25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4525 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4525  Parallel beta-helix repeat protein  100 
 
 		 488 aa  985    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000043731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  39.39 
 
 		 635 aa  87.8  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  39.39 
 
 		 635 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  46.67 
 
 		 1011 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  42.22 
 
 		 1022 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  43.01 
 
 		 634 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.11 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  41.11 
 
 		 1376 aa  63.5  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.54 
 
 		 1004 aa  62.4  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  35.42 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  42.47 
 
 		 835 aa  59.3  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  38.2 
 
 		 1601 aa  51.6  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  36 
 
 		 460 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2012  Parallel beta-helix repeat protein  25.14 
 
 		 414 aa  50.4  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  35.06 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0152  PKD  35.8 
 
 		 506 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000535415  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  37.74 
 
 		 855 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  35.83 
 
 		 848 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  31.52 
 
 		 746 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1432  hypothetical protein  38.24 
 
 		 1175 aa  45.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.974994  normal  0.889797 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3705  hypothetical protein  31.03 
 
 		 442 aa  44.7  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0479966 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  36.26 
 
 		 1084 aa  44.3  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0363  parallel beta-helix repeat-containing protein  26.92 
 
 		 934 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000494695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  38.1 
 
 		 994 aa  43.9  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.81 
 
 		 1212 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>