More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00631 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01332  asparagine synthetase B  75.63 
 
 
554 aa  905  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0082  asparagine synthetase B  60.78 
 
 
563 aa  676  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.645286  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0577  asparagine synthetase B  99.28 
 
 
554 aa  1153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  6.44319e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0512  asparagine synthetase B  75.45 
 
 
554 aa  904  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01146  asparagine synthetase B  59.54 
 
 
564 aa  661  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157729  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2955  asparagine synthetase B  71.71 
 
 
556 aa  863  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0286169  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3001  asparagine synthetase B  90.97 
 
 
554 aa  1069  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000338929  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1280  asparagine synthetase B  60.43 
 
 
563 aa  655  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.613021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2251  asparagine synthetase B  66.67 
 
 
558 aa  789  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.17923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0739  asparagine synthetase B  94.95 
 
 
554 aa  1110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000246086  normal  0.581631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0799  asparagine synthetase B  94.77 
 
 
554 aa  1104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0390741  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0835  asparagine synthetase B  95.13 
 
 
554 aa  1110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.897937  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0096  asparagine synthetase B  60.61 
 
 
563 aa  675  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2749  asparagine synthetase B  70.02 
 
 
557 aa  827  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0661444  normal  0.0184808 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0693  asparagine synthetase B  99.82 
 
 
554 aa  1156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.80701e-09  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0717  asparagine synthetase B  100 
 
 
554 aa  1158  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.80527e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0699  asparagine synthetase B  99.64 
 
 
554 aa  1155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.94525e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1838  asparagine synthetase B  69.68 
 
 
553 aa  829  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1222  asparagine synthetase B  92.6 
 
 
554 aa  1083  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  8.23611e-06  normal  0.0246251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2583  asparagine synthetase B  70.04 
 
 
554 aa  832  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2075  asparagine synthetase B  69.37 
 
 
555 aa  822  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1769  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  832  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.275863  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0334  asparagine synthetase B  90.79 
 
 
554 aa  1068  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000222759  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2913  asparagine synthetase B  90.97 
 
 
554 aa  1069  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.21332e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2982  asparagine synthetase B  100 
 
 
554 aa  1158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  2.71293e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1726  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  832  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000976904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02722  asparagine synthetase B  70.62 
 
 
556 aa  847  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1592  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  833  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134057  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1189  asparagine synthetase B  93.86 
 
 
554 aa  1097  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  8.01379e-07  hitchhiker  0.000247502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1509  asparagine synthetase B  70.04 
 
 
552 aa  826  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.894912  normal  0.973884 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2794  asparagine synthetase B  68.77 
 
 
554 aa  822  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1200  asparagine synthetase B  92.6 
 
 
554 aa  1083  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00336153  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2549  asparagine synthetase B  70.76 
 
 
554 aa  834  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.267327  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1731  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  831  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0791037  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3131  asparagine synthetase B  92.42 
 
 
554 aa  1083  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.043065  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004132  asparagine synthetase (glutamine-hydrolyzing)  75.81 
 
 
554 aa  908  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2101  asparagine synthetase B  70.04 
 
 
554 aa  821  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.550051 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2963  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  99.82 
 
 
554 aa  1156  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.35931e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00631  asparagine synthetase B  100 
 
 
554 aa  1158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  2.78776e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1104  asparagine synthetase B  71.3 
 
 
556 aa  850  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.327068  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2945  asparagine synthetase B  92.78 
 
 
554 aa  1070  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0152593  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00622  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1158  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  4.98597e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1111  asparagine synthetase B  92.42 
 
 
554 aa  1081  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.199496  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0727  asparagine synthetase B  95.13 
 
 
554 aa  1110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000172917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0786  asparagine synthetase B  94.95 
 
 
554 aa  1110  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000506611  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2384  asparagine synthetase B  70.58 
 
 
554 aa  832  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.142024  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0827  asparagine synthetase B  75.45 
 
 
555 aa  912  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0764  asparagine synthetase B  99.64 
 
 
554 aa  1155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.95791e-05  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06815  asparagine synthetase B, glutamine-hydrolyzing protein  64.5 
 
 
562 aa  778  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2558  asparagine synthetase B  70.4 
 
 
554 aa  831  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139903  hitchhiker  3.44711e-10 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2456  asparagine synthetase B  70.58 
 
 
554 aa  835  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0260908 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1602  asparagine synthetase B  70.04 
 
 
554 aa  821  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.50362  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2767  asparagine synthetase B  70.76 
 
 
554 aa  835  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18337  predicted protein  51.97 
 
 
596 aa  601  1e-170  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00920  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing), putative  50.17 
 
 
592 aa  570  1e-161  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.442044  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04401  hypothetical asparagine synthetase (Eurofung)  47.77 
 
 
571 aa  551  1e-155  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.911904  normal  0.26704 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83540  asparagine synthetase  47.78 
 
 
573 aa  516  1e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.163199 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_45116  predicted protein  45.14 
 
 
638 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0104065  normal  0.918435 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2252  asparagine synthetase B  44.57 
 
 
537 aa  446  1e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31639  predicted protein  41.49 
 
 
543 aa  385  1e-105  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0341854  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2106  asparagine synthetase B  40.23 
 
 
503 aa  351  2e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0374  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  41.07 
 
 
528 aa  342  1e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1107  asparagine synthetase B  38.12 
 
 
537 aa  308  2e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2461  asparagine synthetase B  36.91 
 
 
498 aa  307  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.153372  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0398  asparagine synthetase B  38.8 
 
 
530 aa  301  2e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2336  asparagine synthetase B  35.55 
 
 
498 aa  290  6e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.790549  normal  0.549669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02110  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  36.16 
 
 
512 aa  266  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541499  normal  0.683156 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0733  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0900  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  231  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2446  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.40738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2712  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0234  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2366  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.95 
 
 
510 aa  231  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0719  putative asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.96 
 
 
510 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0957668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1868  asparagine synthase  31.59 
 
 
492 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.26945e-06  normal  0.0616973 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22410  asparagine synthase (glutamine-hydrolysing)  32.05 
 
 
484 aa  214  5e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0444  asparagine synthase  30.25 
 
 
482 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75019  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2050  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  30.93 
 
 
592 aa  202  1e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.434349  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3649  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.42 
 
 
664 aa  201  3e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0489  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.49 
 
 
666 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3180  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34.17 
 
 
660 aa  197  6e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0186  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  32.92 
 
 
583 aa  195  1e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1081  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.67 
 
 
660 aa  195  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2871  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.98 
 
 
678 aa  193  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2108  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.97 
 
 
536 aa  193  7e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0767573  normal  0.053891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4315  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  33.18 
 
 
658 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3421  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.36 
 
 
662 aa  189  8e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5791  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  30.79 
 
 
627 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0211  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  29.16 
 
 
514 aa  187  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.537902  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3057  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.11 
 
 
653 aa  187  5e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3403  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.56 
 
 
624 aa  186  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.732095 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0542  asparagine synthetase, glutamine-hydrolyzing  33.33 
 
 
606 aa  186  8e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1694  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.91 
 
 
635 aa  186  9e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3283  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.35 
 
 
653 aa  186  1e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.524928  normal  0.0234108 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2387  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  34 
 
 
655 aa  186  1e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3766  asparagine synthase family amidotransferase  28.88 
 
 
599 aa  185  2e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2074  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.51 
 
 
633 aa  185  2e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  1.33092e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1652  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  32.01 
 
 
633 aa  184  4e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.97095e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4478  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  33.17 
 
 
666 aa  184  4e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.48246  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0461  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  28.52 
 
 
613 aa  183  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.909372  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>