206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2384 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  100 
 
 
383 aa  768    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  34.05 
 
 
374 aa  179  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  28.75 
 
 
377 aa  123  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  30.19 
 
 
375 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  28.97 
 
 
368 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  29.41 
 
 
395 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  29.41 
 
 
395 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.28 
 
 
340 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  31.44 
 
 
340 aa  106  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  30.83 
 
 
353 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  28.12 
 
 
354 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  32.35 
 
 
342 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  28.9 
 
 
340 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  31.02 
 
 
376 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  30.75 
 
 
367 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  33.64 
 
 
351 aa  92.8  8e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  29.97 
 
 
333 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  29.01 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  28.76 
 
 
383 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.88 
 
 
364 aa  90.1  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  30.24 
 
 
327 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  28.65 
 
 
344 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  29.33 
 
 
353 aa  87.8  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  34.1 
 
 
337 aa  87.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  29.11 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  30.74 
 
 
379 aa  87  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  28.57 
 
 
338 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  27.3 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  29.29 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  26.98 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  28.28 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  28.34 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  27.5 
 
 
335 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  39.62 
 
 
346 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  28.25 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  28.8 
 
 
360 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  28.15 
 
 
362 aa  80.9  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  29.01 
 
 
384 aa  80.5  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  27.84 
 
 
354 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  30.16 
 
 
348 aa  80.1  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  28.06 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  30.4 
 
 
382 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  29.49 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  34.51 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  34.57 
 
 
356 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  26.65 
 
 
342 aa  73.2  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  27.25 
 
 
357 aa  72.8  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  27.24 
 
 
359 aa  71.6  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  25.52 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  30.48 
 
 
366 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  31.25 
 
 
367 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  27.21 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  27.53 
 
 
356 aa  68.9  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  31.65 
 
 
354 aa  69.3  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  25.69 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  33.15 
 
 
351 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5433  acyltransferase 3  27.19 
 
 
395 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372507  normal  0.266014 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  26.8 
 
 
356 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  24.22 
 
 
382 aa  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  29.21 
 
 
354 aa  65.1  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2064  acyltransferase 3  26.3 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0113  acyltransferase 3  34.15 
 
 
564 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.659313  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5890  acyltransferase 3  28.11 
 
 
384 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.12724 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1144  acyltransferase 3  27.72 
 
 
344 aa  63.9  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2761  acyltransferase 3  26.91 
 
 
385 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  27.24 
 
 
372 aa  63.9  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3889  acyltransferase 3  30.37 
 
 
395 aa  63.5  0.000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.013718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  28.62 
 
 
362 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2658  cyclic nucleotide-binding protein  26.15 
 
 
348 aa  62.8  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  33.18 
 
 
335 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2986  acyltransferase 3  31.58 
 
 
404 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652278  normal  0.877328 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2686  acyltransferase 3  27.06 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.251192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0897  acyltransferase family protein  28.92 
 
 
352 aa  59.3  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000451682  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2730  acyltransferase 3  27.06 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.381699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2716  acyltransferase 3  27.06 
 
 
407 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.485537  normal  0.23752 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  27.21 
 
 
307 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5990  acyltransferase 3  30.38 
 
 
397 aa  58.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  24.3 
 
 
359 aa  58.5  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3267  acyltransferase 3  30.53 
 
 
404 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2193  acyltransferase 3  34.34 
 
 
339 aa  58.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.279897  normal  0.667356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1971  acyltransferase 3  26.01 
 
 
403 aa  56.2  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.761747  normal  0.719992 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  26.85 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  27.81 
 
 
658 aa  55.5  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4359  acyltransferase 3  28.25 
 
 
478 aa  54.3  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.188343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  26.38 
 
 
403 aa  54.7  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  31.14 
 
 
400 aa  54.3  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  25.73 
 
 
360 aa  53.5  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0149  cellulose-binding family II protein  24.93 
 
 
362 aa  53.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0727  acyltransferase-like protein  26.49 
 
 
389 aa  53.1  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2796  acyltransferase 3  24.52 
 
 
393 aa  53.1  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0562541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2300  acyltransferase 3  34.48 
 
 
372 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312365  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  30.82 
 
 
381 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10528  membrane acyltransferase  28.11 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0846  hypothetical protein  24.69 
 
 
660 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  30.06 
 
 
660 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7111  acyltransferase 3  22.32 
 
 
383 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0893  acyltransferase family protein  30.23 
 
 
378 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0030172  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  25.19 
 
 
371 aa  52  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2690  acyltransferase 3  26.08 
 
 
715 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.208976  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1392  acyltransferase 3  22.95 
 
 
369 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>