39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3336 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  100 
 
 		 389 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  52.06 
 
 		 390 aa  431  1e-119  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  41.45 
 
 		 400 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  40.97 
 
 		 434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  40.64 
 
 		 434 aa  273  3e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  38.08 
 
 		 405 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  37.81 
 
 		 394 aa  260  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  36.07 
 
 		 414 aa  258  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  33.59 
 
 		 380 aa  232  7.000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  35.69 
 
 		 398 aa  227  3e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  35.09 
 
 		 437 aa  226  4e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  36.66 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  35.91 
 
 		 414 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  31.82 
 
 		 378 aa  206  5e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  30.63 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  29.65 
 
 		 396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  29.08 
 
 		 391 aa  166  8e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.08 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.88 
 
 		 393 aa  150  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  29.83 
 
 		 371 aa  137  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  26.44 
 
 		 435 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.2 
 
 		 454 aa  93.6  6e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 435 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 428 aa  79  0.0000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.84 
 
 		 374 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  22.5 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 442 aa  72.8  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.4 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  21.22 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  22.34 
 
 		 456 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  22.26 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 409 aa  50.4  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.02 
 
 		 331 aa  47.8  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 299 aa  47.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 297 aa  47  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3611  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.486041  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.16 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>