67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0110 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  100 
 
 		 248 aa  511  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  87.19 
 
 		 245 aa  451  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  54.89 
 
 		 242 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  54.89 
 
 		 242 aa  272  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  54.89 
 
 		 242 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  47.28 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  50.86 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  45.61 
 
 		 250 aa  225  4e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  46.41 
 
 		 572 aa  159  5e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  35.05 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  35.05 
 
 		 217 aa  124  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  33.17 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  34.5 
 
 		 223 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  34.15 
 
 		 219 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  32.7 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  32.54 
 
 		 227 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  31.3 
 
 		 223 aa  99.8  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  31.4 
 
 		 217 aa  99.4  5e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  31.39 
 
 		 245 aa  98.6  7e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  29.88 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  26.25 
 
 		 244 aa  95.1  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  30.09 
 
 		 213 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  32.88 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  32.37 
 
 		 242 aa  92.8  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  30.77 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.73 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  28 
 
 		 274 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  28.57 
 
 		 221 aa  90.5  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  31.37 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  29.21 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.11 
 
 		 196 aa  87.8  1e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  27.05 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  31.68 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  27.64 
 
 		 223 aa  86.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  30.77 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  31.66 
 
 		 223 aa  86.7  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  27.83 
 
 		 231 aa  86.3  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  28.29 
 
 		 240 aa  85.5  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  28.5 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  28.22 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  29.86 
 
 		 229 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  29.56 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  27.78 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.21 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  24.76 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  30.7 
 
 		 241 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  30.66 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  22.27 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  25.12 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  23.33 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  23.33 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  23.33 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  26.79 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  27.69 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  25.84 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  28.85 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  29.85 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.56 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  26.13 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  26.15 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  26.32 
 
 		 258 aa  52  0.000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1999  hypothetical protein  38.33 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  19.82 
 
 		 652 aa  45.4  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  26.32 
 
 		 201 aa  43.5  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02960  cytoplasm protein, putative  27.78 
 
 		 669 aa  42.7  0.006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0491922  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  26.32 
 
 		 201 aa  42  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.970916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>