More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1584 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  100 
 
 
219 aa  435  1e-121  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  46.95 
 
 
215 aa  203  1e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  43.46 
 
 
221 aa  200  1e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  43.46 
 
 
221 aa  200  2e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  45.07 
 
 
217 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  44.13 
 
 
220 aa  189  3e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00527e-08  hitchhiker  1.67844e-14 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  46.45 
 
 
215 aa  187  8e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.26197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  47.22 
 
 
227 aa  183  2e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  44.39 
 
 
220 aa  182  5e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  41.47 
 
 
221 aa  179  3e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  41.01 
 
 
221 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  41.01 
 
 
221 aa  178  6e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  42.45 
 
 
217 aa  175  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  42.25 
 
 
221 aa  168  6e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  44.12 
 
 
222 aa  168  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  40.38 
 
 
233 aa  167  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  40 
 
 
233 aa  166  3e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  43.14 
 
 
222 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  41.23 
 
 
217 aa  164  9e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  41.06 
 
 
223 aa  163  2e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  38.79 
 
 
231 aa  162  5e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  41.86 
 
 
222 aa  160  1e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  39.07 
 
 
229 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  39.07 
 
 
229 aa  159  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  39.72 
 
 
231 aa  158  5e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  38.43 
 
 
232 aa  157  1e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  36.45 
 
 
217 aa  156  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.30553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  40.87 
 
 
221 aa  154  9e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  35.68 
 
 
220 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  35.68 
 
 
220 aa  153  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  38.03 
 
 
219 aa  151  8e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  40.65 
 
 
231 aa  151  9e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  38.42 
 
 
217 aa  150  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  37.44 
 
 
219 aa  150  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  36.92 
 
 
217 aa  145  4e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  36.27 
 
 
216 aa  144  7e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  36.45 
 
 
216 aa  142  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  37.38 
 
 
250 aa  140  1e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  40.38 
 
 
220 aa  139  2e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0728  TrkA-N domain protein  40.18 
 
 
221 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.439731  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  37.9 
 
 
227 aa  139  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  40.38 
 
 
220 aa  139  5e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  37.86 
 
 
218 aa  138  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1659  TrkA-N  33.8 
 
 
217 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0583689  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  38.03 
 
 
224 aa  136  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  34.91 
 
 
218 aa  136  3e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  35.32 
 
 
224 aa  136  3e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24350  K+ transport system, NAD-binding component  37.02 
 
 
221 aa  134  7e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  38.5 
 
 
222 aa  132  4e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  37.98 
 
 
225 aa  131  7e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  37.07 
 
 
224 aa  130  1e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  32.89 
 
 
233 aa  130  1e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  41.11 
 
 
222 aa  130  2e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  35.61 
 
 
220 aa  129  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  37 
 
 
217 aa  129  4e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  35.21 
 
 
223 aa  128  7e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0375  K+ transporter  32.41 
 
 
220 aa  128  8e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.506643  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 
218 aa  127  9e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  36.45 
 
 
223 aa  127  1e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1541  TrkA-N domain protein  36.41 
 
 
221 aa  127  1e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0630  TrkA-N domain protein  35.41 
 
 
219 aa  127  1e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.208337  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1631  Trk family potassium uptake protein , putative  35.02 
 
 
223 aa  127  1e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  37.26 
 
 
222 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1793  TrkA-N domain protein  33.49 
 
 
220 aa  125  4e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  35.61 
 
 
224 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  34.33 
 
 
213 aa  125  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  35.19 
 
 
224 aa  124  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  34.26 
 
 
217 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  36.79 
 
 
225 aa  123  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  35.85 
 
 
228 aa  122  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  35.58 
 
 
230 aa  122  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  35.85 
 
 
228 aa  122  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  35.85 
 
 
224 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  38 
 
 
224 aa  120  2e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0519  TrkA-N domain protein  35.27 
 
 
225 aa  119  5e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.416454  normal  0.506126 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  38.79 
 
 
234 aa  119  5e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4040  TrkA-N domain protein  35.98 
 
 
221 aa  118  8e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.425859  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  36.02 
 
 
220 aa  117  1e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0379  VIC family potassium channel protein  38.14 
 
 
234 aa  117  1e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1606  K+ uptake transporter, KtrA subunit  33.18 
 
 
233 aa  117  2e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000611134  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0313  TrkA domain-containing protein  33.93 
 
 
230 aa  116  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000239618  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0058  potassium uptake protein, putative  38.71 
 
 
232 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0055  TrkA domain-containing protein  35.79 
 
 
232 aa  115  7e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  8.27601e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0050  TrkA domain-containing protein  35.79 
 
 
232 aa  114  1e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0750  TrkA domain-containing protein  39.1 
 
 
217 aa  114  1e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.803573  normal  0.253071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  36.95 
 
 
220 aa  114  1e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  33.96 
 
 
222 aa  113  2e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 
218 aa  114  2e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  31.16 
 
 
214 aa  112  3e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06980  K+ transport system, NAD-binding component  35.38 
 
 
232 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0459  TrkA-N domain protein  34.62 
 
 
231 aa  113  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.821137  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0529  hypothetical protein  33.81 
 
 
217 aa  112  4e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>