More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2353 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0306  FAD linked oxidase domain-containing protein  76.5 
 
 		 1187 aa  1899    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1789  FAD linked oxidase domain protein  53.24 
 
 		 1183 aa  1310    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0377487  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2353  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 1204 aa  2482    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0312  oxidoreductase  68.61 
 
 		 1188 aa  1734    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1131  FAD linked oxidase domain protein  52.85 
 
 		 1197 aa  1277    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0044  FAD linked oxidase domain protein  62.78 
 
 		 1183 aa  1538    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.559839  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0954  FAD linked oxidase domain protein  33.86 
 
 		 1221 aa  588  1e-166  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.798871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1511  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.68 
 
 		 1218 aa  588  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1652  FAD linked oxidase domain protein  33.93 
 
 		 1210 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154476  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1263  FAD linked oxidase domain protein  33.55 
 
 		 1202 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018481 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1605  FAD linked oxidase domain protein  33.8 
 
 		 1218 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.447482  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1235  oxidoreductase, FAD-binding  34.88 
 
 		 1217 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.201991 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0799  oxidoreductase, FAD-binding  33.25 
 
 		 1214 aa  572  1e-161  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.549534  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3018  FAD linked oxidase-like  34.88 
 
 		 1213 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3117  FAD linked oxidase domain protein  34.34 
 
 		 1212 aa  567  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3218  FAD linked oxidase domain protein  34.71 
 
 		 1212 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2999  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.47 
 
 		 1227 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0545  FAD linked oxidase domain protein  31 
 
 		 1280 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.650585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3648  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.54 
 
 		 1304 aa  504  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0476  FAD linked oxidase-like protein  31.73 
 
 		 1271 aa  504  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0219  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  32.98 
 
 		 1259 aa  503  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.524228  normal  0.117138 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0864  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.49 
 
 		 1307 aa  494  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4132  FAD linked oxidase domain protein  32.45 
 
 		 1292 aa  496  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.48543  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0793  FAD linked oxidase domain protein  32.7 
 
 		 1307 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.147444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1288  FAD linked oxidase-like  32.49 
 
 		 1307 aa  487  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5464  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.09 
 
 		 1304 aa  489  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.279541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0858  FAD linked oxidase-like  31.57 
 
 		 1300 aa  482  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.106319 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0690  FAD linked oxidase domain protein  30.53 
 
 		 1292 aa  479  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1899  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.1 
 
 		 1279 aa  478  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.967348  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0778  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.32 
 
 		 1265 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.756982 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1604  FAD linked oxidase domain protein  32.54 
 
 		 1279 aa  475  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2738  putative oxidoreductase protein  33.1 
 
 		 1308 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0789331 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4121  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1291 aa  469  9.999999999999999e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0750  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.13 
 
 		 1309 aa  469  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.886785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1309  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.97 
 
 		 1292 aa  466  1e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1918  FAD linked oxidase domain-containing protein  35.04 
 
 		 1282 aa  304  6.000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2778  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.74 
 
 		 1289 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.826538  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1638  FAD linked oxidase domain-containing protein  36.69 
 
 		 1288 aa  280  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1769  oxidoreductase, FAD-binding, putative  34.41 
 
 		 1277 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1445  FAD linked oxidase domain protein  34.41 
 
 		 1277 aa  275  4.0000000000000004e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0367  FAD linked oxidase-like protein  31.92 
 
 		 1324 aa  266  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.985716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0427  hypothetical protein  40.34 
 
 		 1324 aa  261  5.0000000000000005e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1757  oxidoreductase, putative  31.43 
 
 		 1308 aa  258  5e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4053  putative oxidoreductase  35.5 
 
 		 1349 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0550  oxidoreductase, FAD-binding  31.83 
 
 		 1359 aa  255  4.0000000000000004e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0564  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.09 
 
 		 1344 aa  254  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2786  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.56 
 
 		 1340 aa  254  9.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.616835  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2395  oxidoreductase, FAD-binding  31.49 
 
 		 1342 aa  254  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0646  FAD linked oxidase domain protein  35.5 
 
