22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1073 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1073  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  100 
 
 
223 aa  444  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  29.23 
 
 
245 aa  62.4  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  29.56 
 
 
248 aa  58.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  31.43 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  29.26 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  24.47 
 
 
250 aa  52.8  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  24.47 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  25.6 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  29.1 
 
 
240 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  27.51 
 
 
223 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  29.74 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  26.4 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  31.61 
 
 
223 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.7 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  25.55 
 
 
242 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  25.55 
 
 
242 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  25.64 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  30.56 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  24.46 
 
 
219 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.3 
 
 
228 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  29.53 
 
 
222 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  30.71 
 
 
226 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>