More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0095 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0095  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
119 aa  239  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0507743 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  80.67 
 
 
119 aa  199  1e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  75.63 
 
 
119 aa  191  3e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2241  50S ribosomal protein L18  70.83 
 
 
120 aa  151  3e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272684  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  55.46 
 
 
116 aa  134  6e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  58.41 
 
 
114 aa  130  8e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  57.63 
 
 
124 aa  129  1e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 
121 aa  129  2e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
120 aa  128  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  5.38516e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  127  7e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.11819e-09  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
120 aa  126  1e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
116 aa  125  1e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  6.18216e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09989e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.39258e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  7.02498e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  1.40079e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  125  1e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.09054e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  54.62 
 
 
117 aa  125  2e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  2.57389e-05  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
115 aa  124  3e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  55.17 
 
 
119 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 
120 aa  124  4e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  53.91 
 
 
120 aa  124  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
121 aa  123  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.62342e-09  hitchhiker  3.24401e-08 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
120 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  5.42863e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 
121 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
119 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 
122 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.52303e-10 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
119 aa  122  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  57.98 
 
 
122 aa  121  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  51.3 
 
 
118 aa  121  4e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  120  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 
120 aa  120  7e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  53.85 
 
 
122 aa  120  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  2.6259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  54.7 
 
 
122 aa  120  8e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 
119 aa  120  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
122 aa  120  9e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  59.66 
 
 
117 aa  119  2e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 
124 aa  118  2e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  5.00708e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
122 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 
120 aa  117  4e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 
120 aa  117  4e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  5.04342e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 
120 aa  117  4e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 
121 aa  117  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  51.3 
 
 
118 aa  117  6e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.95755e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  52.94 
 
 
117 aa  115  1e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  52.14 
 
 
116 aa  115  2e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.69 
 
 
124 aa  115  2e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  52.94 
 
 
116 aa  115  2e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 
114 aa  115  3e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  51.24 
 
 
118 aa  114  4e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  53.57 
 
 
121 aa  114  4e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.59 
 
 
120 aa  114  5e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 
119 aa  113  7e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  57.28 
 
 
122 aa  113  7e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 
119 aa  113  7e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 
122 aa  113  8e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 
122 aa  113  9e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  52.46 
 
 
122 aa  113  1e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  51.72 
 
 
125 aa  112  1e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  48.74 
 
 
117 aa  112  2e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  47.54 
 
 
120 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  54.78 
 
 
118 aa  111  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.579e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  51.28 
 
 
117 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  47.54 
 
 
120 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  56.57 
 
 
123 aa  110  4e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  53.57 
 
 
127 aa  111  4e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  110  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  51.3 
 
 
121 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
122 aa  110  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  4.55959e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  54.87 
 
 
119 aa  110  8e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  45.76 
 
 
122 aa  110  8e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 
122 aa  110  8e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 
120 aa  109  1e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  53.51 
 
 
128 aa  109  1e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  48.7 
 
 
118 aa  109  1e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  57.58 
 
 
122 aa  109  1e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.99642e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  48.7 
 
 
118 aa  109  1e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  57.58 
 
 
122 aa  109  1e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  47.06 
 
 
116 aa  108  2e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  53.98 
 
 
125 aa  108  2e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  48.76 
 
 
123 aa  107  4e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  51.35 
 
 
120 aa  107  4e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
112 aa  107  4e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  50.43 
 
 
119 aa  107  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  47.37 
 
 
122 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  50 
 
 
118 aa  107  7e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  45.76 
 
 
122 aa  107  8e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  48.78 
 
 
121 aa  106  9e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  46.28 
 
 
122 aa  106  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  53.54 
 
 
122 aa  106  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  5.49459e-07  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  56.07 
 
 
128 aa  105  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 
118 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 
124 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 
136 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  6.97313e-06  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  46.49 
 
 
122 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  46.49 
 
 
122 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  104  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>