More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1857 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  93.54 
 
 		 356 aa  702    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  87.36 
 
 		 356 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.64 
 
 		 356 aa  666    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 356 aa  744    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.73 
 
 		 356 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  88.2 
 
 		 356 aa  669    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.64 
 
 		 356 aa  666    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  91.57 
 
 		 356 aa  687    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.92 
 
 		 356 aa  667    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.64 
 
 		 356 aa  667    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.08 
 
 		 356 aa  664    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  90.17 
 
 		 356 aa  680    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  87.08 
 
 		 356 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  84.83 
 
 		 356 aa  651    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  70.31 
 
 		 357 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  63.56 
 
 		 353 aa  488  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.14 
 
 		 358 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  53.37 
 
 		 614 aa  400  9.999999999999999e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  51.67 
 
 		 365 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.94 
 
 		 358 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  45.66 
 
 		 357 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  41.11 
 
 		 359 aa  297  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  33.57 
 
 		 384 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.37 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.29 
 
 		 388 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2279  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.87 
 
 		 389 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.28 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.36 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  26.16 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.93 
 
 		 382 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.9 
 
 		 380 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.86 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.92 
 
 		 398 aa  101  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2729  iron-containing alcohol dehydrogenase  32.16 
 
 		 384 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1217  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.19 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2606  ethanolamine utilization protein EutG  27.03 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.66 
 
 		 387 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2695  ethanolamine utilization protein EutG  27.03 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2654  ethanolamine utilization protein EutG  27.03 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0517138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3674  ethanolamine utilization protein EutG  26.19 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2721  ethanolamine utilization protein EutG  27.03 
 
 		 395 aa  98.6  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.295885 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0257  alcohol dehydrogenase, class IV  28.03 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2828  ethanolamine utilization protein EutG  27.03 
 
 		 395 aa  98.6  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02344  predicted alcohol dehydrogenase in ethanolamine utilization  25.85 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.74 
 
 		 397 aa  97.4  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0115621 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1224  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.85 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2582  ethanolamine utilization protein EutG  25.85 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02306  hypothetical protein  25.85 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4348  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.68 
 
 		 385 aa  97.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.159902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2599  ethanolamine utilization protein EutG  30.5 
 
 		 395 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0740  iron-containing alcohol dehydrogenase  26 
 
 		 395 aa  97.4  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1164  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.11 
 
 		 379 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3225  iron-containing alcohol dehydrogenase  27 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470368  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.7 
 
 		 382 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4103  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.97 
 
 		 371 aa  96.7  6e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0647  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 		 378 aa  96.7  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6101  dehydrogenase  30.34 
 
 		 370 aa  96.7  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  25.82 
 
 		 369 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.71 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2730  ethanolamine utilization protein EutG  25.85 
 
 		 395 aa  96.3  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1609  alcohol dehydrogenase  29.82 
 
 		 382 aa  95.9  9e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  27.23 
 
 		 394 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5260  alcohol dehydrogenase  28.96 
 
 		 399 aa  95.9  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.926776 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6426  Iron-containing alcohol dehydrogenase  34.3 
 
 		 376 aa  95.1  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1734  iron-containing alcohol dehydrogenase  30 
 
 		 373 aa  95.5  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.96 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.76 
 
 		 385 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  29.69 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0946  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 		 395 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1833  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.57 
 
 		 382 aa  94.7  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.453404  normal  0.863481 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 390 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0521  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.52 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000118982 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.62 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.08 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1636  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.26 
 
 		 387 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000919335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 		 385 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1261  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.55 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.528177  normal  0.0459015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1369  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.52 
 
 		 368 aa  94  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2180  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 		 405 aa  93.6  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.5 
 
 		 389 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1316  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 382 aa  93.2  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3412  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.117335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 385 aa  93.6  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3781  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.57 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2947  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.67 
 
 		 402 aa  93.2  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.581281  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1418  Iron-containing alcohol dehydrogenase  29.5 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.909336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  28.26 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0927  L-1,2-propanediol oxidoreductase  26.92 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0355578  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2222  propanol dehydrogenase  27.18 
 
 		 370 aa  92.8  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.806517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2655  alcohol dehydrogenase, iron-containing family protein  29.55 
 
 		 382 aa  92.4  9e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>