 		 1364 aa  254  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.801662  normal  0.70972 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0183  oxidoreductase, FAD-binding  31.49 
 
 		 1342 aa  254  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2762  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 1341 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0842  oxidoreductase, FAD-binding  31.49 
 
 		 1342 aa  254  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0664  oxidoreductase, FAD-binding  31.49 
 
 		 1342 aa  254  1e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6062  hypothetical protein  31.64 
 
 		 1341 aa  253  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2763  oxidoreductase, FAD-binding  31.49 
 
 		 1342 aa  254  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.197737  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2315  oxidoreductase, FAD-binding  31.49 
 
 		 1342 aa  254  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401308  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0680  oxidoreductase, FAD-binding  31.49 
 
 		 1342 aa  253  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.837218  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2123  FAD linked oxidase-like  31.67 
 
 		 1341 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2653  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.56 
 
 		 1340 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2735  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.67 
 
 		 1341 aa  253  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.330233  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0053  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.3 
 
 		 1286 aa  252  3e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.170448  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0371  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.55 
 
 		 1371 aa  251  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.717387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0344  FAD linked oxidase domain protein  39.46 
 
 		 1345 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.599686  normal  0.30676 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0329  FAD linked oxidase domain protein  39.46 
 
 		 1345 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.271253  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0454  putative oxidoreductase protein  38.29 
 
 		 1345 aa  247  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.306454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0464  FAD linked oxidase domain protein  30.07 
 
 		 466 aa  172  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3296  glycolate oxidase subunit GlcD, putative  29.9 
 
 		 459 aa  164  7e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3245  FAD linked oxidase-like  29.16 
 
 		 459 aa  161  9e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000203504 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2765  glycolate oxidase subunit D  31.23 
 
 		 461 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000623644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0577  FAD linked oxidase domain protein  29.34 
 
 		 459 aa  152  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376973 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0564  FAD linked oxidase domain protein  29.1 
 
 		 459 aa  151  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3253  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.41 
 
 		 459 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194288  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1893  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.78 
 
 		 481 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1313  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.26 
 
 		 469 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.130987  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  30.33 
 
 		 460 aa  139  4e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0648  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.07 
 
 		 459 aa  138  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0372  FAD linked oxidase-like  28.4 
 
 		 461 aa  138  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.942962  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2369  FAD linked oxidase domain protein  26.85 
 
 		 481 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3186  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.38 
 
 		 494 aa  134  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.602747 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0409  FAD linked oxidase domain protein  28.22 
 
 		 472 aa  132  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5786  glycolate oxidase subunit GlcD  28.07 
 
 		 477 aa  132  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1321  FAD linked oxidase domain protein  27.14 
 
 		 497 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1662  glycolate oxidase, subunit GlcD  27.25 
 
 		 497 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  29.13 
 
 		 459 aa  131  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2581  FAD linked oxidase  27.23 
 
 		 497 aa  132  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.209325 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0693  glycolate oxidase, subunit GlcD  28.76 
 
 		 459 aa  131  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0311097  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0558  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.81 
 
 		 486 aa  131  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.517434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0822  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.3 
 
 		 495 aa  131  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3204  FAD linked oxidase-like  27.47 
 
 		 497 aa  131  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0851  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.3 
 
 		 495 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4736  FAD linked oxidase-like  28.61 
 
 		 497 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.369244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0160  FAD linked oxidase domain protein  26 
 
 		 483 aa  129  4.0000000000000003e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2133  FAD linked oxidase domain protein  28.61 
 
 		 457 aa  129  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4091  glycolate oxidase, subunit GlcD  26.33 
 
 		 492 aa  129  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4137  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  26.83 
 
 		 497 aa  128  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1915  FAD linked oxidase domain protein  27.56 
 
 		 462 aa  128  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3978  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.04 
 
 		 497 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0945147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3360  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.71 
 
 		 493 aa  127  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1914  FAD linked oxidase domain protein  26.48 
 
 		 485 aa  127  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0534  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.26 
 
 		 464 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>