More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1313 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1313  agmatinase  100 
 
 
293 aa  590  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501351  normal  0.021834 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1609  agmatinase  55.9 
 
 
291 aa  318  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0169673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3780  putative agmatinase  36.65 
 
 
303 aa  177  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.547694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3564  putative agmatinase  38.63 
 
 
296 aa  176  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.263603  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00520  arginase  34.85 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.960091  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2696  agmatinase  33.81 
 
 
305 aa  162  9e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29511  arginase family  41.73 
 
 
304 aa  155  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2230  putative agmatinase  39.16 
 
 
287 aa  153  4e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2591  agmatinase  38.91 
 
 
291 aa  152  7e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21591  arginase  35.66 
 
 
299 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0721  putative agmatinase  38.13 
 
 
307 aa  149  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0574  agmatinase, putative  37.14 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1779  arginase family  34.95 
 
 
293 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.632137  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4857  putative agmatinase  35.16 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2793  agmatinase  33.21 
 
 
280 aa  144  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18961  arginase  35.31 
 
 
293 aa  144  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  39.25 
 
 
290 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1287  arginase family  35.69 
 
 
299 aa  143  4e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18771  arginase  34.74 
 
 
294 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.218611  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18171  arginase  33.94 
 
 
296 aa  141  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18771  arginase  34.39 
 
 
293 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.993676  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1538  agmatinase  31.43 
 
 
289 aa  139  3.9999999999999997e-32  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.04187  unclonable  1.26381e-19 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0733  agmatinase  34.35 
 
 
293 aa  138  1e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.983963  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0838  agmatinase  34.48 
 
 
293 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2044  agmatinase  33.45 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.661997  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  29.71 
 
 
282 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1365  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.87 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0530  agmatinase  34.66 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0516  agmatinase  34.66 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1085  agmatinase  29.18 
 
 
282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1264  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.87 
 
 
341 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2434  agmatinase  32.48 
 
 
287 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0127  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  31.66 
 
 
346 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1275  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.31 
 
 
343 aa  125  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0832  putative agmatinase  29.18 
 
 
282 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2584  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.77 
 
 
341 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.704538  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  33.73 
 
 
283 aa  124  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2793  agmatinase  35 
 
 
295 aa  124  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.66818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3053  agmatinase  36.58 
 
 
284 aa  124  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1446  putative agmatinase  29.71 
 
 
279 aa  123  3e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00618219  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0897  putative agmatinase  28.37 
 
 
283 aa  123  4e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0965  putative agmatinase  35.77 
 
 
283 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.336082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3566  agmatinase  32.01 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  35.21 
 
 
290 aa  122  9.999999999999999e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2261  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.82 
 
 
346 aa  121  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1414  agmatinase  30.15 
 
 
295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000244509  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1581  putative agmatinase  32.73 
 
 
288 aa  120  3e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0489  putative agmatinase  34.38 
 
 
288 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000593846  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3076  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  29.97 
 
 
367 aa  119  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.504729 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0074  agmatinase  36.82 
 
 
294 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3883  putative agmatinase  32.94 
 
 
290 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0669  hypothetical protein  34.38 
 
 
288 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.340442  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5163  putative agmatinase  33.33 
 
 
290 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  34.3 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5498  agmatinase, putative  32.28 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5460  putative agmatinase  32.28 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5547  putative agmatinase  32.28 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0695  agmatinase  31.8 
 
 
289 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.109058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5491  putative agmatinase  32.28 
 
 
290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5066  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  32.41 
 
 
290 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1151  hypothetical protein  29.69 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0694  agmatinase  33.1 
 
 
291 aa  112  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.464925  normal  0.230846 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5218  agmatinase  32.02 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5050  agmatinase (agmatine ureohydrolase)  32.02 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5617  agmatinase  32.02 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5461  putative agmatinase  32.02 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3350  agmatinase  31.41 
 
 
294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00473387  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2212  agmatinase  31.64 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000352659 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3460  agmatinase  31.07 
 
 
291 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1978  putative agmatinase  39.38 
 
 
250 aa  109  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000215726  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0004  agmatinase  30.38 
 
 
290 aa  108  1e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  27.03 
 
 
297 aa  107  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0745  agmatinase  34.23 
 
 
270 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00217133  hitchhiker  0.00435081 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3007  putative agmatinase  32.97 
 
 
313 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1815  agmatinase  36.4 
 
 
296 aa  103  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000239855  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1315  agmatinase  30.99 
 
 
285 aa  103  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  31.03 
 
 
315 aa  102  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0797  putative agmatinase  32.01 
 
 
337 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1896  agmatinase  31.03 
 
 
289 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.436435  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0938  agmatinase  30.83 
 
 
342 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.738745  normal  0.133276 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  31.01 
 
 
316 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1006  agmatinase  32.06 
 
 
315 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.279124  normal  0.223535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2336  agmatinase  31.64 
 
 
287 aa  99.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.329379 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  30.65 
 
 
324 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  30.74 
 
 
315 aa  99  8e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0420  agmatinase  29.06 
 
 
309 aa  99  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00981885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  29.89 
 
 
327 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  31.52 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2579  agmatinase  32.82 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3696  agmatinase  32.2 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5628  agmatinase  32.2 
 
 
322 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19302  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4672  agmatinase  32.2 
 
 
322 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.624231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0046  putative agmatinase  31.65 
 
 
321 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1417  agmatinase  30.86 
 
 
325 aa  97.1  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4524  agmatinase  31.06 
 
 
322 aa  95.9  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.240724 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04350  agmatinase  31.66 
 
 
338 aa  95.9  7e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  30.63 
 
 
316 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1147  agmatinase  31.82 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.100516  normal  0.226573 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  30.45 
 
 
318 aa  94.7  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  29.89 
 
 
320 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>