More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_3202 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 
353 aa  731    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  64.97 
 
 
356 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 
356 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.84 
 
 
356 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 
356 aa  491  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 
356 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 
356 aa  490  1e-137  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  63.56 
 
 
356 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 
356 aa  491  1e-137  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.28 
 
 
356 aa  489  1e-137  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.28 
 
 
356 aa  488  1e-137  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 
356 aa  488  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.71 
 
 
356 aa  484  1e-136  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.43 
 
 
356 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  63.28 
 
 
357 aa  484  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  61.86 
 
 
356 aa  475  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.75 
 
 
358 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  62.25 
 
 
614 aa  442  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.4 
 
 
365 aa  375  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  44.44 
 
 
358 aa  333  3e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.96 
 
 
357 aa  328  6e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.83 
 
 
359 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.79 
 
 
384 aa  155  1e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.06 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 
388 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.9 
 
 
388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.66 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.92 
 
 
381 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
389 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.12 
 
 
383 aa  123  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
390 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.58 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2455  alcohol dehydrogenase II  30.49 
 
 
382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  26.85 
 
 
387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.01 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.78 
 
 
368 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.51 
 
 
385 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  32.34 
 
 
382 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.03 
 
 
387 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
385 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2650  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.55 
 
 
376 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  32.34 
 
 
382 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.47 
 
 
382 aa  113  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.76 
 
 
397 aa  113  6e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.85 
 
 
395 aa  112  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
385 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1258  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
382 aa  112  8.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0709057 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.17 
 
 
384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.67 
 
 
382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1359  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.759734  hitchhiker  0.000832338 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  31 
 
 
368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.8 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.8 
 
 
402 aa  110  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.52 
 
 
384 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0885  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.55 
 
 
376 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.9 
 
 
371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
388 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.05 
 
 
382 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
385 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  30.23 
 
 
385 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  32.02 
 
 
388 aa  109  6e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  28.15 
 
 
399 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  28.7 
 
 
382 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.81 
 
 
382 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.33 
 
 
382 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.06 
 
 
382 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  29.77 
 
 
385 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.25 
 
 
380 aa  108  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  29.49 
 
 
382 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1159  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.62 
 
 
377 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.314153  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  26.37 
 
 
385 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
382 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.49 
 
 
382 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.97 
 
 
381 aa  108  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.13 
 
 
388 aa  107  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1164  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.26 
 
 
388 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1024  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.33 
 
 
366 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00115837  unclonable  0.00000000647947 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1643  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.46 
 
 
382 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.768849  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.72 
 
 
382 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.134341 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
389 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.6 
 
 
389 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0567  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.26 
 
 
383 aa  106  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
400 aa  105  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.63 
 
 
383 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6451  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.06 
 
 
377 aa  105  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.75 
 
 
400 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2176  hypothetical protein  29.61 
 
 
386 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.75 
 
 
400 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6274  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.56 
 
 
377 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.282281  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0681  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.32 
 
 
381 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.32 
 
 
400 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 
385 aa  104  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.75 
 
 
400 aa  105  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  27.96 
 
 
382 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>