More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0032 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0032  tryptophanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
329 aa  691  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2336  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.22 
 
 
329 aa  509  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2825  tryptophanyl-tRNA synthetase  74.38 
 
 
329 aa  505  1e-142  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3607  tryptophanyl-tRNA synthetase  69.57 
 
 
329 aa  473  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0765  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 
330 aa  414  1e-115  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.664559  normal  0.580666 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1833  tryptophanyl-tRNA synthetase  58.07 
 
 
327 aa  387  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.985699  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0682  tryptophanyl-tRNA synthetase  54.71 
 
 
330 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.415308  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2250  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
327 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.68792e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0686  tryptophanyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
329 aa  381  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2298  tryptophanyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 
327 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1687  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.17 
 
 
326 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0957395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1925  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
327 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1882  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
328 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0014344  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3860  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.08 
 
 
359 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.968888  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2757  tryptophanyl-tRNA synthetase  56 
 
 
329 aa  365  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  5.06928e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1960  tryptophanyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
328 aa  366  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  5.35382e-07  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0775  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.23 
 
 
329 aa  356  3e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0443  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
328 aa  354  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0428  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.99 
 
 
328 aa  354  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2260  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
330 aa  351  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2171  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.76 
 
 
331 aa  348  6e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.44803  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1685  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.44 
 
 
331 aa  348  7e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3426  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.29 
 
 
326 aa  347  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1201  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.5 
 
 
327 aa  348  1e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0887  tryptophanyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 
327 aa  346  2e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.512903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1469  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.7 
 
 
329 aa  339  3e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2119  tryptophanyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 
332 aa  337  2e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926064  normal  0.0320454 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0320  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.08 
 
 
331 aa  336  3e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0792  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 
325 aa  335  4e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1300  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 
324 aa  333  2e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1133  tryptophanyl-tRNA synthetase  51.21 
 
 
330 aa  331  1e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.698787  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1038  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.49 
 
 
405 aa  323  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.548207  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0352  tryptophanyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 
325 aa  323  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2236  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
340 aa  300  3e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.139935  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2482  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.02 
 
 
340 aa  295  5e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1919  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.65 
 
 
337 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00690514  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2090  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.97 
 
 
342 aa  293  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.679306  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0072  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 
354 aa  293  3e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2877  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 
348 aa  291  7e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2700  tryptophanyl-tRNA synthetase  47.16 
 
 
340 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1224  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
373 aa  289  4e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.142423  normal  0.402373 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2485  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.78 
 
 
340 aa  288  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08970  Tryptophanyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
333 aa  287  2e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1154  tryptophanyl-tRNA synthetase  46.77 
 
 
323 aa  280  3e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0142  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 
327 aa  272  7e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1343  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
323 aa  271  8e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163691  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1125  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
323 aa  271  9e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0672  tryptophan--tRNA ligase  42.42 
 
 
331 aa  267  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0240521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1602  tryptophanyl-tRNA synthetase  45.15 
 
 
333 aa  261  8e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.598858  normal  0.880818 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3480  tryptophanyl-tRNA synthetase  42.46 
 
 
331 aa  258  9e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  6.74679e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2157  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 
335 aa  258  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108936 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0037  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.05 
 
 
330 aa  255  8e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1456  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 
335 aa  255  9e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.256847  normal  0.958171 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0450  tryptophanyl-tRNA synthetase II  42.9 
 
 
342 aa  250  3e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.481954 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0385  tryptophanyl-tRNA synthetase  37.59 
 
 
391 aa  246  3e-64  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.431815  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1726  tryptophanyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 
406 aa  245  7e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1159  tryptophanyl-tRNA synthetase  65.48 
 
 
404 aa  241  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0201  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.9 
 
 
346 aa  240  2e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.231145 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1145  tryptophanyl-tRNA synthetase  41.46 
 
 
352 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  7.61726e-06 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0204  tryptophanyl-tRNA synthetase II  39.63 
 
 
340 aa  239  6e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0005  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.84 
 
 
351 aa  239  6e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1429  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
400 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2459  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.02 
 
 
400 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915849  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1837  tryptophanyl-tRNA synthetase  43.14 
 
 
404 aa  236  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.394357  normal  0.603848 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0058  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.72 
 
 
341 aa  236  5e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00653714  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2528  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.8 
 
 
346 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5980  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  2e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.107124  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2014  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.58 
 
 
405 aa  234  2e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00685202  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1583  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  234  2e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.527529  normal  0.529268 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0956  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.49 
 
 
346 aa  234  2e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2134  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  2e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1177  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.63 
 
 
400 aa  234  2e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  3.48346e-06 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2097  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  2e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1609  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.49 
 
 
346 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0267  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.49 
 
 
346 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2670  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.49 
 
 
346 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.552159  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1413  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.49 
 
 
346 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.718903  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2115  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00181226 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1597  tryptophanyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 
404 aa  233  3e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5403  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289912  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0230  tryptophanyl-tRNA synthetase II  40.49 
 
 
346 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1904  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  3e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2550  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00499882  normal  0.111326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1680  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  4e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.544279  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3135  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  4e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.539368  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2621  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  4e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2182  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  4e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2567  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  4e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.83961  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1455  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  4e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2701  tryptophanyl-tRNA synthetase  52.19 
 
 
400 aa  233  4e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1399  tryptophanyl-tRNA synthetase  61.9 
 
 
404 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2085  tryptophanyl-tRNA synthetase  39.57 
 
 
327 aa  230  2e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0845  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
400 aa  231  2e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0034  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
356 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2145  tryptophanyl-tRNA synthetase  38.81 
 
 
356 aa  231  2e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1081  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
400 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.785266  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0720  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.69 
 
 
404 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0584  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.45 
 
 
405 aa  230  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118419  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1143  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
400 aa  229  4e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.422783  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0985  tryptophanyl-tRNA synthetase  60.67 
 
 
400 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.103287 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>