More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1128 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  100 
 
 		 310 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  99.03 
 
 		 310 aa  630  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  90 
 
 		 310 aa  570  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  38.91 
 
 		 309 aa  210  3e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  39.16 
 
 		 306 aa  207  2e-52  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.6 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  38.51 
 
 		 311 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  38.51 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  37.26 
 
 		 316 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  35.58 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  35.81 
 
 		 315 aa  194  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  37.54 
 
 		 308 aa  189  5.999999999999999e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  38.22 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 		 310 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  37.1 
 
 		 306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  35.71 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  34.52 
 
 		 310 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  35.39 
 
 		 332 aa  182  9.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  38.06 
 
 		 306 aa  181  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  37.74 
 
 		 306 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  36.06 
 
 		 330 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 306 aa  176  3e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.66 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  33.66 
 
 		 308 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  36.36 
 
 		 311 aa  172  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  35.81 
 
 		 307 aa  171  1e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  33.66 
 
 		 307 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.35 
 
 		 350 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  34.94 
 
 		 311 aa  169  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  34.73 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  32.9 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  35.97 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 315 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  34.51 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  33.87 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  30.87 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  38.22 
 
 		 314 aa  163  4.0000000000000004e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  34.78 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.82 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.49 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  34.11 
 
 		 310 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.84 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  33.77 
 
 		 302 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  31.07 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  34.68 
 
 		 326 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  35.97 
 
 		 315 aa  159  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  34.29 
 
 		 303 aa  159  5e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  34.88 
 
 		 332 aa  159  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  33.65 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  32.43 
 
 		 311 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  34.23 
 
 		 312 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  33.1 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  33.33 
 
 		 312 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.76 
 
 		 311 aa  155  6e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  37.75 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  34.25 
 
 		 310 aa  155  7e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.39 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  33.67 
 
 		 314 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 		 303 aa  154  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  34.21 
 
 		 310 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  30.79 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  34.68 
 
 		 339 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  34.56 
 
 		 312 aa  152  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  32.99 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 308 aa  151  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  33.22 
 
 		 305 aa  151  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  32.99 
 
 		 310 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  33.45 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  31.96 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1715  1-phosphofructokinase  32.75 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0124399  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  33.22 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  30.42 
 
 		 318 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0078  1-phosphofructokinase  32.7 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  34.34 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  34.34 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  34.34 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  34.34 
 
 		 310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  33.12 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1440  6-phosphofructokinase 2  34.01 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0828  1-phosphofructokinase  31.08 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.904747 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000223  1-phosphofructokinase  29.39 
 
 		 323 aa  144  2e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0817  1-phosphofructokinase  30.27 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.419127 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0794  1-phosphofructokinase  30.27 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0702264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 325 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>