More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1058 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1058  30S ribosomal protein S15  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.297598  normal  0.435501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1985  ribosomal protein S15  72.53 
 
 		 91 aa  135  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000146164  hitchhiker  0.00346286 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1787  30S ribosomal protein S15  67.03 
 
 		 91 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.269109  normal  0.0816599 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0490  ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.515865 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1691  ribosomal protein S15  63.74 
 
 		 89 aa  107  5e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1590  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 88 aa  107  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.18687e-19  normal  0.0361736 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0967  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 88 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355811  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2419  ribosomal protein S15  59.34 
 
 		 89 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.746866  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1445  30S ribosomal protein S15  62.64 
 
 		 88 aa  104  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1758  30S ribosomal protein S15  61.54 
 
 		 89 aa  103  6e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3846  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3659  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000386008  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3549  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3567  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000530871  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1338  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0311618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3945  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3819  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.73221e-63 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1640  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 88 aa  102  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3855  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3906  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2460  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0021133  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3630  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  102  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0989611  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2977  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1740699999999999e-20 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1853  ribosomal protein S15  58.89 
 
 		 92 aa  101  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.601091  normal  0.224539 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2052  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  101  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3671  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 88 aa  101  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000549892  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1307  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 88 aa  102  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000433754  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1333  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.927081  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1359  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3166  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.177567  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1905  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 88 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000149248  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12283  putative 30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  100  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1592  30S ribosomal protein S15  59.55 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000646106  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1560  30S ribosomal protein S15  57.3 
 
 		 88 aa  100  5e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.2194e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2483  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  100  6e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.629413  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0417  30S ribosomal protein S15  61.8 
 
 		 87 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1233  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0542  30S ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  100  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.243245  normal  0.231043 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1160  30S ribosomal protein S15  58.24 
 
 		 89 aa  99.8  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129722  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1746  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  99.4  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0497945  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0905  30S ribosomal protein S15  57.14 
 
 		 89 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.713518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1313  ribosomal protein S15  65.38 
 
 		 88 aa  97.8  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0587112  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1935  30S ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 87 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1653  30S ribosomal protein S15  61.18 
 
 		 87 aa  98.2  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3049  SSU ribosomal protein S15P  54.95 
 
 		 89 aa  97.8  4e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1673  30S ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 88 aa  98.2  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000247174  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3030  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  97.8  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000113979  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1056  30S ribosomal protein S15  58.43 
 
 		 88 aa  97.4  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000322002  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1106  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1166  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466617  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1234  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  97.1  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0854619  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3228  ribosomal protein S15  55.06 
 
 		 90 aa  97.1  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1145  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.150061  normal  0.144917 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3848  ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  95.9  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0933  ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1145  ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3934  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281192  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0840  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3181  ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.624341 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1055  SSU ribosomal protein S15P  52.75 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000690643  hitchhiker  0.0000086131 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2081  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0634  ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0012  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 91 aa  94.4  5e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1951  ribosomal protein S15  56.04 
 
 		 89 aa  94.4  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.245042  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1920  ribosomal protein S15  62.67 
 
 		 87 aa  94  6e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3809  SSU ribosomal protein S15P  52.75 
 
 		 89 aa  93.6  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.017638 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1657  ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  93.6  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.4988  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0964  30S ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.323432  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0892  30S ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4915  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484289  normal  0.692598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2896  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1708  ribosomal protein S15  66.67 
 
 		 87 aa  92  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1029  30S ribosomal protein S15  55.56 
 
 		 90 aa  92.8  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.062544  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0943  30S ribosomal protein S15  56.67 
 
 		 90 aa  91.7  3e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.186111  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0081  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2509  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0477  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0208  30S ribosomal protein S15  48.35 
 
 		 89 aa  92  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000141015  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1338  30S ribosomal protein S15  54.12 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0211534  normal  0.0449315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3445  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0394  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.259337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0060  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.624309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3219  30S ribosomal protein S15  54.12 
 
 		 90 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.962482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1897  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.320723  normal  0.937445 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2220  30S ribosomal protein S15  50.55 
 
 		 89 aa  91.7  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3907  30S ribosomal protein S15  51.11 
 
 		 89 aa  91.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0558  30S ribosomal protein S15  49.45 
 
 		 89 aa  91.3  4e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.576278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07890  ribosomal protein S15  57.95 
 
 		 88 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1663  30S ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.1386  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0940  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0040  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.431761  normal  0.280394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2437  30S ribosomal protein S15  52.75 
 
 		 89 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.39623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4063  30S ribosomal protein S15  53.85 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1835  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0743  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660742  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1292  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1429  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7877  ribosomal protein S15  54.95 
 
 		 89 aa  90.9  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570046  hitchhiker  0.00894754 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0407  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1055  30S ribosomal protein S15  51.65 
 
 		 89 aa  90.5  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00453834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>