150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0998 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  100 
 
 
182 aa  351  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  43.18 
 
 
187 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0243  BioY protein  41.29 
 
 
182 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.360915  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0108  hypothetical protein  37.76 
 
 
198 aa  98.2  6e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.307903  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  36.41 
 
 
187 aa  97.8  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  36.93 
 
 
192 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.69 
 
 
190 aa  93.2  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2947  BioY protein  36.24 
 
 
187 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000305792  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  34.81 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  35.06 
 
 
187 aa  84.7  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  36.57 
 
 
169 aa  84.3  8e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  36.57 
 
 
169 aa  84.3  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  37.25 
 
 
187 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  32.61 
 
 
182 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.26 
 
 
184 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  33.51 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  33.51 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5049  bioY family protein  36.84 
 
 
197 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.925565  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2875  BioY protein  36.36 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000912957  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  31.65 
 
 
205 aa  72  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0185  bioY family protein  36.09 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  38.06 
 
 
185 aa  72  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5056  bioY family protein  36.84 
 
 
197 aa  71.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.745684  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  33.11 
 
 
184 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  34.13 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4787  bioY family protein  35.34 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000360294  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4627  biotin synthesis BioY protein  35.34 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.33055e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4649  biotin synthesis BioY protein  35.34 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000112597  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  37.31 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5150  bioY family protein  35.34 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.85197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5028  bioY family protein  35.34 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4332  BioY protein  31.52 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000491401  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5061  bioY family protein  35.34 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0140  BioY protein  46.74 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000411922 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0143  BioY protein  46.74 
 
 
216 aa  68.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  31.82 
 
 
169 aa  68.6  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3020  BioY protein  37.01 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4739  BioY protein  35.34 
 
 
197 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3528  BioY protein  32.05 
 
 
198 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  31.58 
 
 
176 aa  67  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0302  hypothetical protein  36.99 
 
 
189 aa  65.9  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  29.35 
 
 
184 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  32.26 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  31.95 
 
 
182 aa  65.5  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3107  Na+/H+ antiporter  30.99 
 
 
192 aa  64.3  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.468263  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  31.69 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  34.34 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  31.72 
 
 
197 aa  64.3  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  31.67 
 
 
191 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  32.26 
 
 
195 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  31.72 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.11 
 
 
187 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  38.3 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  39.72 
 
 
192 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  31.77 
 
 
210 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  30.81 
 
 
191 aa  61.6  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  31.52 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  31.58 
 
 
187 aa  62  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1530  BioY protein  43.48 
 
 
206 aa  61.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  37.32 
 
 
189 aa  61.2  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1212  BioY protein  33.33 
 
 
189 aa  60.8  0.00000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1432  BioY protein  37.31 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  37.14 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16541  hypothetical protein  38.1 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.724411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4972  BioY protein  41.3 
 
 
220 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  32.09 
 
 
189 aa  58.5  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  31.79 
 
 
235 aa  58.5  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3532  BioY protein  36.72 
 
 
194 aa  57.8  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.173821  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0539  BioY protein  38.62 
 
 
193 aa  57  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.252714  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  36.17 
 
 
192 aa  57.4  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  33.79 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  31.18 
 
 
208 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  27.27 
 
 
208 aa  55.8  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  28.74 
 
 
215 aa  55.8  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  31.78 
 
 
169 aa  55.5  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0147  hypothetical protein  44.12 
 
 
176 aa  55.5  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  34.48 
 
 
203 aa  55.1  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  30.17 
 
 
182 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07791  hypothetical protein  44.12 
 
 
176 aa  55.1  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.115634  normal  0.0587482 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  33.94 
 
 
188 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  30.91 
 
 
179 aa  55.1  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  31.69 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  31.43 
 
 
182 aa  54.3  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  30.23 
 
 
169 aa  53.5  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  27.89 
 
 
215 aa  52.4  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  30.6 
 
 
191 aa  52.4  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2476  BioY protein  30.83 
 
 
196 aa  52  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  31.15 
 
 
191 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  31.15 
 
 
191 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  33.12 
 
 
205 aa  51.6  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  32.41 
 
 
174 aa  51.6  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1257  BioY protein  34.78 
 
 
189 aa  50.8  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.397395  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  30.54 
 
 
216 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  30.77 
 
 
205 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0571  BioY protein  37.76 
 
 
193 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2329  BioY protein  33.93 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  30.6 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  30.6 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  31.03 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  30 
 
 
182 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>