.42 
 
 
269 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0140638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4113  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  94.05 
 
 
269 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0303981  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0104  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  92.57 
 
 
269 aa  516  1e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00316488  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0064  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  80.22 
 
 
269 aa  446  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.68259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4152  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  80.22 
 
 
269 aa  446  1e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.25921e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0058  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  80.22 
 
 
269 aa  446  1e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  2.84892e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4839  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  76.95 
 
 
269 aa  431  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  5.2182e-05  hitchhiker  3.79227e-05 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4387  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  75.84 
 
 
269 aa  427  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00707476  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4097  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  75.09 
 
 
269 aa  419  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0739878  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3957  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  73.98 
 
 
269 aa  409  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0162  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  72.76 
 
 
269 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.433253  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0177  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  61.34 
 
 
269 aa  346  2e-94  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2602  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  61.19 
 
 
269 aa  338  6e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  3.59326e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00657  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  58.74 
 
 
269 aa  336  2e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0158  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  60.45 
 
 
272 aa  335  4e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0188  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  60.45 
 
 
272 aa  335  4e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000318061  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001817  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  57.99 
 
 
269 aa  326  2e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000220306  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1921  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  58.3 
 
 
280 aa  326  3e-88  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0146  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.51 
 
 
270 aa  322  4e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.15517  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.51 
 
 
271 aa  313  2e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.481524 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4761  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.3 
 
 
270 aa  312  3e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0890871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4104  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.93 
 
 
271 aa  312  3e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0414  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.3 
 
 
270 aa  311  7e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3681  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  54.61 
 
 
271 aa  311  1e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.25443e-06  normal  0.0260006 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4726  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.76 
 
 
271 aa  309  3e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0210  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.3 
 
 
271 aa  309  4e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3886  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.93 
 
 
271 aa  306  3e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3924  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.56 
 
 
271 aa  306  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132547  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3690  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.76 
 
 
271 aa  305  4e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2648  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  54.44 
 
 
271 aa  305  6e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00588455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0117  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.19 
 
 
273 aa  303  2e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00226258  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3749  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.33 
 
 
270 aa  302  3e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00058  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.39 
 
 
269 aa  302  3e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5351  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.39 
 
 
270 aa  302  5e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364996  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3072  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.46 
 
 
271 aa  302  5e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0053  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.7 
 
 
270 aa  301  7e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0620574 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0078  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.53 
 
 
271 aa  301  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1621  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.2 
 
 
275 aa  300  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.39022  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03400  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  56.3 
 
 
282 aa  300  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00363262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04670  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  54.81 
 
 
270 aa  300  2e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0450  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  54.81 
 
 
270 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4197  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.56 
 
 
270 aa  297  1e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5175  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  57.41 
 
 
270 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2023  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.56 
 
 
281 aa  296  2e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  5.8867e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4999  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  57.41 
 
 
270 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5125  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  57.41 
 
 
270 aa  296  2e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4084  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.76 
 
 
271 aa  295  4e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3974  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.76 
 
 
271 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.715653 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3881  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.76 
 
 
271 aa  295  4e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2378  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.7 
 
 
270 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.067562 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2758  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.7 
 
 
270 aa  295  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4324  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.76 
 
 
271 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0075  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.76 
 
 
271 aa  294  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.495543  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0340  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  57.04 
 
 
270 aa  293  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4269  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.39 
 
 
271 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4464  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  55.39 
 
 
271 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0212  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.48 
 
 
271 aa  289  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0404302  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2649  formamidopyrimidine-DNA glycosylase / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.71 
 
 
277 aa  289  3e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.849612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0051  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.33 
 
 
270 aa  289  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03200  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.4 
 
 
271 aa  288  5e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1864  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.66 
 
 
271 aa  287  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00234848  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0631  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.03 
 
 
272 aa  285  6e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  2.58604e-07 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0616  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.59 
 
 
274 aa  284  1e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0319  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  51.66 
 
 
271 aa  283  2e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0599  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.85 
 
 
274 aa  282  3e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0582  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.84 
 
 
272 aa  282  4e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.985563  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0686  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.55 
 
 
279 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.375563  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0045  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.74 
 
 
270 aa  280  2e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.890377  normal  0.0669728 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0346  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  50.53 
 
 
284 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3674  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.89 
 
 
271 aa  276  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000210718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2000  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  53.51 
 
 
271 aa  273  1e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0383  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.11 
 
 
270 aa  273  2e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.428685  normal  0.0194534 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0055  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.11 
 
 
271 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0268618  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0143  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.11 
 
 
271 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.497786  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0045  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.11 
 
 
271 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0126  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  51.11 
 
 
271 aa  273  3e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.270322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0997  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  49.82 
 
 
271 aa  270  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2969  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / formamidopyrimidine-DNA glycosylase  52.57 
 
 
281 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.158324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0293  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.31 
 
 
297 aa  266  2e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2809  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.55 
 
 
327 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.509467  normal  0.957052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2184  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.55 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.338547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2798  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.55 
 
 
275 aa  263  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0319  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  49.1 
 
 
276 aa  263  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0479  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  49.82 
 
 
276 aa  262  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1622  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.39 
 
 
278 aa  263  3e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.414092  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0517  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.55 
 
 
275 aa  262  4e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.501091  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2716  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.91 
 
 
275 aa  262  5e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371452  normal  0.175182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2858  formamidopyrimidine-DNA glycosylase  48.91 
 
 
284 aa  261  6e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>