More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3926 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3926  Ppx/GppA phosphatase  100 
 
 
311 aa  644  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0096  Ppx/GppA phosphatase  61.06 
 
 
306 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0316  exopolyphosphatase  48.87 
 
 
314 aa  298  9e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0022  Ppx/GppA phosphatase  42.19 
 
 
321 aa  238  9e-62  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3210  Ppx/GppA phosphatase  40.2 
 
 
305 aa  225  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.307679  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5174  Ppx/GppA phosphatase  39.61 
 
 
298 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.985402  normal  0.0128836 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1993  Ppx/GppA phosphatase  33.11 
 
 
519 aa  166  3e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0423  exopolyphosphatase, putative  33.44 
 
 
519 aa  165  9e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0454  Ppx/GppA phosphatase  31.72 
 
 
521 aa  164  1e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.976943 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0489  Ppx/GppA phosphatase  31.51 
 
 
527 aa  163  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0501  Ppx/GppA phosphatase  31.8 
 
 
519 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1244  Ppx/GppA phosphatase  32.79 
 
 
534 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.199997  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0498  Ppx/GppA phosphatase  30.5 
 
 
521 aa  152  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1684  exopolyphosphatase, putative  31.02 
 
 
514 aa  152  5e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1083  Ppx/GppA phosphatase  30.55 
 
 
570 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.376324  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3530  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 
550 aa  139  9e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4141  Ppx/GppA phosphatase  29.58 
 
 
557 aa  134  1e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3658  Ppx/GppA phosphatase  28.94 
 
 
545 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3712  Ppx/GppA phosphatase  28.94 
 
 
545 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.42303 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1198  Ppx/GppA phosphatase  29.49 
 
 
549 aa  132  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1456  Ppx/GppA phosphatase  29.84 
 
 
553 aa  132  1e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.240113 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0231  Ppx/GppA phosphatase  30.25 
 
 
544 aa  132  1e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.448988 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0623  exopolyphosphatase  28.98 
 
 
545 aa  126  4e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.797716  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1965  exopolyphosphatase  27.65 
 
 
549 aa  125  8e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.363541  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0473  Ppx/GppA phosphatase  29.38 
 
 
435 aa  125  9e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0132  Ppx/GppA phosphatase  31.11 
 
 
311 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1871  Ppx/GppA phosphatase  27.36 
 
 
497 aa  124  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.855928  normal  0.965208 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1573  Ppx/GppA phosphatase  27.39 
 
 
505 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1789  putative exopolyphosphatase  28.21 
 
 
544 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.810374  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1160  Ppx/GppA phosphatase  28.94 
 
 
550 aa  123  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05121  putative exopolyphosphatase  28.21 
 
 
544 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.434231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3129  Ppx/GppA phosphatase  30.97 
 
 
311 aa  122  9e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal  0.0109976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2578  Ppx/GppA phosphatase  26.84 
 
 
506 aa  122  9e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1955  Ppx/GppA phosphatase  30.1 
 
 
523 aa  121  1e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0958558 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5209  Ppx/GppA phosphatase  28.66 
 
 
310 aa  121  1e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2990  Ppx/GppA phosphatase  26.84 
 
 
519 aa  119  6e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2570  Ppx/GppA phosphatase  27.42 
 
 
513 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1739  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  29.11 
 
 
532 aa  119  8e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.22047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2559  exopolyphosphatase, putative  27.63 
 
 
513 aa  119  8e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0697  Ppx/GppA phosphatase  29.04 
 
 
301 aa  118  1e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.53349e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0411  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
308 aa  116  4e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2233  Ppx/GppA phosphatase  30.52 
 
 
511 aa  115  8e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1994  Ppx/GppA phosphatase  30.52 
 
 
510 aa  115  9e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.31495e-15 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0702  Ppx/GppA phosphatase  28.1 
 
 
307 aa  115  1e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.176002  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3431  Ppx/GppA phosphatase  27.91 
 
 
308 aa  115  1e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1192  Ppx/GppA phosphatase  30.99 
 
 
500 aa  114  1e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0340  Ppx/GppA phosphatase  27.21 
 
 
310 aa  114  1e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00977932  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1741  Ppx/GppA family phosphatase  30.29 
 
 
307 aa  115  1e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0193404  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3990  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 
505 aa  114  2e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1828  Ppx/GppA phosphatase  28.9 
 
