More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0081 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0081  aspartate aminotransferase  100 
 
 
395 aa  814  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0248669  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1171  aspartate aminotransferase  59.54 
 
 
396 aa  475  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1148  aspartate aminotransferase  53.96 
 
 
395 aa  445  1e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000148908  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2027  aspartate aminotransferase  52.32 
 
 
396 aa  429  1e-119  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.77317e-09  hitchhiker  0.0077207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1061  aspartate aminotransferase  53.9 
 
 
398 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0613658  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1313  aspartate aminotransferase  52.99 
 
 
397 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  2.11162e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0732  aspartate aminotransferase  52.9 
 
 
397 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3354  aspartate aminotransferase  52.14 
 
 
396 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3303  aspartate aminotransferase  52.41 
 
 
397 aa  420  1e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.597513  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1888  aspartate aminotransferase  51.8 
 
 
396 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.2706e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2600  aspartate aminotransferase  52.93 
 
 
397 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00026488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0961  aspartate aminotransferase  51.89 
 
 
397 aa  416  1e-115  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.173671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1046  aspartate aminotransferase  51.65 
 
 
398 aa  415  1e-115  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2889  aspartate aminotransferase  51.93 
 
 
394 aa  416  1e-115  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.425013 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2140  aspartate aminotransferase  52.19 
 
 
393 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3287  aspartate aminotransferase  51.64 
 
 
397 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1103  aspartate aminotransferase  51.66 
 
 
461 aa  401  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2089  aspartate aminotransferase  48.35 
 
 
398 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.12088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0580  aspartate aminotransferase  48.05 
 
 
397 aa  382  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2093  aspartate aminotransferase  46.94 
 
 
393 aa  383  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0365484  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0562  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 
398 aa  368  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1965  aspartate aminotransferase  47.97 
 
 
393 aa  371  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0565  aspartate aminotransferase  49.75 
 
 
398 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2311  aspartate aminotransferase  47.22 
 
 
398 aa  365  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  7.26355e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3530  aspartate aminotransferase  46.55 
 
 
395 aa  355  9e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00117906  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0533  aspartate aminotransferase  48.56 
 
 
400 aa  345  9e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.865322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01850  aspartate aminotransferase  44.5 
 
 
395 aa  314  2e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02010  aspartate aminotransferase  42.41 
 
 
393 aa  314  2e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.951604 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0108  aspartate aminotransferase  40.96 
 
 
394 aa  292  7e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.301084 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0522  aspartate aminotransferase  39.85 
 
 
396 aa  288  1e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.138181  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0186  aspartate aminotransferase  42.74 
 
 
393 aa  277  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0140573  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27170  aspartate aminotransferase  40.69 
 
 
393 aa  271  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3157  aminotransferase  35.21 
 
 
405 aa  207  2e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2832  aminotransferase class I and II  33.08 
 
 
404 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.642914 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3525  aminotransferase  32.45 
 
 
403 aa  200  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5530  aminotransferase class I and II  33.51 
 
 
397 aa  186  7e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.490736 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1558  aminotransferase class I and II  30.91 
 
 
389 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2315  aminotransferase  31.18 
 
 
389 aa  175  1e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1633  aminotransferase class I and II  30.65 
 
 
389 aa  174  3e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1291  aminotransferase class I and II  31.91 
 
 
389 aa  166  6e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.406231  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0542  aminotransferase, class I and II  31.37 
 
 
367 aa  159  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0515807  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0897  aspartate aminotransferase  30.37 
 
 
389 aa  159  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0789129  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1192  aminotransferase class I and II  27.2 
 
 
375 aa  158  2e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0429  aminotransferase class I and II  30 
 
 
390 aa  152  9e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0517  aminotransferase  28.72 
 
 
375 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3530  aminotransferase class I and II  31.56 
 
 
373 aa  150  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.903245  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  29.34 
 
 
377 aa  149  1e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0395  aminotransferase class I and II  29.62 
 
 
375 aa  148  1e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292945  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  29.34 
 
 
377 aa  149  1e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6643  aspartate aminotransferase  28.99 
 
 
413 aa  147  2e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1888  aminotransferase  30.13 
 
 
370 aa  147  3e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  31.42 
 
 
397 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0168  aminotransferase, class I and II  30.99 
 
 
400 aa  147  4e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14940  putative aminotransferase  32.98 
 
 
382 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.779314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1983  aminotransferase class I and II  28.88 
 
 
373 aa  146  7e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0325  aminotransferase class I and II  28.2 
 
 
375 aa  146  7e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.303015  hitchhiker  0.000770827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0710  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 
382 aa  146  7e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1911  aspartate aminotransferase  29.89 
 
 
386 aa  145  8e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0860695  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3018  aminotransferase class I and II  28.81 
 
 
383 aa  145  1e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1620  aspartate aminotransferase  31 
 
 
401 aa  145  1e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.83573  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  28.73 
 
 
373 aa  145  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1393  aminotransferase class I and II  28.76 
 
 
373 aa  145  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  29.3 
 
 
385 aa  144  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1317  putative aminotransferase  32.72 
 
 
382 aa  144  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1587  aminotransferase class I and II  28.3 
 
 
375 aa  143  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.472479  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0784  aminotransferase  28.75 
 
 
403 aa  142  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0364994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0059  aspartate aminotransferase  29.89 
 
 
376 aa  142  8e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0421  aspartate aminotransferase  28.76 
 
 
380 aa  142  1e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.248364  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14321  aminotransferases class-I  31.65 
 
 
392 aa  142  1e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1200  aminotransferase, class I and II  30.37 
 
 
371 aa  142  1e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162477  normal  0.0266801 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0545  aminotransferase class I and II  28.07 
 
 
373 aa  142  1e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  26.32 
 
 
392 aa  140  4e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0583  aspartate aminotransferase  29.03 
 
 
388 aa  140  5e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.404967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1490  L-aspartate aminotransferase  30.45 
 
 
396 aa  140  5e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1454  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 
395 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4968  aminotransferase class I and II  29.47 
 
 
404 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.121403 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1426  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 
395 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1427  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 
395 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1568  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 
395 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1601  aspartate aminotransferase  28.99 
 
 
395 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.43863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1639  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 
395 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000120157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1712  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 
395 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.59703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  28.27 
 
 
390 aa  139  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0928  aspartate aminotransferase  28.34 
 
 
392 aa  139  8e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.436477  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  28.44 
 
 
383 aa  139  9e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1674  aspartate aminotransferase  29.49 
 
 
395 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3744  aspartate aminotransferase  28.75 
 
 
395 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.369906  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03600  aspartate aminotransferase  28.46 
 
 
411 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1121  aminotransferase class I and II  29.44 
 
 
381 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2321  aminotransferase class I and II  28.68 
 
 
397 aa  138  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  7.44146e-05  hitchhiker  0.00241893 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4320  putative aminotransferase  30.89 
 
 
382 aa  137  3e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000717764 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0106  L-aspartate aminotransferase  28.98 
 
 
392 aa  137  3e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2121  aminotransferase  31.95 
 
 
386 aa  137  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.799359  normal  0.288455 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  28.97 
 
 
407 aa  137  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1382  aminotransferase  28.46 
 
 
397 aa  137  4e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07311  aminotransferases class-I  28.98 
 
 
392 aa  136  5e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.719619  hitchhiker  0.00557892 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  29.72 
 
 
383 aa  136  5e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4596  putative aminotransferase  29.95 
 
 
382 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.438457  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0507  aspartate aminotransferase  28.88 
 
 
393 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0056  aspartate aminotransferase  27.03 
 
 
379 aa  136  6e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>