More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0804 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0804  iron-containing alcohol dehydrogenase  100 
 
 		 358 aa  742    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3202  iron-containing alcohol dehydrogenase  62.75 
 
 		 353 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10583  ethanolamine utilization protein-like protein  62.92 
 
 		 614 aa  457  1e-127  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1640  alcohol dehydrogenase, iron-containing  57.46 
 
 		 356 aa  436  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000263255  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2140  Iron-containing alcohol dehydrogenase  56.08 
 
 		 357 aa  426  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.741299  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2477  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.8 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  decreased coverage  0.000108776 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2374  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000461423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2362  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 		 356 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000229628  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1985  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.8 
 
 		 356 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000240423  unclonable  0.00000000000340211 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1907  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.52 
 
 		 356 aa  423  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000681421  unclonable  0.0000000000909138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2183  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.29 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000901085  normal  0.0100031 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 		 356 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000304818  unclonable  0.00000258476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1852  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000318302  hitchhiker  0.00000012761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2126  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.97 
 
 		 356 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0147626  unclonable  0.0000187018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1760  iron-containing alcohol dehydrogenase  55.25 
 
 		 356 aa  418  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0108166  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2477  alcohol dehydrogenase, iron-containing  54.7 
 
 		 356 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2133  iron-containing alcohol dehydrogenase  54.42 
 
 		 356 aa  414  1e-114  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000021113  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2423  iron-containing alcohol dehydrogenase  53.04 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.195896  decreased coverage  0.00000137469 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2803  iron-containing alcohol dehydrogenase  50.28 
 
 		 365 aa  347  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  47.35 
 
 		 357 aa  347  2e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1890  iron-containing alcohol dehydrogenase  43.33 
 
 		 358 aa  322  8e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2213  iron-containing alcohol dehydrogenase  42.66 
 
 		 359 aa  316  4e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1279  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.53 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1233  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.63 
 
 		 387 aa  123  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5965  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.07 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6952  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0618427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1536  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6293  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.84 
 
 		 388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.488488 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1166  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 		 382 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.020336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2836  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.03 
 
 		 380 aa  110  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4549  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.53 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1628  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.197511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2798  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.73 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0813  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.28 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.112525  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0565  iron-containing alcohol dehydrogenase  29 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.79087 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1857  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 		 382 aa  106  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.263837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2334  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.02 
 
 		 400 aa  106  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0717342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2234  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 		 382 aa  106  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10038 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1312  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3982  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.43 
 
 		 368 aa  105  8e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0588  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.42 
 
 		 368 aa  106  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3038  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 382 aa  106  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1632  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.85 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0836  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.95 
 
 		 387 aa  105  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2681  iron-containing alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2938  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.36 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1244  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.18 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1321  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2792  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.43 
 
 		 392 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.413135  normal  0.203588 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1986  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.96 
 
 		 382 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2762  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2840  iron-containing alcohol dehydrogenase  28 
 
 		 382 aa  103  3e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1348  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.64 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1490  alcohol dehydrogenase II  28 
 
 		 382 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2077  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.72 
 
 		 385 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0974208  normal  0.438292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0466  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.7 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4319  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 389 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.125939 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1481  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.44 
 
 		 382 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0442  alcohol dehydrogenase 2  29.39 
 
 		 382 aa  103  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.156258  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4429  iron-containing alcohol dehydrogenase  30.97 
 
 		 389 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0240363  normal  0.58487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1719  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.26 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6773  Iron-containing alcohol dehydrogenase  30.34 
 
 		 388 aa  102  8e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4573  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.77 
 
 		 385 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.414797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0451  alcohol dehydrogenase, iron-containing  29.39 
 
 		 382 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2252  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.39 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.366861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1776  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.39 
 
 		 383 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137736  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2066  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.39 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.904837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2006  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.39 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.857021  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2250  alcohol dehydrogenase, iron-containing  28.39 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.32939e-26 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2430  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.02 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.528301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0834  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.58 
 
 		 380 aa  101  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.161806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0330  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.83 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.397984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2803  1,3-propanediol dehydrogenase  28.77 
 
 		 394 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3517  alcohol dehydrogenase  27.39 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.304175 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4422  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2005  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.08 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000571381  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4061  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.65 
 
 		 387 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0172  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 		 388 aa  100  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2506  alcohol dehydrogenase, class IV  26.51 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.75007e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0767  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4943  putative iron-containing alcohol dehydrogenase  28.2 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375402  normal  0.972058 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3919  alcohol dehydrogenase  28.75 
 
 		 385 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0768529  normal  0.635531 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4944  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.48 
 
 		 410 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1584  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.82 
 
 		 383 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.140068  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0048  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 		 359 aa  99.4  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0244255  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4360  alcohol dehydrogenase  27.06 
 
 		 385 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.322579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4006  alcohol dehydrogenase  27.06 
 
 		 385 aa  99.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1965  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.39 
 
 		 419 aa  99.4  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.549318  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2945  dehydrogenase  29.77 
 
 		 381 aa  98.6  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1990  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.17 
 
 		 390 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352675  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1495  iron-containing alcohol dehydrogenase  29.44 
 
 		 393 aa  99.4  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102085  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3325  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.69 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.961495  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3532  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.23 
 
 		 388 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2631  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.13 
 
 		 383 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.129708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3574  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.882397  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3267  alcetaldehyde dehydrogenase or NADPH-dependent butanol dehydrogenase  29.46 
 
 		 369 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2222  alcohol dehydrogenase  28.25 
 
 		 392 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.662473  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3758  lactaldehyde reductase  27.47 
 
 		 382 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1006  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.27 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3848  lactaldehyde reductase  27.04 
 
 		 382 aa  97.4  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>