32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0014 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0014  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  100 
 
 		 261 aa  515  1.0000000000000001e-145  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  42.08 
 
 		 268 aa  194  8.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  31.62 
 
 		 1163 aa  68.6  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  33.8 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  30.31 
 
 		 999 aa  59.3  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 1116 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  29.44 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.98 
 
 		 1055 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 775 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5030  transcriptional activator domain-containing protein  26.42 
 
 		 1056 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.311949  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.94 
 
 		 561 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.79 
 
 		 572 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  27.59 
 
 		 1013 aa  52  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  29.24 
 
 		 1029 aa  51.6  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 423 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  30.7 
 
 		 1109 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  27.16 
 
 		 597 aa  47.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3523  transcriptional activator domain  27.95 
 
 		 1055 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  26.86 
 
 		 985 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2405  transcriptional activator domain protein  32.56 
 
 		 1025 aa  45.8  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.375799  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0439  SARP family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 630 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.235011 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  30 
 
 		 1118 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  29.44 
 
 		 661 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.57 
 
 		 1111 aa  45.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.91 
 
 		 1108 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  25.71 
 
 		 1108 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  30 
 
 		 1118 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  25.7 
 
 		 1071 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  29.51 
 
 		 1075 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  26.92 
 
 		 1095 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  25.44 
 
 		 1061 aa  43.5  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1110  transcriptional activator domain-containing protein  27.08 
 
 		 1082 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>