 
304 aa  114  2e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.707842  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6748  Ppx/GppA phosphatase  27.69 
 
 
339 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.740165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8578  Ppx/GppA phosphatase  29.43 
 
 
319 aa  111  1e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.297052  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1779  Ppx/GppA phosphatase  30.99 
 
 
311 aa  112  1e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.863936  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0457  putative exopolyphosphatase  27.1 
 
 
531 aa  110  2e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.337159  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0819  Ppx/GppA phosphatase  30.63 
 
 
500 aa  110  2e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4617  Ppx/GppA phosphatase  28.3 
 
 
502 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1332  exopolyphosphatase  27.57 
 
 
511 aa  110  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04821  putative exopolyphosphatase  27.42 
 
 
531 aa  110  4e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.467797  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0301  Ppx/GppA phosphatase  25.97 
 
 
500 aa  110  4e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5249  exopolyphosphatase  25.89 
 
 
500 aa  110  4e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0474  Ppx/GppA phosphatase  26.38 
 
 
508 aa  110  4e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04581  putative exopolyphosphatase  27.24 
 
 
539 aa  110  4e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0412  Ppx/GppA phosphatase  27.57 
 
 
308 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3613  Ppx/GppA phosphatase  27.57 
 
 
308 aa  109  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03154  putative exopolyphosphatase  26.8 
 
 
520 aa  109  7e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0294  exopolyphosphatase  26.21 
 
 
526 aa  109  7e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5125  Ppx/GppA phosphatase  30.84 
 
 
500 aa  109  7e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5216  Ppx/GppA phosphatase  30.84 
 
 
500 aa  108  8e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2062  exopolyphosphatase, putative  28.21 
 
 
312 aa  108  9e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05131  putative exopolyphosphatase  27.74 
 
 
531 aa  108  9e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0331  Ppx/GppA phosphatase  26.45 
 
 
506 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2733e-08 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2180  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 
317 aa  108  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0173  Ppx/GppA family phosphatase  28.88 
 
 
330 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0173  Ppx/GppA phosphatase  27.27 
 
 
508 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3596  Ppx/GppA phosphatase  29.85 
 
 
357 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.137051  normal  0.0418911 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1906  Ppx/GppA phosphatase  28.34 
 
 
312 aa  107  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2422  Ppx/GppA phosphatase  28.16 
 
 
311 aa  107  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1046  Ppx/GppA phosphatase  27.74 
 
 
491 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.223703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0400  Ppx/GppA phosphatase  26.91 
 
 
303 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.171891  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2821  Ppx/GppA phosphatase  28.57 
 
 
312 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5277  Ppx/GppA phosphatase  30.37 
 
 
500 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.835084  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1892  Ppx/GppA phosphatase  25 
 
 
502 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5039  Ppx/GppA phosphatase  30.84 
 
 
500 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24540  Ppx/GppA phosphatase  27.94 
 
 
314 aa  107  4e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.485932  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4719  Ppx/GppA phosphatase  29.06 
 
 
355 aa  106  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0584151  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0821  Ppx/GppA phosphatase  25.32 
 
 
508 aa  105  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1851  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
311 aa  105  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210768  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0341  exopolyphosphatase  25.48 
 
 
516 aa  105  8e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.859859  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2946  exopolyphosphatase  26.91 
 
 
511 aa  105  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0278  Ppx/GppA phosphatase  27.21 
 
 
501 aa  105  8e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00854606  normal  0.782575 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2467  Guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  25.99 
 
 
500 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0515  Ppx/GppA phosphatase  26.3 
 
 
311 aa  105  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0265518 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2249  Ppx/GppA phosphatase  28.53 
 
 
499 aa  105  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1039  Ppx/GppA phosphatase  27.56 
 
 
308 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4108  guanosine-5'-triphosphate,3'-diphosphate diphosphatase  26.21 
 
 
305 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000620786  hitchhiker  0.000265887 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02700  exopolyphosphatase  24.92 
 
 
323 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1235  exopolyphosphatase  27.15 
 
 
509 aa  104  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1150  Ppx/GppA phosphatase  32.04 
 
 
315 aa  104  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.198384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3950  Ppx/GppA phosphatase  26.58 
 
 
308 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3323  Ppx/GppA phosphatase  25.73 
 
 
509 aa  104  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>