More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3133 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3133  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 		 200 aa  418  1e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  62.81 
 
 		 200 aa  263  1e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  38.27 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 202 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  38.86 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 201 aa  112  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  32.83 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.33 
 
 		 444 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.7 
 
 		 442 aa  110  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  37.76 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.46 
 
 		 442 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 448 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 213 aa  106  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  36.18 
 
 		 214 aa  106  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  37.02 
 
 		 208 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.48 
 
 		 442 aa  106  2e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  37.5 
 
 		 213 aa  106  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  38.55 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  38.55 
 
 		 222 aa  105  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  36.46 
 
 		 442 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1538  Phosphoglycerate mutase  39.06 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  34.95 
 
 		 443 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 448 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.87 
 
 		 442 aa  104  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.87 
 
 		 442 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.68 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  32.81 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 213 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33 
 
 		 442 aa  102  5e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 214 aa  101  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  36.27 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.86 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  36.76 
 
 		 445 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 		 447 aa  99.8  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 213 aa  99.4  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  33.52 
 
 		 196 aa  99  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 214 aa  98.6  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0209  phosphoglycerate mutase  35.33 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1381  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 240 aa  98.2  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 212 aa  97.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1760  phosphoglycerate mutase family protein  32.82 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000115709  normal  0.449804 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2007  Phosphoglycerate mutase  37.88 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00274439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 449 aa  96.7  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2646  Phosphoglycerate mutase  34.48 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.451935 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.66 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 		 452 aa  95.9  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  34.24 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  31.47 
 
 		 447 aa  95.1  6e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 		 370 aa  94.4  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 210 aa  92.8  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0968  Phosphoglycerate mutase  30.35 
 
 		 212 aa  92.8  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.667484  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.64 
 
 		 237 aa  92.4  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07531  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  35.48 
 
 		 547 aa  92.8  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  33 
 
 		 206 aa  92.4  4e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13280  fructose-2,6-bisphosphatase  36.32 
 
 		 208 aa  92  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2078  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 212 aa  92  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  40.41 
 
 		 378 aa  92  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1503  Phosphoglycerate mutase  30.3 
 
 		 211 aa  91.7  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 		 207 aa  91.7  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  32.98 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  31 
 
 		 459 aa  90.9  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0606  phosphoglycerate mutase  33.01 
 
 		 218 aa  90.5  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.02 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1570  Phosphoglycerate mutase  36.7 
 
 		 198 aa  89.7  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.638728 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  35.71 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  32.02 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 		 226 aa  90.5  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0045  phosphoglycerate mutase  30.2 
 
 		 217 aa  90.1  2e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.192648  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1761  phosphoglycerate mutase family protein  32.5 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000435031  normal  0.107927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  35.71 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 220 aa  89  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  30.89 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  34.57 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  32.02 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.28 
 
 		 201 aa  87.8  8e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0181  phosphoglycerate mutase  29.15 
 
 		 207 aa  88.2  8e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.215594 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2260  phosphoglycerate mutase  34.01 
 
 		 200 aa  87.8  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0173578  normal  0.0323998 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2253  Phosphoglycerate mutase  35.95 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00114118  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  38.36 
 
 		 378 aa  87  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 		 591 aa  87.4  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2906  Phosphoglycerate mutase  32.98 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0508336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.5 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  31.14 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30 
 
 		 203 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  31.14 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3923  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  32.22 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  31.74 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0586  Phosphoglycerate mutase  31.49 
 
 		 193 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427529  normal  0.250428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>