More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0065 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3857  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3982  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182363  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03455  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4097  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4149  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.375876  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5018  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0059  protein of unknown function UPF0126  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03503  conserved inner membrane protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0065  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  401  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0883885  hitchhiker  0.000264981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3955  inner membrane protein YicG  94.15 
 
 
205 aa  356  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4064  hypothetical protein  94.15 
 
 
205 aa  356  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3946  inner membrane protein YicG  94.15 
 
 
205 aa  356  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000186378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4018  inner membrane protein YicG  94.15 
 
 
205 aa  356  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4125  inner membrane protein YicG  94.15 
 
 
205 aa  356  1e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0094  hypothetical protein  86.83 
 
 
205 aa  346  2e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4863  hypothetical protein  75.12 
 
 
205 aa  288  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0043  hypothetical protein  73.66 
 
 
205 aa  281  5e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4174  hypothetical protein  73.17 
 
 
205 aa  278  4e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.627969  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0409  hypothetical protein  62.8 
 
 
223 aa  263  1e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2169  inner membrane protein  58.79 
 
 
213 aa  241  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4692  hypothetical protein  56.93 
 
 
203 aa  239  3e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4901  hypothetical protein  56.93 
 
 
203 aa  239  3e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4777  hypothetical protein  56.93 
 
 
203 aa  239  3e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.470301  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4342  hypothetical protein  56.16 
 
 
206 aa  238  6e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50920  hypothetical protein  56.16 
 
 
206 aa  238  6e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  4.28082e-05 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1076  hypothetical protein  59.3 
 
 
210 aa  237  8e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.118965  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1491  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0126 domain protein)  59.41 
 
 
208 aa  234  9e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0565  hypothetical protein  55.94 
 
 
203 aa  224  7e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4953  hypothetical protein  57.43 
 
 
203 aa  224  9e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58893  normal  0.356767 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3015  hypothetical protein  55.5 
 
 
213 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00092658  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1348  protein of unknown function UPF0126  55.5 
 
 
213 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.028372  hitchhiker  4.18622e-11 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002864  hypothetical protein  54.63 
 
 
207 aa  223  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0621  hypothetical protein  58.79 
 
 
210 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.154187  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0696  hypothetical protein  58.79 
 
 
210 aa  223  1e-57  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.264493  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3342  hypothetical protein  55.22 
 
 
213 aa  223  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03112  hypothetical protein  55.39 
 
 
207 aa  223  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3173  hypothetical protein  55.5 
 
 
213 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000247135  hitchhiker  0.00171322 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3030  hypothetical protein  55.5 
 
 
213 aa  223  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  8.14353e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4949  hypothetical protein  55.94 
 
 
203 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1203  hypothetical protein  55.22 
 
 
213 aa  222  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00337207  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1274  hypothetical protein  55.22 
 
 
213 aa  222  3e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  8.81867e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1204  hypothetical protein  54.73 
 
 
213 aa  221  6e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0582912  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2677  hypothetical protein  55.33 
 
 
217 aa  220  1e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0757609  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1698  hypothetical protein  56.86 
 
 
207 aa  219  2e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.968956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3609  protein of unknown function UPF0126  53.66 
 
 
205 aa  219  2e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0516  hypothetical protein  57 
 
 
203 aa  217  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292821  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4643  hypothetical protein  50.25 
 
 
222 aa  214  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.465258  hitchhiker  1.35142e-05 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3213  hypothetical protein  50.5 
 
 
222 aa  211  7e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.142503  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1963  protein of unknown function UPF0126  52.76 
 
 
206 aa  209  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2205  protein of unknown function UPF0126  50.99 
 
 
206 aa  207  6e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2271  protein of unknown function UPF0126  51.26 
 
 
208 aa  205  3e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2651  hypothetical protein  51.23 
 
 
209 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1154  hypothetical protein  54.23 
 
