61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1904 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1904  thiamine biosynthesis protein  100 
 
 		 368 aa  749    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.661194 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0875  thiamine biosynthesis protein  73.64 
 
 		 368 aa  556  1e-157  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.408938 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2372  hypothetical protein  67.05 
 
 		 357 aa  482  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000114865  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0292  thiamine biosynthesis protein  54.26 
 
 		 376 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000151674  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3179  thiamine biosynthesis protein  52.19 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0309  hypothetical protein  48.96 
 
 		 349 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1163  hypothetical protein  40.57 
 
 		 328 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0434  hypothetical protein  46.89 
 
 		 334 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4272  thiamine biosynthesis protein  45.36 
 
 		 334 aa  226  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1071  thiamine biosynthesis protein  44.27 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.324094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3402  thiamine biosynthesis protein  45.05 
 
 		 334 aa  222  8e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1170  Thiamine biosynthesis protein-like protein  43.31 
 
 		 329 aa  220  3e-56  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1496  protein of unknown function DUF814  38.44 
 
 		 327 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0065  thiamine biosynthesis protein  44.85 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.96842e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0082  thiamine biosynthesis protein  44.85 
 
 		 334 aa  219  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1061  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase / fibronectin/fibrinogen-binding protein  40.6 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.391536  normal  0.569731 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3219  thiamine biosynthesis protein  39.74 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2474  thiamin biosynthesis protein ThiI  42.52 
 
 		 326 aa  203  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2184  argininosuccinate synthase  42.13 
 
 		 326 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1299  thiamine biosynthesis protein  37.01 
 
 		 355 aa  197  3e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.122436  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0384  thiamine biosynthesis protein  39.83 
 
 		 351 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.624695  hitchhiker  0.00868448 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3145  hypothetical protein  37.21 
 
 		 346 aa  194  2e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.221645  normal  0.21046 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4045  thiamine biosynthesis protein  39.71 
 
 		 351 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4188  thiamine biosynthesis protein  39.42 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.329777  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4161  thiamine biosynthesis protein  39.42 
 
 		 351 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2769  hypothetical protein  37.11 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000778027  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1725  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  35.71 
 
 		 337 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0282763 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1609  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.34 
 
 		 327 aa  182  8.000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2075  thiamine biosynthesis protein:ExsB  40.91 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1219  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  37.39 
 
 		 354 aa  179  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0801  ATP-binding protein  36.04 
 
 		 324 aa  175  9e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2797  putative tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate) -methyltransferase  36.5 
 
 		 331 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000576654  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0026  thiamine biosynthesis protein:ExsB  35.96 
 
 		 326 aa  175  9.999999999999999e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1992  hypothetical protein  39.45 
 
 		 349 aa  175  9.999999999999999e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1805  hypothetical protein  39.45 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1746  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.96 
 
 		 329 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1624  hypothetical protein  39.45 
 
 		 327 aa  174  2.9999999999999996e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.425475  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1498  hypothetical protein  36.95 
 
 		 327 aa  166  5e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1979  thiamine biosynthesis protein:ExsB  38.25 
 
 		 327 aa  162  6e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2654  hypothetical protein  35.37 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00416391  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2450  thiamine biosynthesis protein  34.8 
 
 		 352 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0405  thiamine biosynthesis protein  35.42 
 
 		 345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1249  hypothetical protein  32.43 
 
 		 302 aa  48.9  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0359  PP-loop domain-containing protein  29.85 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1206  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.83 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00578978  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl584  thiamin biosynthesis protein  31.08 
 
 		 400 aa  47.8  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.662181  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1613  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.59 
 
 		 392 aa  47  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.166004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0478  PP-loop domain-containing protein  30.91 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1327  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  30.56 
 
 		 398 aa  45.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0906618  normal  0.041643 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3122  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.58 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1441  PP-loop domain-containing protein  28.36 
 
 		 296 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0892  thiamine biosynthesis protein  32.2 
 
 		 335 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.122669  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0737  thiamine biosynthesis protein ThiI  29.8 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.113033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0546  thiamine biosynthesis protein  29.09 
 
 		 299 aa  44.3  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.193283  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0010  thiazole biosynthesis protein  28.33 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0479704  normal  0.171831 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2170  tRNA (5-methylaminomethyl-2-thiouridylate)-methyltransferase  32.58 
 
 		 346 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  31.03 
 
 		 414 aa  43.9  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0001724  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1493  thiamine biosynthesis protein ThiI  25.75 
 
 		 478 aa  43.9  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0341854  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2042  thiamine biosynthesis/tRNA modification protein ThiI  29.37 
 
 		 370 aa  43.1  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.389674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0981  tRNA-specific 2-thiouridylase MnmA  27.46 
 
 		 355 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.561547 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1038  thiamine biosynthesis protein ThiI  27.97 
 
 		 422 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16797  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>