24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0058 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0058  YbbR family protein  100 
 
 		 299 aa  588  1e-167  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1784  YbbR family protein  49.5 
 
 		 300 aa  270  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.911934  normal  0.351909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1516  hypothetical protein  37.71 
 
 		 300 aa  213  3.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.474262  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1714  YbbR family protein  34.23 
 
 		 310 aa  159  8e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0256  YbbR family protein  29.77 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00403161  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1724  YbbR family protein  35 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.264066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0277  YbbR-like protein  28.03 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.322276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2247  YbbR-like  31.76 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000736738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1000  hypothetical protein  25.53 
 
 		 218 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000422798  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0833  YbbR family protein  27.59 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0297295  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3455  hypothetical protein  21.74 
 
 		 483 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000996769 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0935  YbbR family protein  29.33 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0293  YbbR family protein  27.84 
 
 		 334 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000188911  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2187  YbbR family protein  27.07 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0157  YbbR family protein  26.49 
 
 		 411 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141391  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2640  hypothetical protein  29.41 
 
 		 471 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.911515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0362  YbbR family protein  20.24 
 
 		 410 aa  47.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0241  YbbR family protein  25 
 
 		 415 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0403  hypothetical protein  25 
 
 		 938 aa  47  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.879706  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1908  hypothetical protein  23.89 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0371  YbbR family protein  23.08 
 
 		 311 aa  43.5  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1887  hypothetical protein  25.6 
 
 		 135 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000765613  hitchhiker  0.00000000121292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0153  YbbR family protein  25.63 
 
 		 412 aa  43.1  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3551  YbbR family protein  24 
 
 		 351 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00859415  normal  0.0365971 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>