 
217 aa  202  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  7.36449e-05  decreased coverage  0.00491561 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1975  hypothetical protein  51.26 
 
 
208 aa  203  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2782  hypothetical protein  51.23 
 
 
209 aa  202  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1925  protein of unknown function UPF0126  49.75 
 
 
221 aa  200  9e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.293992  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1797  hypothetical protein  49.75 
 
 
221 aa  200  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1246  hypothetical protein  53.92 
 
 
215 aa  196  2e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0111602  normal  0.59832 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1141  hypothetical protein  52.5 
 
 
212 aa  196  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0103239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1346  hypothetical protein  55.39 
 
 
213 aa  189  3e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000407033  decreased coverage  4.05781e-07 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3333  hypothetical protein  45.32 
 
 
203 aa  188  4e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152297  hitchhiker  0.00250562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4832  hypothetical protein  44.9 
 
 
203 aa  182  2e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5437  hypothetical protein  44.39 
 
 
203 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.410066  normal  0.746562 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5425  hypothetical protein  44.39 
 
 
203 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175099  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0215  hypothetical protein  44.9 
 
 
203 aa  181  5e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.691618 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2463  hypothetical protein  50.75 
 
 
203 aa  178  5e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000441132  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5321  hypothetical protein  43.84 
 
 
203 aa  178  5e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4778  hypothetical protein  44.33 
 
 
203 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908441  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0596  hypothetical protein  48.28 
 
 
212 aa  176  3e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2745  hypothetical protein  49.02 
 
 
209 aa  175  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0433  hypothetical protein  42.57 
 
 
202 aa  174  6e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2144  hypothetical protein  42.57 
 
 
202 aa  174  1e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0831  hypothetical protein  42.57 
 
 
202 aa  173  2e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.144812  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0340  hypothetical protein  42.57 
 
 
202 aa  173  2e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.631596  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1122  hypothetical protein  42.57 
 
 
202 aa  173  2e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218904  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1831  hypothetical protein  42.57 
 
 
202 aa  173  2e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.110728  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1774  hypothetical protein  42.57 
 
 
202 aa  173  2e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5014  hypothetical protein  43.35 
 
 
214 aa  147  1e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.44242 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1131  hypothetical protein  41.67 
 
 
208 aa  147  1e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.27537  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1380  hypothetical protein  41.71 
 
 
204 aa  145  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0997848  normal  0.891474 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1214  hypothetical protein  41.15 
 
 
211 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0437214 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3055  hypothetical protein  41.09 
 
 
208 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3140  protein of unknown function UPF0126  40.5 
 
 
208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.196277  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1173  hypothetical protein  40.5 
 
 
208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0855437  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1217  hypothetical protein  40.5 
 
 
208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.595992  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1250  hypothetical protein  40.5 
 
 
208 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.367053  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1112  hypothetical protein  39.58 
 
 
208 aa  143  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1319  hypothetical protein  40.2 
 
 
208 aa  143  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2877  hypothetical protein  40.59 
 
 
208 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0329871  hitchhiker  0.000226111 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2959  hypothetical protein  40.59 
 
 
208 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.636887  normal  0.0284758 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2804  hypothetical protein  42.42 
 
 
208 aa  141  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.549695  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0698  protein of unknown function UPF0126  36.98 
 
 
203 aa  141  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.495455  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1024  hypothetical protein  38.89 
 
 
206 aa  140  2e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0468656  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2812  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  137  8e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2235  hypothetical protein  36 
 
 
200 aa  137  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.147836  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0852  hypothetical protein  40.51 
 
 
207 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2969  hypothetical protein  40.4 
 
 
208 aa  136  3e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.59212  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0998  hypothetical protein  38.54 
 
 
207 aa  134  1e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2350  hypothetical protein  39.7 
 
 
207 aa  129  2e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150454  hitchhiker  0.00895518 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0791  hypothetical protein  36.73 
 
 
211 aa  129  2e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>