204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0714 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  100 
 
 		 84 aa  166  7e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  60.98 
 
 		 84 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  55.7 
 
 		 87 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  49.4 
 
 		 85 aa  92  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  46.43 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  46.99 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  46.15 
 
 		 98 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  45.78 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  45.78 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  46.99 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  48.24 
 
 		 92 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  45.78 
 
 		 92 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  48.61 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  48.61 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  43.75 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  47.56 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000119033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  42.86 
 
 		 87 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  47.06 
 
 		 92 aa  71.6  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  42.68 
 
 		 87 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  50.7 
 
 		 98 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  46.58 
 
 		 90 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  38.75 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  47.22 
 
 		 96 aa  68.2  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  42.68 
 
 		 87 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361919  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  45.07 
 
 		 104 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  41.46 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  41.46 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  41.46 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  41.46 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 89 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  41.46 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000638636 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  41.46 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  41.77 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  39.02 
 
 		 87 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  42.03 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  49.3 
 
 		 86 aa  63.9  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  0.000000000000996106 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  38.27 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 		 196 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 		 196 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  42.65 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  40.85 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  39.51 
 
 		 85 aa  61.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  45.16 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  45.21 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  44.87 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  41.33 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  31.25 
 
 		 192 aa  58.2  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  36.36 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  36.36 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  41.27 
 
 		 196 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  41.27 
 
 		 196 aa  57  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  38.67 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  40.7 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3275  YGGT family protein  35 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0250228 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2785  hypothetical protein  37.65 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.555098  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3340  YGGT family protein  35 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.350216 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  40 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3348  YGGT family protein  35 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.299187  normal  0.126614 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  42.03 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3444  YGGT family protein  35 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.119003 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3842  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  38.67 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  38.36 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  37.33 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0755  ylmG protein  36.05 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.298424  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  54.72 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  29.73 
 
 		 187 aa  53.9  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  54.72 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  36.76 
 
 		 197 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  39.73 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  34.21 
 
 		 192 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  46.05 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 		 92 aa  52.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3358  protein of unknown function YGGT  33.73 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0016989 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  39.73 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3111  hypothetical protein  39.73 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  33.8 
 
 		 189 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0751  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3264  YGGT family protein  33.75 
 
 		 188 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2585  hypothetical protein  39.73 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 		 213 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  39.73 
 
 		 187 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  36.67 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02782  predicted inner membrane protein  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.104199  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0743  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4255  YGGT family protein  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.809329  normal  0.660406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02745  hypothetical protein  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.090594  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3112  YGGT family protein  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  44.26 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0762  protein of unknown function YGGT  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000437553 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  38.36 
 
 		 187 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3296  YGGT family protein  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3384  YGGT family protein  33.75 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>