More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0008 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 421 aa  865    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  68.35 
 
 		 424 aa  614  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  67.39 
 
 		 423 aa  599  1e-170  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  65.95 
 
 		 423 aa  591  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  67.46 
 
 		 424 aa  588  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  67.22 
 
 		 424 aa  585  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  64.52 
 
 		 422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 424 aa  579  1e-164  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  66.99 
 
 		 424 aa  578  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  65.79 
 
 		 424 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 424 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  66.27 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  66.51 
 
 		 424 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  64.13 
 
 		 423 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  65.32 
 
 		 420 aa  561  1.0000000000000001e-159  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  64.99 
 
 		 427 aa  561  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  62.11 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  63.64 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  62.77 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  62.53 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  61.87 
 
 		 425 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 422 aa  537  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  60.29 
 
 		 424 aa  530  1e-149  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  61.15 
 
 		 422 aa  526  1e-148  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  61.39 
 
 		 422 aa  527  1e-148  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  61.63 
 
 		 423 aa  527  1e-148  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  63.31 
 
 		 423 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 425 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  60.67 
 
 		 423 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  58.53 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 422 aa  514  1.0000000000000001e-145  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  57.79 
 
 		 425 aa  514  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  58.75 
 
 		 422 aa  511  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 422 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 423 aa  509  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 424 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  58.99 
 
 		 425 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 426 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  57.18 
 
 		 426 aa  501  1e-141  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  55.77 
 
 		 427 aa  500  1e-140  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 422 aa  496  1e-139  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  58.59 
 
 		 432 aa  497  1e-139  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  56.59 
 
 		 425 aa  494  1e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 425 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 428 aa  490  1e-137  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  57.07 
 
 		 427 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  56.97 
 
 		 424 aa  487  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26270  seryl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 428 aa  486  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1870  seryl-tRNA synthetase  56.94 
 
 		 423 aa  486  1e-136  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.961379  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  55.5 
 
 		 417 aa  482  1e-135  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0009  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0009  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 428 aa  484  1e-135  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 430 aa  484  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0102  seryl-tRNA synthetase  54.12 
 
 		 424 aa  481  1e-134  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.133347  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0541  seryl-tRNA synthetase  55.64 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 423 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1300  seryl-tRNA synthetase  55.71 
 
 		 427 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.341204  normal  0.68468 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1828  seryl-tRNA synthetase  55.14 
 
 		 430 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0097  seryl-tRNA synthetase  53.55 
 
 		 435 aa  471  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000017376  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4645  seryl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 424 aa  471  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000263094  normal  0.52654 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1518  seryl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 426 aa  466  9.999999999999999e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03450  seryl-tRNA synthetase  54.89 
 
 		 427 aa  466  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.375203 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  55.61 
 
 		 424 aa  464  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30330  seryl-tRNA synthetase  53.29 
 
 		 426 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.705305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1338  seryl-tRNA synthetase  53.33 
 
 		 427 aa  461  9.999999999999999e-129  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00311598 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  53.05 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2596  seryl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1621  seryl-tRNA synthetase  53.9 
 
 		 436 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00511187  normal  0.0677576 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1450  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 425 aa  455  1e-127  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0182  seryl-tRNA synthetase  53.76 
 
 		 435 aa  457  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.38997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 426 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1724  seryl-tRNA synthetase  53.26 
 
 		 426 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2932  seryl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 427 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.426668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  52.35 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  51.88 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1560  seryl-tRNA synthetase  53.12 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 434 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0768  seryl-tRNA synthetase  51.65 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0579537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0449  seryl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 428 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2729  seryl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 426 aa  450  1e-125  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  51.18 
 
 		 428 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1189  seryl-tRNA synthetase  52.76 
 
 		 426 aa  449  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.520559  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3186  seryl-tRNA synthetase  51.99 
 
 		 427 aa  451  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  52.1 
 
 		 435 aa  449  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1044  seryl-tRNA synthetase  52.48 
 
 		 431 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.682379 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2991  seryl-tRNA synthetase  52.78 
 
 		 429 aa  450  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1339  seryl-tRNA synthetase  52.25 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0130081  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  52.13 
 
 		 428 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3038  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2681  seryl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 430 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.252056  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2986  seryl-tRNA synthetase  52.96 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340897  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1565  seryl-tRNA synthetase  52.72 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382494  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  51.42 
 
 		 428 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>