More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1768 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
542 aa  1093    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  44.2 
 
 
507 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  44.27 
 
 
507 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  43.52 
 
 
521 aa  387  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  44.69 
 
 
521 aa  385  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  43.52 
 
 
525 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  42.04 
 
 
516 aa  371  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  45.14 
 
 
477 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  41.93 
 
 
506 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  41.13 
 
 
510 aa  349  8e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  36.97 
 
 
502 aa  271  2e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  35.26 
 
 
529 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  36.9 
 
 
505 aa  268  1e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  35.36 
 
 
520 aa  264  3e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  38.72 
 
 
522 aa  263  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
526 aa  249  7e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  32.35 
 
 
553 aa  230  4e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  34.85 
 
 
528 aa  224  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  32.29 
 
 
479 aa  206  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  33.89 
 
 
520 aa  205  2e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  30.8 
 
 
509 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  31.86 
 
 
524 aa  202  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  30.66 
 
 
509 aa  201  3e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  32.45 
 
 
504 aa  200  5e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3440  apolipoprotein N-acyltransferase  32.01 
 
 
514 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.79664e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0821  apolipoprotein N-acyltransferase  32.3 
 
 
518 aa  200  5e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00195266  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  34.5 
 
 
552 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  29.42 
 
 
513 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
523 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  32.69 
 
 
523 aa  194  3e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  31.75 
 
 
532 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  30.93 
 
 
509 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0018  apolipoprotein N-acyltransferase  32.3 
 
 
535 aa  190  5e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.06922 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  29.96 
 
 
560 aa  189  9e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2709  apolipoprotein N-acyltransferase  33.95 
 
 
604 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1977  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
530 aa  189  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.925969  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  32.06 
 
 
589 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0231  apolipoprotein N-acyltransferase  32.15 
 
 
556 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.448877  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  30.06 
 
 
523 aa  187  4e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  31.34 
 
 
511 aa  186  7e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  29.47 
 
 
515 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  29.47 
 
 
515 aa  186  8e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  29.47 
 
 
515 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  32.16 
 
 
550 aa  186  1.0000000000000001e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  33.54 
 
 
531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  31.99 
 
 
536 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  32.61 
 
 
528 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  30.04 
 
 
506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  34.54 
 
 
557 aa  182  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  30.56 
 
 
529 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.56 
 
 
529 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  32.26 
 
 
512 aa  182  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  30.56 
 
 
529 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.56 
 
 
529 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  31.4 
 
 
554 aa  182  2e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  29.96 
 
 
537 aa  182  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.52 
 
 
509 aa  182  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 
512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 
512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  32.26 
 
 
512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4441  apolipoprotein N-acyltransferase  32.39 
 
 
502 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  30.43 
 
 
512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  32.05 
 
 
512 aa  180  4.999999999999999e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0594  apolipoprotein N-acyltransferase  33.03 
 
 
536 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  33.97 
 
 
541 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  31.84 
 
 
512 aa  179  8e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.35 
 
 
529 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  32.81 
 
 
512 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  32.81 
 
 
508 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  31.29 
 
 
534 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  32.58 
 
 
590 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  31.41 
 
 
512 aa  177  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  30.83 
 
 
497 aa  177  3e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0635  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
543 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.578942 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  32.42 
 
 
590 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
532 aa  177  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
532 aa  177  4e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  29.01 
 
 
545 aa  177  6e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0448  apolipoprotein N-acyltransferase  32.51 
 
 
536 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1330  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
519 aa  174  3.9999999999999995e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.17082  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2859  apolipoprotein N-acyltransferase  27.23 
 
 
518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3178  apolipoprotein N-acyltransferase  32.32 
 
 
553 aa  174  5e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0696022  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0497  apolipoprotein N-acyltransferase  29.05 
 
 
472 aa  173  6.999999999999999e-42  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.367555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0050  apolipoprotein N-acyltransferase  30.5 
 
 
536 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3037  apolipoprotein N-acyltransferase  31.16 
 
 
537 aa  172  1e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
534 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0986  apolipoprotein N-acyltransferase  26.47 
 
 
760 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  34.26 
 
 
505 aa  170  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  29.1 
 
 
526 aa  170  8e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  29.11 
 
 
516 aa  169  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1247  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
541 aa  168  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.620781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  29.6 
 
 
520 aa  168  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  31.29 
 
 
524 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  29 
 
 
500 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  26.79 
 
 
537 aa  168  2.9999999999999998e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  31.96 
 
 
534 aa  167  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  31.65 
 
 
521 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  27.1 
 
 
634 aa  167  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  32.28 
 
 
532 aa  166  9e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>